; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G15780 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G15780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationChr2:15279345..15280648
RNA-Seq ExpressionCSPI02G15780
SyntenyCSPI02G15780
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0040758.1 transcriptional activator Myb [Cucumis melo var. makuwa]5.1e-11398.1Show/hide
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KAG6571346.1 Transcription factor MYB52, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-8879.64Show/hide
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XP_004147366.1 transcription factor MYB52 [Cucumis sativus]1.9e-115100Show/hide
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XP_008460890.2 PREDICTED: transcriptional activator Myb [Cucumis melo]2.5e-11298.09Show/hide
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XP_038902736.1 transcription factor MYB52-like [Benincasa hispida]4.8e-10391.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LM98 Uncharacterized protein9.1e-116100Show/hide
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A0A1S3CEN7 transcriptional activator Myb1.2e-11298.09Show/hide
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A0A5D3BQW6 Transcriptional activator Myb2.5e-11398.1Show/hide
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A0A6J1EVU5 transcription factor CSA-like1.5e-8679.09Show/hide
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A0A6J1I2H4 transcription factor CSA-like5.7e-8678.64Show/hide
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        E ED KRR+PFIDFLGMGSS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5NBM8 Transcription factor CSA1.5e-4364.62Show/hide
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        G GGG  G  C RGHWRPAED KL+ LV Q+GPQNWN IAE  +GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+  F+EEEEERL+   + +GNKWALIAR F GRTDN
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        AVKNH+HV+MARR RE+   F     ++++
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Q6R053 Transcription factor MYB568.3e-4270.43Show/hide
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        G SG++   C RGHWRP ED KL++LV QFGPQNWN I+ H  GRSGKSCRLRW+NQLDP INK  F+EEEE RLL   + +GNKWALI+R F GRTDNA
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        VKNH+HVIMARR RE
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Q6R0C4 Transcription factor MYB529.5e-4676.64Show/hide
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        C RGHWRPAED KLR+LVEQFGP NWN IA+   GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+NPF+EEEEERLL   ++HGN+W++IAR F GRTDNAVKNH+HVIM
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Query:  ARRRRER
        ARR RER
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Q9FX36 Transcription factor MYB541.5e-4372.22Show/hide
Query:  VSCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVKNHYHV
        + C RGHWRPAED KL+ LVEQ+GP NWN IA    GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+NPF+EEEEERLL   ++HGN+W++IAR F GRTDNAVKNH+HV
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Query:  IMARRRRE
        IMARR R+
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Q9SEZ4 Transcription factor MYB1051.1e-4169.3Show/hide
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        G SS  S  RGHWRPAED KL++LV  +GPQNWN IAE  +GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+  F+EEEEERL+   +L+GNKWA+IAR F GRTDN+VK
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Query:  NHYHVIMARRRRER
        NH+HVIMAR+ RE+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17950.1 myb domain protein 526.8e-4776.64Show/hide
Query:  CYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVKNHYHVIM
        C RGHWRPAED KLR+LVEQFGP NWN IA+   GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+NPF+EEEEERLL   ++HGN+W++IAR F GRTDNAVKNH+HVIM
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Query:  ARRRRER
        ARR RER
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AT1G69560.1 myb domain protein 1057.7e-4369.3Show/hide
Query:  GGSSGVSCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVK
        G SS  S  RGHWRPAED KL++LV  +GPQNWN IAE  +GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+  F+EEEEERL+   +L+GNKWA+IAR F GRTDN+VK
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Query:  NHYHVIMARRRRER
        NH+HVIMAR+ RE+
Subjt:  NHYHVIMARRRRER

AT1G73410.1 myb domain protein 541.1e-4472.22Show/hide
Query:  VSCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVKNHYHV
        + C RGHWRPAED KL+ LVEQ+GP NWN IA    GRSGKSCRLRW+NQLDP IN+NPF+EEEEERLL   ++HGN+W++IAR F GRTDNAVKNH+HV
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Query:  IMARRRRE
        IMARR R+
Subjt:  IMARRRRE

AT4G33450.1 myb domain protein 692.3e-4766.67Show/hide
Query:  SCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVKNHYHVI
        SC RGHWRP ED+ LRQLVEQ+GP+NWN+IA+H  GRSGKSCRLRWYNQLDPNI K PF+EEEEERLL   ++ GN+WA IAR F GRTDNAVKNH+HVI
Subjt:  SCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNAVKNHYHVI

