; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G24190 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G24190
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1997)
Genome locationChr2:20730420..20732919
RNA-Seq ExpressionCSPI02G24190
SyntenyCSPI02G24190
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR018971 - Protein of unknown function DUF1997


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPW1 Uncharacterized protein7.7e-12385.71Show/hide
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A0A1S3C468 uncharacterized protein SYNPCC7002_A1590 isoform X12.1e-12084.73Show/hide
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A0A5D3BDM7 Uncharacterized protein2.1e-12084.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G31115.1 Protein of unknown function (DUF1997)5.8e-1425.34Show/hide
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         ++  ++P    QL+KDY  W
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AT4G31115.2 Protein of unknown function (DUF1997)5.8e-1425.34Show/hide
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        +S  KA   A R + + +    +     +E++  P+   +V++A+ ++    +DD   T+RC + + +  +FEV PVLV++V      C ++LLSCK   
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                                      LEGS ++  Q+++F A M N +++++      L+    D  + V +EI    F  +PV A+E+ G  V++
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         ++  ++P    QL+KDY  W
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AT5G04440.1 Protein of unknown function (DUF1997)9.4e-8158.16Show/hide
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        MA SS +    SL +      +NP+ P   F++T       +SS ++S +PS          + +S++S PKARFIAR+ +SV+VRQL RPL EYMSLPA
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        SQYSVLDAERIER+DD TFRC+VY FKFF FEVCPVL+V+VE QPNGCCIKLLSCK                                 LEGSP+VVAQN
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        DKFDASMVN++S D  +  S  Q++TSD VIEVNIEIPFAFR  PV AIE+ GTQVL+QILKLMLPRF +QL KDY AWASGDTSRQPLGTGEI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTTCAGCTCTTGCTCTCCCTCTTCCATTTCCCTTCACTACAAAAACCCAAAAACCCCTTTCTCTCTCACCCATAAGCCATTCCTAATTCTTGCCTCCTCTGCAAA
CGATTCTACCAGGCCTTCACTTCCAATCTCCACGAATTCCAATCCCAAAGCCCGCTTCATCGCCCGGAGGAGCGAATCCGTCACGGTTCGGCAGCTGGCACGGCCTCTAA
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GCTTTTGAGGTTTGCCCTGTTTTGGTTGTTAAAGTTGAACTGCAGCCTAATGGGTGTTGTATCAAGCTGCTTTCATGTAAGGTCTGGATTAATTTGTGGAATGTTGAATG
CTCAGTTTACTTCTTGTTTGTTTTGATTGTTATGTTCTTGTTTTTGACATGTTTAAATGATGGTGTTCAGCTTGAGGGCTCCCCAATTGTGGTTGCACAGAATGATAAAT
TTGACGCTTCTATGGTGAACCAGATCTCTTACGATGTGAATAGAGGCAACTCACTCTTGCAGAAACTCACTTCGGACACGGTCATTGAGGTTAATATTGAGATTCCTTTC
GCCTTCCGTGCAATTCCTGTACAAGCAATTGAATCAGCCGGAACCCAAGTCCTTGAACAAATATTGAAGCTTATGCTTCCTCGCTTCACAGCCCAGCTTGTGAAGGACTA
TCAAGCATGGGCCTCTGGTGATACATCAAGGCAACCTCTTGGAACAGGTGAAATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTTACTTCCTTCAAAGCCTCAAATATCAATATCCATTCACACTTCCAATCCCTCTCTGCAAAATTCTCCAACTTCTCTAATGGCCTTCAGCTCTTGCTCTCCCTCTTCC
ATTTCCCTTCACTACAAAAACCCAAAAACCCCTTTCTCTCTCACCCATAAGCCATTCCTAATTCTTGCCTCCTCTGCAAACGATTCTACCAGGCCTTCACTTCCAATCTC
CACGAATTCCAATCCCAAAGCCCGCTTCATCGCCCGGAGGAGCGAATCCGTCACGGTTCGGCAGCTGGCACGGCCTCTAAATGAGTATATGAGTTTGCCGGCTAGTCAGT
ACTCGGTGTTAGACGCGGAGAGGATTGAACGGATTGATGATTGTACTTTTAGGTGTCATGTTTATAGATTTAAGTTCTTTGCTTTTGAGGTTTGCCCTGTTTTGGTTGTT
AAAGTTGAACTGCAGCCTAATGGGTGTTGTATCAAGCTGCTTTCATGTAAGGTCTGGATTAATTTGTGGAATGTTGAATGCTCAGTTTACTTCTTGTTTGTTTTGATTGT
TATGTTCTTGTTTTTGACATGTTTAAATGATGGTGTTCAGCTTGAGGGCTCCCCAATTGTGGTTGCACAGAATGATAAATTTGACGCTTCTATGGTGAACCAGATCTCTT
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GAATCAGCCGGAACCCAAGTCCTTGAACAAATATTGAAGCTTATGCTTCCTCGCTTCACAGCCCAGCTTGTGAAGGACTATCAAGCATGGGCCTCTGGTGATACATCAAG
GCAACCTCTTGGAACAGGTGAAATCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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