; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G12470 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G12470
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationChr2:12714686..12719338
RNA-Seq ExpressionCSPI02G12470
SyntenyCSPI02G12470
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein2.1e-9848.89Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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AGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTC
ATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTTGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCTGGGCATCACCTGTTGCGTCAAGTGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTCCCAGGATTCCCCTATTGCCCTAACGTCCTTAATTCTACCGTTTAGAACAACCCCTCCCTTCCCTTCCCTCCCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCTTCACTCCT
TTCTGTATTGTGAAGAAAACCCAGCGCTTCACCCTTTCCCCTTCATTTCTCCCTCTAAAACCCTCTCTCTTTCTCTCCCTCTCTCTCCTCTTTTCAGCTTCAGTTCTACC
TCTCTGAAAGACAGAATACAGTTAGGTGTTTTCTTGAGAGGCATGGTGCTGGGGTTATTCTCAGAGTTCTAATTTGGACGGCTTCAGCAACTTTTCTGGCGAAGTTATAA
AACTCAAAATCTTGGTCTTTCGCCGGCATGGGATCTGCGTGTTGCGTTGCTGCTAGGGACAAGACTATAGTAAGTGGATCTGGAAGTGAAACCTTATGTAGGAATATTAG
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ACTCTTAGCTCAGGTCAATCAAATTCTAGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAA
ATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTCATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTTGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTC
CTGGGCATCACCTGTTGCGTCAAGTGTCTGACAGCCGAATCCGAGGATTAAAATCACCAAGCAGCTATTTAGCTTCAGAAGATAGACCAAGGCTTCCCTCTTGGAGCAAT
GAATCGGTCCGGGACTCACATGGAGGGTCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACTC
GTTTGGCTTCAACGGTGAGAAAATAGCCAGATCTAATAGTCAGATCTCAACTTCCTCAGTCGATTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCAAAGCTGCTGACCGAGAAATCCT
CATGGAGTAGCCAAAGGATTATTGCGAACAATGAACTTTCTGTTGCTGCTGTCCTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCTGATTGCTTGGAGAGTATGACGCCCGAGATT
CACAAGTACGATCCTGCTTGTCCTGTTTGTACCTTCGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCGCTCAAAGCCGAAATAGACTGGAAAAGTCTATACAAGAG
ATCCAAAAAGTGTATTGCAGATAGCGATTTTGATGGCGGTTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAACAATGCACGTCTGGAAAGGGGATCAAAATTGTCAGCCAGTTCTA
GCATGAGAAGCTCCTCAGGAAAGCCGTTCTTGAAACGCCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCCAGAGTGATGTCTGATAATCCCCCAACAAGAAGGAAAGGATTC
TTCTGGGCAAAATCCAGCAAAGTATGATAGATTCTAACGGTCCCTCCACGTCATGTCAGGAAGTTGTGTTTCATGAAACAAGGGAACTATCGACTTCTGTGCCTCGTCAA
TGGAAACGTGGCCATAAGAAATACAGTTGTGTTCCCACGTCCATTGCAGCCATTGAAATGTGCTGCTCACTCAAAACCCAGGTGCCTTCCACAAAATTGTTTGTAGTCTT
GAAAAGTTTCATGAAACAAGGAATTGTCAGTCAACTTCATAACTCCAATTTAAAATGTCTGTATACATATCAAAGATATGATATATAAATGTTATTTGAGTTGAAATTCT
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TTTCTCGTCACAAGCATGTTACTAAAACATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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