| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6571306.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 6.3e-199 | 93.58 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ---GGGGGGGGYGAYNAYIS
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVE+LMA+THELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGGGYGAYNAYIS
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ---GGGGGGGGYGAYNAYIS
Query: AATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQV
AATRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQV
Subjt: AATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQV
Query: AIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
AIDSATPLDD AGAGA+GASG+FMMNSAA+SFGGY GPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSR DWRYRPY
Subjt: AIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| XP_008457826.1 PREDICTED: RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Cucumis melo] | 2.4e-206 | 97.57 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| XP_011649346.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.3e-209 | 98.38 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPK DDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| XP_022932294.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0-like [Cucurbita moschata] | 4.1e-198 | 92.82 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-----GGGGGGGGYGAYNAY
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVE+LMA+THELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGGGYGAY+AY
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-----GGGGGGGGYGAYNAY
Query: ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
ISAATRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
Subjt: ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
Query: QVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
QVAIDSATPLDD AGAGA+GASG+FMMNSAA+SFGGY GPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSR DWRYRPY
Subjt: QVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| XP_038877270.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Benincasa hispida] | 4.9e-204 | 96.23 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTEGLR+YMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE RGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGAGAGA+GASGTFMMNSAA+SFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LMN9 Uncharacterized protein | 6.5e-210 | 98.38 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPK DDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| A0A1S3C728 RNA-binding protein Musashi homolog 1 | 1.1e-206 | 97.57 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| A0A6J1D811 RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X2 | 1.7e-194 | 92.74 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWD+DTEGL++YMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVENLMA+THELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKM Q G GGGYGAYNAYISAAT
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGGGGGYGAYNAYISAAT
Query: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
RYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE RGMGKKIFVGRLPQEAS+DDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Subjt: RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAID
Query: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGY-VGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
SATPLDDAGA GA GASG+FMMNSAA+SFGGY GPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
Subjt: SATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGY-VGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| A0A6J1EWL0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0-like | 2.0e-198 | 92.82 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWDVDTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-----GGGGGGGGYGAYNAY
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVE+LMA+THELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGGGYGAY+AY
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-----GGGGGGGGYGAYNAY
Query: ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
ISAATRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
Subjt: ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQ
Query: QVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
QVAIDSATPLDD AGAGA+GASG+FMMNSAA+SFGGY GPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSR DWRYRPY
Subjt: QVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| A0A6J1I7Z8 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like-B isoform X1 | 3.4e-198 | 93.28 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWD+DTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ+VTEAA
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGGYGAYNAYISAA
FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASS+SVE+LMA+THELGGS VVVDRATPK DDDFRPIGKMPQ GGGGGGGGYGAYNAYISAA
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGGYGAYNAYISAA
Query: TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAI
TRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRS HRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAI
Subjt: TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEICGQQVAI
Query: DSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
DSATPLDD AGAGA+GASG+FMMNSAA+SFGGY GPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSR DWRYRPY
Subjt: DSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O43347 RNA-binding protein Musashi homolog 1 | 3.9e-26 | 35.78 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
G+ W EGLREY +FGE+++C+VM++ T RSRGFG+VTF L+ S H L ++ ++ KVA P+ RA PK VTR IFV +S T
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
Query: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
+ +FE++G++ D + D+ + HRG GF+TF S D VE + HE+ V +A PK + MP G G G GY +
Subjt: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
Query: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
A A+ Y L PG Y EFR
Subjt: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
|
|
| O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.15 | 1.3e-26 | 35.5 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAAFR
