; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G24360 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G24360
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationChr2:20881412..20884058
RNA-Seq ExpressionCSPI02G24360
SyntenyCSPI02G24360
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-4387.13Show/hide
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XP_011649873.1 uncharacterized protein LOC101216688 [Cucumis sativus]2.5e-49100Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]7.8e-4386.14Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-4387.13Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein1.2e-49100Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial3.0e-4897.03Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S143.0e-4897.03Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067338.4e-4386.14Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449963.8e-4386.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.9e-3267.35Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial6.9e-3468.37Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.5e-2867.02Show/hide
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.8e-1852.17Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.2e-3165.31Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S146.6e-3263.64Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S141.8e-0838.89Show/hide
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        R++L  K+ L +R+  K I   PSL +  + +   KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPR  Y+ F +S  + RE+ +  L+ G  ++SW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGAAACATTCTTGATAATTATCGCCGACAGCTTGCTGCCAAGTTCGAGTTGAAGCGGAATCTTTTCAAAGCCATCTGCAACGATCCGAGTCTTCC
CAAAGATATTCGTGAGGAGCATCGTAATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGTCGACCTCGGGGTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTATGTCTCGTATCGTTTTCCGTGAACTGGCGAAGAAAGGTCTTGTAATGGGTGTCAAGAAAGCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGCCCGCATCAGAAGTCAGTGATTTCGCTCTTTTCCATCAACCTCAATTCCCTTGTCTGCTCAAACTCAAAGAACTCAAAGGCAGCTACAGCCATTGTAGAGGATTTC
AAACGCTTGAAGGTGAAGCGAAATGTCGGGGGACAAGCGAAACATTCTTGATAATTATCGCCGACAGCTTGCTGCCAAGTTCGAGTTGAAGCGGAATCTTTTCAAAGCCA
TCTGCAACGATCCGAGTCTTCCCAAAGATATTCGTGAGGAGCATCGTAATAAGCTGTCGAAGTTGCCAAGAAATAGTTCGTTCACTCGATTGAGGAATCGCTGCATTTTC
ACCGGTCGACCTCGGGGTGTCTACCAGCTTTTCCGTATGTCTCGTATCGTTTTCCGTGAACTGGCGAAGAAAGGTCTTGTAATGGGTGTCAAGAAAGCTTCTTGGTAGAT
ATTGATTGATGGTAGAGACTTTTGTCGTTGTTGGGTTGTTATATTTCTACAAAGTTATCTCTTTAATCTCAGCGGGAATTAACTATATGCTCTGAAAAAGGTGATATTAC
TTTTAAGTTCCCTGGACATGATTCATGCCAAAGAATAGTAAAGGCTTTACTTTTGCTATTCAATAAGTGTTTTATCTTAGACAGTTACTAATGGTGGTGTATTTTTCTGA
TAGTTACGATTTTCTTTTCCCCTGCTTATCTGCTACTTACCCTCTTTTTTACTGCGTTTTCATTTGAATTTTGGCCTAGTAATCTATAAACTTTTCACATCACCTTGACC
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TACATTATTGTTTTGACGTTTAATTTAAGTCAACATCCCATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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