; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G11420 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G11420
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationChr2:11687135..11687417
RNA-Seq ExpressionCSPI02G11420
SyntenyCSPI02G11420
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA8546499.1 hypothetical protein F0562_002762 [Nyssa sinensis]3.2e-1577.55Show/hide
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        G + DD + CPRGHWRPAEDEKLRQLV+Q+GPQNWN +AEKLQGRSG S
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KAE8651846.1 hypothetical protein Csa_006140 [Cucumis sativus]3.0e-2198.04Show/hide
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KAF3445579.1 hypothetical protein FNV43_RR10755 [Rhamnella rubrinervis]1.9e-1580Show/hide
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        AG   DD KSCPRGHWRPAEDEKLRQLV+Q+G QNWN +AEKLQGRSG S
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KAG6592163.1 Transcription factor CSA, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-1578Show/hide
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        A  +GDD KSCPRGHWRP EDEKLR+LV+Q+G QNWNF+AEKLQGRSG S
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XP_022936691.1 transcription factor MYB117-like [Cucurbita moschata]1.9e-1578Show/hide
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        A  +GDD KSCPRGHWRP EDEKLR+LV+Q+G QNWNF+AEKLQGRSG S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LIG5 HTH myb-type domain-containing protein3.6e-28100Show/hide
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A0A5B7BQ73 Putative trichome differentiation protein GL11.2e-1577.55Show/hide
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        G + DD ++CPRGHWRPAEDEKLRQLV+Q+GPQNWN +AEKLQGRSG S
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A0A5J5BU44 Uncharacterized protein1.6e-1577.55Show/hide
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        G + DD + CPRGHWRPAEDEKLRQLV+Q+GPQNWN +AEKLQGRSG S
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A0A6G7PT78 MYB transcription factor1.6e-1579.59Show/hide
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        G   DD K+CPRGHWRPAEDEKLRQLV+Q+GPQNWN +AEKLQGRSG S
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A0A6J1F870 transcription factor MYB117-like9.1e-1678Show/hide
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        A  +GDD KSCPRGHWRP EDEKLR+LV+Q+G QNWNF+AEKLQGRSG S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5NBM8 Transcription factor CSA7.0e-1369.39Show/hide
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        GV G   K C RGHWRPAED KL+ LV Q+GPQNWN +AEKL GRSG S
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Q6R053 Transcription factor MYB565.9e-1258.82Show/hide
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        M G +G + K C RGHWRP ED KL++LV Q GPQNWN ++  L GRSG S
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Q6R0C4 Transcription factor MYB521.5e-1275Show/hide
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        C RGHWRPAEDEKLR+LV+Q GP NWN +A+KL GRSG S
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Q9FX36 Transcription factor MYB541.3e-1172.5Show/hide
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        C RGHWRPAEDEKL+ LV+Q+GP NWN +A KL GRSG S
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Q9SEZ4 Transcription factor MYB1051.0e-1173.17Show/hide
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        S  RGHWRPAED KL++LV  +GPQNWN +AEKLQGRSG S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17950.1 myb domain protein 521.1e-1375Show/hide
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        C RGHWRPAEDEKLR+LV+Q GP NWN +A+KL GRSG S
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AT1G69560.1 myb domain protein 1057.1e-1373.17Show/hide
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        S  RGHWRPAED KL++LV  +GPQNWN +AEKLQGRSG S
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AT1G73410.1 myb domain protein 549.3e-1372.5Show/hide
Query:  CPRGHWRPAEDEKLRQLVQQHGPQNWNFVAEKLQGRSGIS
        C RGHWRPAEDEKL+ LV+Q+GP NWN +A KL GRSG S
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AT4G33450.1 myb domain protein 691.1e-1370.73Show/hide
Query:  SCPRGHWRPAEDEKLRQLVQQHGPQNWNFVAEKLQGRSGIS
        SC RGHWRP ED+ LRQLV+Q+GP+NWNF+A+ L GRSG S
Subjt:  SCPRGHWRPAEDEKLRQLVQQHGPQNWNFVAEKLQGRSGIS
AT5G17800.1 myb domain protein 564.2e-1358.82Show/hide
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        M G +G + K C RGHWRP ED KL++LV Q GPQNWN ++  L GRSG S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGGGTTGCAGGGGATGATGTGAAGTCGTGTCCTCGGGGACATTGGCGTCCAGCCGAGGACGAGAAGCTCCGACAGTTAGTTCAGCAGCATGGCCCGCAAAACTG
GAATTTTGTTGCAGAAAAACTACAAGGAAGATCAGGCATATCTCTTTTTGTAGTATCATTTGACAAGTTTTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACAACCTCTATCAGTTTTTCTTATTCAGTTAATAATCTTTCTCTACTTTCCTTTTTCCTCTGTATAAATTACTCTCCACACCAAACCTTGGGGTTATGGCTGGGGTTG
CAGGGGATGATGTGAAGTCGTGTCCTCGGGGACATTGGCGTCCAGCCGAGGACGAGAAGCTCCGACAGTTAGTTCAGCAGCATGGCCCGCAAAACTGGAATTTTGTTGCA
GAAAAACTACAAGGAAGATCAGGCATATCTCTTTTTGTAGTATCATTTGACAAGTTTTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGVAGDDVKSCPRGHWRPAEDEKLRQLVQQHGPQNWNFVAEKLQGRSGISLFVVSFDKFL