; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G16460 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G16460
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDNA-binding protein BIN4
Genome locationChr2:15857759..15858843
RNA-Seq ExpressionCSPI02G16460
SyntenyCSPI02G16460
Gene Ontology termsGO:0042023 - DNA endoreduplication (biological process)
GO:0009330 - DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR033246 - DNA-binding protein BIN4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK02024.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

XP_004147326.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X1 [Cucumis sativus]4.9e-4399.04Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

XP_008460818.1 PREDICTED: DNA-binding protein BIN4 isoform X4 [Cucumis melo]2.3e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

XP_031736566.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X2 [Cucumis sativus]4.9e-4399.04Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

XP_031736567.1 DNA-binding protein BIN4 isoform X3 [Cucumis sativus]4.9e-4399.04Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNA

Query:  KSKK
        KSKK
Subjt:  KSKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CDA8 DNA-binding protein BIN4 isoform X21.1e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

A0A1S3CDB0 DNA-binding protein BIN4 isoform X11.1e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

A0A1S3CEH7 DNA-binding protein BIN4 isoform X41.1e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

A0A1S4E3S5 DNA-binding protein BIN4 isoform X31.1e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

A0A5D3BS94 DNA-binding protein BIN4 isoform X21.1e-4095.24Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
        +IESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSED+AEKITK A+SPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVK+GGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKN

Query:  AKSKK
        AKSKK
Subjt:  AKSKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FLU1 DNA-binding protein BIN44.3e-1049.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G24630.1 double-stranded DNA binding3.1e-1149.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK

AT5G24630.2 double-stranded DNA binding3.1e-1149.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK

AT5G24630.3 double-stranded DNA binding3.1e-1149.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK

AT5G24630.4 double-stranded DNA binding3.1e-1149.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK

AT5G24630.5 double-stranded DNA binding3.1e-1149.09Show/hide
Query:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG
        +IE+IMNDFIQL   S V EAETMVEGTL+GF+F+S+D++ K  K A  PADQ+    E  NTK+K KA    E   G+KR +     Q P    KK + 
Subjt:  QIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITK-AASPADQNEPV-EGLNTKSKNKA----EKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQG

Query:  SKTKNAKSKK
        S  K  K+KK
Subjt:  SKTKNAKSKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTACTTGATCAGATAGAATCTATCATGAACGATTTCATTCAGTTGAAGGCACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGCACATTAGATGGATTCTC
GTTTGATTCTGAAGACGACGCTGAGAAAATAACTAAAGCTGCTTCTCCAGCTGACCAAAATGAGCCGGTAGAAGGGCTCAACACAAAATCCAAAAACAAAGCCGAGAAAT
CATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAGGCTGCAGGCTCCGAAGAAAACAAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAAACTAAAAATGCAAAAAGCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATTTTATATTAATGATAATATAGTACTGGAAATTTCTACTATCAATTCTGTTTTTGGATGGTCACTTCGTTTTAAATTTTAAGCACTCCCCTTTGTTTTGTTTTGGTTT
GCGTTATTTTTTTAGTACAATGTCCTAGAACTGCCATAGAAGTCATGACTTGTTGGACGTATGTTACTTGATCAGATAGAATCTATCATGAACGATTTCATTCAGTTGAA
GGCACTGTCCAAAGTTGATGAGGCTGAAACTATGGTTGAAGGCACATTAGATGGATTCTCGTTTGATTCTGAAGACGACGCTGAGAAAATAACTAAAGCTGCTTCTCCAG
CTGACCAAAATGAGCCGGTAGAAGGGCTCAACACAAAATCCAAAAACAAAGCCGAGAAATCATCAGGGCGGAAGCGTGTTAAAACTGGAGGAAGGCTGCAGGCTCCGAAG
AAAACAAGGAAGAAAGTTCAAGGTTCTAAAACTAAAAATGCAAAAAGCAAGAAATGAAGTTCGAAATCTTTGTTTGCCCTGAAAAGGGAAAGCCCTTTCGTCTGAATGTA
AGAGGCAAATGGGGGCTTTAGCCAACCTGCTTGAAACAACATTTTCTTTCTCCGGTTCACCTCTCTGACTAGAAGTTTAGAGCCTTTTTTATAAAGTTTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLDQIESIMNDFIQLKALSKVDEAETMVEGTLDGFSFDSEDDAEKITKAASPADQNEPVEGLNTKSKNKAEKSSGRKRVKTGGRLQAPKKTRKKVQGSKTKNAKSKK