; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G18310 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G18310
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationChr2:16974459..16976327
RNA-Seq ExpressionCSPI02G18310
SyntenyCSPI02G18310
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]6.2e-16992.38Show/hide
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XP_008444519.1 PREDICTED: transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo]5.3e-16892.08Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]3.1e-12890.67Show/hide
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XP_038885625.1 transcription factor bHLH74-like isoform X1 [Benincasa hispida]6.1e-13275.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein7.4e-18499.71Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X12.6e-16892.08Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X21.5e-12890.67Show/hide
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X13.0e-16992.38Show/hide
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        IKCPFSYVQILDDEEMVSPKND KS+PD V+ENQRKFV+GSNSSSPNKNAED+ NV PTEIL+KADKTQKVEHR+SANFNTK DSK+AKGGSQNVQ+PKE
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A0A6P6GAR5 transcription factor bHLH74 isoform X37.7e-4843.91Show/hide
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        F  S+  P++ +  S S   G SS     ELS       LEN+G+ + S+++  PS  SF         FG+G+FS+MVGSFG    A+ S IAN  CP 
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Query:  SYVQILDD-EEMVSP----KNDAKSRPD-----CVSENQRKFVLGSNSS-SPNKNAE----DDFNVEPTEIL-DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAK
         Y    +   E  SP     +D +   D       S  +RK  L S+S  SPNKNAE     D + E ++++ D  +K  K E   S N   K   K++K
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          S + +APKENYIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ E+IL  
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Query:  NNSYLSSSNVLCKRGEN--VNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSPST
              S ++L  RG N  +      I  + P+      GT PT+P T+   T
Subjt:  NNSYLSSSNVLCKRGEN--VNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSPST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NKN9 Transcription factor bHLH747.9e-3448.44Show/hide
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        NK A ++F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
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Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP
        K V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ ++IL        + ++L  R  N     +  +  +P   FQ  G  P +  TT+P
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP

Q9C670 Transcription factor bHLH761.6e-2656.2Show/hide
Query:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ
        ++ DK QK E   ++N N K +S+K     Q   + K+ YIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC ++TGK V+LDEIINYVQSLQ
Subjt:  DKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQ

Query:  QQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSS
         Q+EFLSMKL++V   L+ +LE+   LL  ++  SS+
Subjt:  QQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSS

Q9CAA9 Transcription factor bHLH494.5e-2946.33Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
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Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E +L
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Q9LK48 Transcription factor bHLH774.7e-2663.48Show/hide
Query:  SANFNTKPDSK-KAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLAS
        S N   K DSK   K  ++  +APK+ YIHV+ARRG+A ++HSLAER RREKISERM LLQ LVPGC++ITGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+
Subjt:  SANFNTKPDSK-KAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLAS

Query:  VGLESSLEAEQILLT
        V       A   L T
Subjt:  VGLESSLEAEQILLT

Q9SRT2 Transcription factor bHLH627.2e-2750.98Show/hide
Query:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L +  KT+  ++  SA  ++K        D K+ K   +N        P ++YIHV+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL+SV   L+ +++A   LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.6e-3548.44Show/hide
Query:  NKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG
        NK A ++F  +P    D++ K  K         N +      K  SQ+ +APKENYIH++ARRG+A N+HSLAERVRREKISERM+LLQ+LVPGC++ITG
Subjt:  NKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITG

Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP
        K V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ ++IL        + ++L  R  N     +  +  +P   FQ  G  P +  TT+P
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTPTMPRTTSP

AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.2e-3046.33Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.2e-3046.33Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG
        + ++   S  N  K R    +  +RK     NS +   +       EP    D     +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  RAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-3040.65Show/hide
Query:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---
        F +F  GNFSDMV          G F    G +     S   N+  P + V +   E  V     AK        VSE+        Q+     SN+   
Subjt:  FDMFGTGNFSDMV----------GSF----GFLTEADHSQIANIKCPFSYVQILDDEEMVSPKNDAKSR---PDCVSEN--------QRKFVLGSNS---

Query:  --SSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC
          +  N  A      + +E     +  +K     S N   K  +   + G Q+   PK+ YIHV+ARRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC
Subjt:  --SSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGC

Query:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL
        +++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E +L
Subjt:  HQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQIL

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.1e-2850.98Show/hide
Query:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV
        L +  KT+  ++  SA  ++K        D K+ K   +N        P ++YIHV+ARRG+A ++HSLAERVRREKISERMKLLQ LVPGC+++TGK +
Subjt:  LDKADKTQKVEHRLSANFNTK-------PDSKKAKGGSQNVQA-----PKENYIHVQARRGRAANNHSLAERVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL+SV   L+ +++A   LL+ + + SS+N++
Subjt:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVG--LESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAACAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACATTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAACTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCATAGCCAGATCGCCAATATTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAGTGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATGACTTTAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTGATAAAGCTGACAAAACACAGAAGGTTGAGCATCGATTGAGTGCAAATTTTAACACCAAACCAG
ATAGTAAAAAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCATGTTCAAGCGCGACGGGGGCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGAGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGTTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCCATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATTAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTGGAGTTTCTATCAATGAAACTCGCAAGTGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGGCAGAGCAGATTCTACTCACAAATAATTCATACC
TTTCGTCATCGAATGTTCTTTGTAAGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCCTAGATCAAGGATAATTCACACAAGTCCTCATGTCACGTTTCAACTTTATGGAACAACGCCA
ACCATGCCAAGAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTTCTACTTCTGGCTTTCAATGTGAAACAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTCTCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTTGG
ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACATTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAACTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAAGCTGATCATAGCCAGATCGCCAATATTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAGTGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATGACTTTAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTGATAAAGCTGACAAAACACAGAAGGTTGAGCATCGATTGAGTGCAAATTTTAACACCAAACCAG
ATAGTAAAAAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCATGTTCAAGCGCGACGGGGGCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
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ACCATGCCAAGAACTACATCTCCTTCAACTTTCTAACCGTTCAAGATGAAAGGATAACCAGTAGATGATCAAAATTATGCAGCTGCAAAAACCAGAGATGGATGTCAGCA
TTATCCTTTGATAGTCACTACATGTGCAGCAAATTAATTAAAGACAGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGSTSGFQCETMKCSFGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELSTASLENEGVKTISNILHDPSTLSFDMFGTGNFSDMVGSFGFLTEADHSQIANIKCPFSYVQI
LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVSENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDDFNVEPTEILDKADKTQKVEHRLSANFNTKPDSKKAKGGSQNVQAPKENYIHVQARRGRAANNHSLAE
RVRREKISERMKLLQQLVPGCHQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLEAEQILLTNNSYLSSSNVLCKRGENVNDPRSRIIHTSPHVTFQLYGTTP
TMPRTTSPSTF