; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G11680 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G11680
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr2:12007500..12008045
RNA-Seq ExpressionCSPI02G11680
SyntenyCSPI02G11680
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039384.1 hypothetical protein E6C27_scaffold64G001870 [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-1356.12Show/hide
Query:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYI-VIAINGDNVPQADDMNHAENED
        IAI Q TN L+H VA VS  NNNQL +AF +SV+  A+A LAT+ASNNVI  + NT +ASLAMAA  LAA  S+I   A+NG N  Q DD+N A +++
Subjt:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYI-VIAINGDNVPQADDMNHAENED
KAE8651857.1 hypothetical protein Csa_023625, partial [Cucumis sativus]1.4e-3598.85Show/hide
Query:  IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
        IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASL MAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
Subjt:  IVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLKMC
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKZ8 Uncharacterized protein4.4e-4399.02Show/hide
Query:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLK
        IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASL MAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLK
Subjt:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAENEDATLK

Query:  MC
        MC
Subjt:  MC
A0A5A7T7D4 Uncharacterized protein1.3e-1356.12Show/hide
Query:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYI-VIAINGDNVPQADDMNHAENED
        IAI Q TN L+H VA VS  NNNQL +AF +SV+  A+A LAT+ASNNVI  + NT +ASLAMAA  LAA  S+I   A+NG N  Q DD+N A +++
Subjt:  IAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAF-ASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYI-VIAINGDNVPQADDMNHAENED
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTATCCATAAATGGATTGAACGAAAAAGCAAAGCCAAAAGAAAGTATAGCAATTGTTCAAGTCACAAACGTCCTTATCCATGTTGTAGCAATCGTATCTTATGCAAA
CAACAATCAACTAGGTAATGCTTTTGCATCTGTGAAAACGGGTGCTAATGCTGGGCTTGCCACTAAGGCTTCCAACAATGTAATTGTTGTTATGTCTAACACCGTCAATG
CCTCTCTTGCGATGGCTGCAACATTGCTTGCTGCAACAATTTCCTATATTGTCATAGCAATTAACGGTGATAATGTCCCTCAAGCTGATGATATGAATCATGCTGAGAAT
GAAGATGCTACTCTCAAGATGTGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTATCCATAAATGGATTGAACGAAAAAGCAAAGCCAAAAGAAAGTATAGCAATTGTTCAAGTCACAAACGTCCTTATCCATGTTGTAGCAATCGTATCTTATGCAAA
CAACAATCAACTAGGTAATGCTTTTGCATCTGTGAAAACGGGTGCTAATGCTGGGCTTGCCACTAAGGCTTCCAACAATGTAATTGTTGTTATGTCTAACACCGTCAATG
CCTCTCTTGCGATGGCTGCAACATTGCTTGCTGCAACAATTTCCTATATTGTCATAGCAATTAACGGTGATAATGTCCCTCAAGCTGATGATATGAATCATGCTGAGAAT
GAAGATGCTACTCTCAAGATGTGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLSINGLNEKAKPKESIAIVQVTNVLIHVVAIVSYANNNQLGNAFASVKTGANAGLATKASNNVIVVMSNTVNASLAMAATLLAATISYIVIAINGDNVPQADDMNHAEN
EDATLKMC