; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G21220 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G21220
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr2:18635909..18636678
RNA-Seq ExpressionCSPI02G21220
SyntenyCSPI02G21220
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008004 - Protein OCTOPUS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598702.1 hypothetical protein SDJN03_08480, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-1950Show/hide
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        SS PSSS+SPY    K S+SS    LFKRR      S+ T  TN                    GFWSKLMMNRR K+++
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KAG7029644.1 hypothetical protein SDJN02_07984, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-2050.56Show/hide
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        SS PSSS+SPY    K S+SS    LFKRR      S+ T  TN                    GFWSKLMMNRR K+++
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XP_008444863.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis melo]5.6e-6982.44Show/hide
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        YSSSSPSSSSSPY STKKPS+SSMSSLLFKRRWSSS SSS+TATTNTNFF      HHR NNKS H GFWSKLMMNRRGKE IVE+ITLRCSSTSTTTDH
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        QTITT
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XP_022131967.1 uncharacterized protein LOC111004952 [Momordica charantia]6.7e-1447.69Show/hide
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        M KN   LK HAAA MAR+            +GGG     CRKHPKH+QSPGVCS+CLREKL  L +      S++ KI  S SSSSLSS+SS YSS+S 
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        +S  SS P    +K S+S MSS LFKRR S+++  S++        + AD            G WSKL++NRRGKE      TLR  S STTTDH
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XP_031736533.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis sativus]8.2e-97100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPJ0 Uncharacterized protein4.0e-97100Show/hide
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A0A1S3BC83 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like2.7e-6982.44Show/hide
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        QTITT
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A0A438C3J9 Uncharacterized protein5.9e-0844.87Show/hide
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        GG   S   CRKHPKH+QSPGVCS+CLRE+L  L+   T S S+S+ +  + SSSSLSS SS+YSSS  SS SSP    +    +  S S LL  +   +
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Query:  SSSSSTTATTNTNFFTAADAHHHRINNKSHHGFWSKLMMNR--RGKEIIVEQITLR
         S S    T       A DA     N KS  GFWSKL+  R  R +E++V   T+R
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A0A6J1BSJ2 uncharacterized protein LOC1110049523.2e-1447.69Show/hide
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        +S  SS P    +K S+S MSS LFKRR S+++  S++        + AD            G WSKL++NRRGKE      TLR  S STTTDH
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F6H0X5 Uncharacterized protein5.9e-0844.87Show/hide
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        GG   S   CRKHPKH+QSPGVCS+CLRE+L  L+   T S S+S+ +  + SSSSLSS SS+YSSS  SS SSP    +    +  S S LL  +   +
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         S S    T       A DA     N KS  GFWSKL+  R  R +E++V   T+R
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72240.1 unknown protein2.7e-0544.94Show/hide
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        C+KH KH+QSPG+CS+CL E+L  L++     T  +  ++    S S+SS SS+SS YSSSS SS SSP  Y   +K       S LF+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAAAGAACAACTTGAAATATCATGCGGCGGCGCCAATGGCTAGATCCTCCAACCACGGCCGCTGTAGAGCCGGCGTTGGCGTCGTCGGCGGCGGCAACGGCAGCTC
TCATTGTCGGAAACACCCAAAGCACAAACAATCACCTGGGGTTTGCTCTGTTTGTCTAAGAGAGAAGCTCTGTAATTTGACCATTACTAGAACACCCTCTTCCTCTTCCT
CTTCGAAAATATTACCTTCTTTTTCATCTTCTTCCTTATCATCTTTATCCTCTTATTACTCCTCTTCCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCACCCTATTCTTCAACAAAAAAA
CCTTCAGTTTCTTCCATGTCCAGCTTGTTATTCAAGAGAAGATGGTCATCCTCGTCGTCCTCATCAACAACAGCAACAACAAACACTAATTTCTTTACAGCCGCTGATGC
TCATCATCATCGTATAAACAACAAATCCCATCATGGGTTTTGGTCTAAATTGATGATGAATCGAAGAGGAAAAGAAATTATTGTTGAACAAATTACTTTGAGGTGTTCTT
CAACTTCTACAACAACAGATCATCAAACAATTACTACTCCTACCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAAAGGTCCTGGAAGTGCACCACTTCCCATCCTTTCTAATTTTCCATTCCATTTTAATTCCCCCCCTTTAAATATATTACCATCTCAATTCCCCAACACCAAAAAAGA
GAATTTAAAATGATTCAACAATGCCAAAGAACAACTTGAAATATCATGCGGCGGCGCCAATGGCTAGATCCTCCAACCACGGCCGCTGTAGAGCCGGCGTTGGCGTCGTC
GGCGGCGGCAACGGCAGCTCTCATTGTCGGAAACACCCAAAGCACAAACAATCACCTGGGGTTTGCTCTGTTTGTCTAAGAGAGAAGCTCTGTAATTTGACCATTACTAG
AACACCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGAAAATATTACCTTCTTTTTCATCTTCTTCCTTATCATCTTTATCCTCTTATTACTCCTCTTCCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCAC
CCTATTCTTCAACAAAAAAACCTTCAGTTTCTTCCATGTCCAGCTTGTTATTCAAGAGAAGATGGTCATCCTCGTCGTCCTCATCAACAACAGCAACAACAAACACTAAT
TTCTTTACAGCCGCTGATGCTCATCATCATCGTATAAACAACAAATCCCATCATGGGTTTTGGTCTAAATTGATGATGAATCGAAGAGGAAAAGAAATTATTGTTGAACA
AATTACTTTGAGGTGTTCTTCAACTTCTACAACAACAGATCATCAAACAATTACTACTCCTACCTAGCTATTGGAAAAATACAATTATGTAATTATTGTTTTTCTCATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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