G+ W+ + LR+Y +FGE+ DC VM++ +TGRSRGFG++TF + +S EH L ++++ K A P+EE ++ ++FV + TE FR
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAAFR
Query: SHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTH-ELGGSNVVVDRATPKARI-EHHD
+ F ++G + D + D+ + RG GF+T+ + +VE M+ + + G V V RATPKA + + HD
Subjt: SHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTH-ELGGSNVVVDRATPKARI-EHHD
|
|
| Q61474 RNA-binding protein Musashi homolog 1 | 5.1e-26 | 35.78 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
G+ W EGLREY +FGE+++C+VM++ T RSRGFG+VTF L+ S H L ++ ++ KVA P+ RA PK VTR IFV +S T
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
Query: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
+ +FE++G++ D + D+ + HRG GF+TF S D VE + HE+ V +A PK + MP G G G GY +
Subjt: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
Query: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
A A+ Y L PG Y EFR
Subjt: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
|
|
| Q8K3P4 RNA-binding protein Musashi homolog 1 | 5.1e-26 | 35.78 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
G+ W EGLREY +FGE+++C+VM++ T RSRGFG+VTF L+ S H L ++ ++ KVA P+ RA PK VTR IFV +S T
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARISQTVTE
Query: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
+ +FE++G++ D + D+ + HRG GF+TF S D VE + HE+ V +A PK + MP G G G GY +
Subjt: AAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGG-----GGGGGGYGAY
Query: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
A A+ Y L PG Y EFR
Subjt: NAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
|
|
| Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 2.1e-27 | 27.34 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPK----------------RVTR
GI W+ D + LRE+ + +GE+ IVM+++ TGR RGFG+V F+ L +H + R ++VK A +EE + + + +
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPK----------------RVTR
Query: IFVARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGG
IFV + T+T+ FR +FE YG +TD+ + DQ + RG GF++F S D+V++++ T H+L G V V RA PK D P G GGGG
Subjt: IFVARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQGGGGG
Query: GGGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRV
GGY Y + ++ + + H G + G G A Y G G G+G G
Subjt: GGGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRV
Query: SRRSHEICGQQVAIDSATPLDDAGA---GAGASGASGTFMMNSAADS----FGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPS
+ P +GA G G GA+ S + +GGY G YG + YG+ GGRPS
Subjt: SRRSHEICGQQVAIDSATPLDDAGA---GAGASGASGTFMMNSAADS----FGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.4e-31 | 37.71 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKRVTRIF
GI WD + E L+EY S FGE+ + +++K+R+TGR+RGFG+V FA A+ ++ +H + R++E K A P+++ P R +IF
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKRVTRIF
Query: VARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
V + +VTE+ F+++FE++G TD+ + D ++ RG GFIT+ S ++VE ++ T HEL G V V RA PK
Subjt: VARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
|
|
| AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.4e-31 | 37.71 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKRVTRIF
GI WD + E L+EY S FGE+ + +++K+R+TGR+RGFG+V FA A+ ++ +H + R++E K A P+++ P R +IF
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKRVTRIF
Query: VARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
V + +VTE+ F+++FE++G TD+ + D ++ RG GFIT+ S ++VE ++ T HEL G V V RA PK
Subjt: VARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
|
|
| AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-30 | 36.67 | Show/hide |
Query: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR-----APP--------------KR
GI WD D E L+EY K+G+L + ++M++R+TGR+RGFG++ FA A+ + +H + R +E K A P+++ + A P R
Subjt: GIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR-----APP--------------KR
Query: VTRIFVARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
+IFV + ++TEA F+++F+++G I D+ + D ++ RG GFITF S +SV+ ++ T HEL G V V RA PK
Subjt: VTRIFVARISQTVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSNVVVDRATPK
|
|
| AT4G36960.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.3e-156 | 71.77 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWD+D++GL++YMSKFG+LEDCIVMK+RSTGRSRGFGYVTFA+ EDAKNAL EHFLGNR++EVKVATPKEEMR P K+VTRIFVARI +V+E+
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGGYGAYNA
FRSHFE+YGEITDLYMPKD SK HRGIGFITF+S+DSVE+LM DTH+LGG+ V VDRATPK + H P+ +M + GG G GGYGAY+A
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGGYGAYNA
Query: YISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEI
YISAATRYAALGAPTLYD+P + YGR E RG+G KIFVGRLPQEAS DDLR YFGRFG I D Y+PKDPKRSGHRGFGFVTFAE+GVADRV+RRSHEI
Subjt: YISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEI
Query: CGQQVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
CGQ+VAIDSATPLD+AG AGAS + + +S + FGGY GPMR +GRMYG + DDWGYG+ RPSR D RYRPY
Subjt: CGQQVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
| AT4G36960.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.3e-156 | 71.77 | Show/hide |
Query: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
VLGIPWD+D++GL++YMSKFG+LEDCIVMK+RSTGRSRGFGYVTFA+ EDAKNAL EHFLGNR++EVKVATPKEEMR P K+VTRIFVARI +V+E+
Subjt: VLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQTVTEAA
Query: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGGYGAYNA
FRSHFE+YGEITDLYMPKD SK HRGIGFITF+S+DSVE+LM DTH+LGG+ V VDRATPK + H P+ +M + GG G GGYGAY+A
Subjt: FRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSNVVVDRATPKARIEHHDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGGYGAYNA
Query: YISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEI
YISAATRYAALGAPTLYD+P + YGR E RG+G KIFVGRLPQEAS DDLR YFGRFG I D Y+PKDPKRSGHRGFGFVTFAE+GVADRV+RRSHEI
Subjt: YISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKIFVGRLPQEASADDLRQYFGRFGRILDVYVPKDPKRSGHRGFGFVTFAEDGVADRVSRRSHEI
Query: CGQQVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
CGQ+VAIDSATPLD+AG AGAS + + +S + FGGY GPMR +GRMYG + DDWGYG+ RPSR D RYRPY
Subjt: CGQQVAIDSATPLDDAGAGAGASGASGTFMMNSAADSFGGYVGPMRTYGRMYGSLDFDDWGYGIGGGRPSRADWRYRPY
|
|