Query:  MARRRRERFTIFTNHNKNNNTIRHSLLSFSKT
        MARR+RE F+  +      N   H++LS S +
Subjt:  MARRRRERFTIFTNHNKNNNTIRHSLLSFSKT

AT5G17800.1 myb domain protein 565.9e-4370.43Show/hide
Query:  GSSGVS---CYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNA
        G SG++   C RGHWRP ED KL++LV QFGPQNWN I+ H  GRSGKSCRLRW+NQLDP INK  F+EEEE RLL   + +GNKWALI+R F GRTDNA
Subjt:  GSSGVS---CYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKGRTDNA

Query:  VKNHYHVIMARRRRE
        VKNH+HVIMARR RE
Subjt:  VKNHYHVIMARRRRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGAGATCAAAAAGTAGTAGTAGCAGTGGCGGCAGTAGCGGCGGTGGCGGTGGAAGCAGCGGTGTCAGCTGCTACCGAGGCCACTGGCGACCGGCGGAGGACAATAA
ACTCCGGCAGCTTGTTGAACAGTTTGGCCCTCAAAACTGGAATTACATTGCTGAACACTTTGAGGGCAGATCTGGAAAAAGTTGTAGATTGAGATGGTACAATCAATTAG
ATCCAAATATAAACAAGAACCCATTCAGTGAAGAAGAAGAAGAGAGACTTCTAATGTTTCAACAGCTTCATGGGAACAAATGGGCATTAATAGCAAGACATTTCAAAGGA
AGAACAGATAATGCAGTGAAGAATCATTACCATGTAATAATGGCTAGAAGAAGAAGAGAACGTTTCACAATATTCACTAACCACAACAAAAATAATAACACTATTCGACA
TAGCTTACTATCCTTTTCCAAGACGACGGCAGCCGTCAAATGGACTCCTCTTACAGCTGGGGCTCCGGTGCTGCTCGGAAATGGTCGTGGAAAGTCGTCTTTGCCAGCCG
TAGTGGCATCGGGATCCGGTGAGGGTGAGGATCACAAGAGAAGGATTCCATTCATAGACTTTCTTGGTATGGGAAGCTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCAAAATAAAATATGAAATAAGTTAAAGCTGTTTGTTTTCTTTGTGTTTTTCAAATCTCTCAAAACCCCATTTCACAATATTTTCATCTTCCTCAATAATAAACTTTTTC
TTTTTTAATCTCTCTTTTCCTCTTGAGCTAGGGTTTCTAAGTGTGTTTTTGGATTTTTGAGAATGATGAGATCAAAAAGTAGTAGTAGCAGTGGCGGCAGTAGCGGCGGT
GGCGGTGGAAGCAGCGGTGTCAGCTGCTACCGAGGCCACTGGCGACCGGCGGAGGACAATAAACTCCGGCAGCTTGTTGAACAGTTTGGCCCTCAAAACTGGAATTACAT
TGCTGAACACTTTGAGGGCAGATCTGGAAAAAGTTGTAGATTGAGATGGTACAATCAATTAGATCCAAATATAAACAAGAACCCATTCAGTGAAGAAGAAGAAGAGAGAC
TTCTAATGTTTCAACAGCTTCATGGGAACAAATGGGCATTAATAGCAAGACATTTCAAAGGAAGAACAGATAATGCAGTGAAGAATCATTACCATGTAATAATGGCTAGA
AGAAGAAGAGAACGTTTCACAATATTCACTAACCACAACAAAAATAATAACACTATTCGACATAGCTTACTATCCTTTTCCAAGACGACGGCAGCCGTCAAATGGACTCC
TCTTACAGCTGGGGCTCCGGTGCTGCTCGGAAATGGTCGTGGAAAGTCGTCTTTGCCAGCCGTAGTGGCATCGGGATCCGGTGAGGGTGAGGATCACAAGAGAAGGATTC
CATTCATAGACTTTCTTGGTATGGGAAGCTCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMRSKSSSSSGGSSGGGGGSSGVSCYRGHWRPAEDNKLRQLVEQFGPQNWNYIAEHFEGRSGKSCRLRWYNQLDPNINKNPFSEEEEERLLMFQQLHGNKWALIARHFKG
RTDNAVKNHYHVIMARRRRERFTIFTNHNKNNNTIRHSLLSFSKTTAAVKWTPLTAGAPVLLGNGRGKSSLPAVVASGSGEGEDHKRRIPFIDFLGMGSS