; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G19920 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G19920
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr2:17850624..17851809
RNA-Seq ExpressionCSPI02G19920
SyntenyCSPI02G19920
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0065248.1 putative membrane protein [Cucumis melo var. makuwa]7.6e-15384.83Show/hide
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XP_008444699.1 PREDICTED: uncharacterized membrane protein At1g75140-like [Cucumis melo]1.5e-15385.05Show/hide
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XP_011649613.2 uncharacterized membrane protein At1g75140 [Cucumis sativus]2.0e-15385.31Show/hide
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XP_011649617.1 uncharacterized membrane protein At1g75140 [Cucumis sativus]1.6e-17999.69Show/hide
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XP_038885660.1 uncharacterized membrane protein At1g75140-like [Benincasa hispida]7.9e-15083.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNK9 Uncharacterized protein9.7e-15485.31Show/hide
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A0A0A0LNL2 Uncharacterized protein7.9e-18099.69Show/hide
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A0A1S3BAX2 uncharacterized membrane protein At1g75140-like7.5e-15485.05Show/hide
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A0A5A7VC92 Putative membrane protein3.7e-15384.83Show/hide
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A0A6J1GHT9 uncharacterized membrane protein At1g75140-like isoform X11.9e-14982.55Show/hide
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         LFSA LDEI+SSFLNYQN+D ES   F+PLISSD EKLVVLGLG GYVG+Y+SNLPIF+GEFN+ +WTSPVLFF LFLFGAWHFF+KKKEA TSWGPD+
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        PF+ATSPT+ AP+GT S+ R+SF D PSRSTDMMD+R GGGGLRGPPRRYGSPT YP GAT+SFRPATT++H+S  +A+DPNYRAASELKFRGSPLEPPG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FRK5 Uncharacterized membrane protein At1g751401.5e-9556.7Show/hide
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        MK+RESECEGLNHSLA SYVFDA+ER+KAYGFTS+G++IHVLLLGDIMNFKCRVRSK+K+++ +P+  Q IKGYLL+ + EKV V+NVS+QHYVR   PR
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        LLF AAL++I+S+FL+++     ++        PLI+SDREKL+V+GLG+GYV  Y+S LPI + EFN+ +W+SPV FF LFLFGAWHFFSKKKE+ T+W
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Query:  GPDEPFSATSPTSVAPMGTVSNNRSSFTDTPSRSTDMMDIRGGGGLRGPPRRYGSPTRYPVGATTSFRPATTNNHSSSRSAID-PNYR-AASELKFR-GS
        GPD+PFS+T+ +S +   T + N S+F+++  R+ D MD+R         RRY SP+RYP GA T    +  +N  SSR+ ++  NYR  A E+K+R GS
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Query:  PLEPPGFPKRREPLFANNQVV
         L+  GF KRRE LF NN+ +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19370.1 unknown protein1.1e-8551.56Show/hide
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        MK+RE+ECEGLNHSLA +YVFDA ERSKAYGFTS+G++IHVLL GDIMNFKCRVRSK+K ++ +P+  Q+IKGYLLV + EKV  FNVS+QHYVR   PR
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        LLFSA L+EI+S+FL+++     +  +    PLI+SDRE L+V+GL  GY  +Y+S LP  +G+FN+ +W+SPV FF LFLFGAWHFF+KKKE+ T+WGP
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Query:  DEPFSATSPTSVAPMGTVSNNRSSFTDTPSRSTDMMDIRGGGGLRGPPRRYGSPTRYPVGATTSFRPATTNNHSSSRSAIDPNYRAASE----LKFRGSP
        D+PF+ T   +       S    +FT+   R+ D+MD+R         RRY   +   VGA          N  SSR+ +D NYR  ++     +  GS 
Subjt:  DEPFSATSPTSVAPMGTVSNNRSSFTDTPSRSTDMMDIRGGGGLRGPPRRYGSPTRYPVGATTSFRPATTNNHSSSRSAIDPNYRAASE----LKFRGSP

Query:  LEPPGFPKRREPLFANNQVV
        L+  GF  RR+ LF NN+V+
Subjt:  LEPPGFPKRREPLFANNQVV

AT1G75140.1 unknown protein1.1e-9656.7Show/hide
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        MK+RESECEGLNHSLA SYVFDA+ER+KAYGFTS+G++IHVLLLGDIMNFKCRVRSK+K+++ +P+  Q IKGYLL+ + EKV V+NVS+QHYVR   PR
Subjt:  MKLRESECEGLNHSLALSYVFDATERSKAYGFTSDGDLIHVLLLGDIMNFKCRVRSKRKLELNKPLMFQTIKGYLLVSSNEKVHVFNVSSQHYVRVGAPR

Query:  LLFSAALDEIKSSFLNYQNLDLESNFM------PLISSDREKLVVLGLGEGYVGMYQSNLPIFRGEFNSTVWTSPVLFFTLFLFGAWHFFSKKKEAFTSW
        LLF AAL++I+S+FL+++     ++        PLI+SDREKL+V+GLG+GYV  Y+S LPI + EFN+ +W+SPV FF LFLFGAWHFFSKKKE+ T+W
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Query:  GPDEPFSATSPTSVAPMGTVSNNRSSFTDTPSRSTDMMDIRGGGGLRGPPRRYGSPTRYPVGATTSFRPATTNNHSSSRSAID-PNYR-AASELKFR-GS
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Sequences Show/hide sequences
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TTTTTTTTGTGTGATTTTTCAAGATAGTAATTAGTACATCAAAGAAGGTAATTCTCATCAATTGATAAAAATGGAAATGGGTGGCA
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