; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G24600 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G24600
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUPF0301 protein
Genome locationChr2:21126997..21131769
RNA-Seq ExpressionCSPI02G24600
SyntenyCSPI02G24600
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003774 - Protein of unknown function UPF0301


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578309.1 hypothetical protein SDJN03_22757, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-17785.33Show/hide
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XP_022993090.1 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X2 [Cucurbita maxima]7.8e-17885.6Show/hide
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XP_023550640.1 uncharacterized protein LOC111808722 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-17785.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMD9 Uncharacterized protein1.4e-20499.45Show/hide
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A0A1S3B2S1 uncharacterized protein LOC1034853831.7e-19996.44Show/hide
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A0A5A7T638 UPF0301 protein1.7e-19996.44Show/hide
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A0A6J1FL02 uncharacterized protein LOC111445188 isoform X21.9e-17785.33Show/hide
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A0A6J1JXJ8 uncharacterized protein LOC111489210 isoform X23.8e-17885.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1BEV6 UPF0301 protein Cpha266_08851.3e-1828.12Show/hide
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        GL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GY+GW   QL EE E   WY+A  S ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
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B3QMC9 UPF0301 protein Cpar_06621.7e-1828.35Show/hide
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        M + G +L+A+  L     F+RTV+L+      H  EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++             +   +EV
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        +PGL +G     ++ + L+  G+++P + RFF+GYAGW   QL++E E   WY A  S+  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
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Q3AQ69 UPF0301 protein Cag_16016.9e-2030.06Show/hide
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        F+RTV+L+      H +EG  G ++NRPL  K++       D+     +  LH GGP++ +           +H  +EV+PG+ +G     DE + L+  
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Query:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
        G++ P + RF++GYAGW   QL  E E   WY A  + ++I       + E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  GILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q3B561 UPF0301 protein Plut_06371.0e-1828.57Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV
        F+RTV+++      H  +G  G ++NRP+  +++       +    F E    LH GGP++++           + G E+++PGL +G     +E   L+
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
          G+LKP + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  +  ++         E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Q8KEM4 UPF0301 protein CT06632.2e-1830.29Show/hide
Query:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV
        F+RTV+L+      H +EG  G ++N+P+  K+        +  + F E    LH GGP++     +       + G  EVIPGL +G     ++ + L+
Subjt:  FERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECS--LHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLV

Query:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK
          G++K  + RFF+GYAGW   QL  E E   WY A  SS  +         E +W   ++  GG Y  ++  P+
Subjt:  KKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33780.1 Protein of unknown function (DUF179)1.2e-11566.46Show/hide
Query:  FSSSYP-----FGPELLSLLEIRVFKPKLSSPGF---LVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLFA
        FSSS P     F  +L   LE R    K+S+  +   +VRAT+KK++D+S S        PGD ++    S+GN+S ++++ K   +N DWREFRANLF 
Subjt:  FSSSYP-----FGPELLSLLEIRVFKPKLSSPGF---LVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLFA

Query:  REQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS
        +EQ EK EA+        HES+ + LKWAHPIP PETGCVLVATEKLDG RTF RTVVLLLR+G+RHPQEGPFGVVINRPLHK IKHMK T  +LATTFS
Subjt:  REQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFS

Query:  ECSLHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDS
        ECSL+FGGPLEASMFLLK G+K+K+ GFEEV+PGL FG RN+LDEAAVLVKKG+LKPQ+FRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYW+VAACSS+LI G    +
Subjt:  ECSLHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGGISSDS

Query:  SSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM
        SSE LWEEILQLMGG YSELSRKPK D+
Subjt:  SSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM

AT3G19780.1 LOCATED IN: endomembrane system3.1e-1531.21Show/hide
Query:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKAGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    E  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKAGEKSKLHGF

Query:  EEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    ++      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G19780.2 LOCATED IN: endomembrane system3.1e-1531.21Show/hide
Query:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKAGEKSKLHGF
        P  +TG VLVATEKL    TF ++ +L++++G   P+ G  G++ N+ +  K     P   + A    E  L FGGP+       + L +  + S  H  
Subjt:  PMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLE----ASMFLLKAGEKSKLHGF

Query:  EEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
         E+ PG+ F    ++      +K   L P ++ FF+GY+ W  +QL +EI    W V
Subjt:  EEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

AT3G29240.1 Protein of unknown function (DUF179)1.6e-4839.51Show/hide
Query:  MTSRKFSSSYPFGPELLSLLEIRVFK-PKLSSPGFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLF
        +TSR  S       EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A      SP   N    D   P +D    ++     +N TS       + DWREFRA L 
Subjt:  MTSRKFSSSYPFGPELLSLLEIRVFK-PKLSSPGFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLF

Query:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP
        A EQA   E D         V     ++     +  KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K 
Subjt:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP

Query:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKA-----GEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
        T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R ++  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW V
Subjt:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKA-----GEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

Query:  AACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMG
        AACSS ++  + S   S GLW+E+L L+G
Subjt:  AACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMG

AT3G29240.2 Protein of unknown function (DUF179)1.6e-4839.51Show/hide
Query:  MTSRKFSSSYPFGPELLSLLEIRVFK-PKLSSPGFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLF
        +TSR  S       EL+  ++ R+F  PK +S  F+ R  A      SP   N    D   P +D    ++     +N TS       + DWREFRA L 
Subjt:  MTSRKFSSSYPFGPELLSLLEIRVFK-PKLSSPGFLVRATAKKNHDNSPSPEN---GDHSVPGDDAKSKNISDGNESNETSSQKPHLVNLDWREFRANLF

Query:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP
        A EQA   E D         V     ++     +  KWAH I  PETGC+L+ATEKLDGV  FE+TV+LLL  G      GP GV++NRP    IK  K 
Subjt:  AREQAEKVEAD---------VETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKIKHMKP

Query:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKA-----GEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV
        T +D+A TFS+  L FGGPLE  +FL+        E  K   F +V+ GL +G R ++  AA +VK+ ++   + RFF GY GW+ +QL+ EI   YW V
Subjt:  TNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKA-----GEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYV

Query:  AACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMG
        AACSS ++  + S   S GLW+E+L L+G
Subjt:  AACSSNLIGGISSDSSSEGLWEEILQLMG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTCTTCGCTGCCAATGTCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCCTCCTTCCCCCTTTTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCCATTTCCTGCTCTCT
GGCGATGACTTCGAGGAAATTCTCTTCCTCATATCCCTTTGGCCCTGAACTTCTCAGCTTGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTCTCCCGGTTTTCTCG
TGCGGGCCACTGCCAAGAAGAATCACGACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCATTCTGTTCCTGGAGATGACGCTAAATCAAAGAATATTTCTGATGGCAACGAA
AGTAATGAAACTTCTTCCCAGAAACCACATCTTGTAAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCAAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTCGAAGCTGATGTGGA
AACCCAGACTGCAAATGCTCACGAGTCTAAGGGTCTTGCGCTGAAGTGGGCACATCCTATTCCTATGCCTGAGACTGGCTGTGTGCTTGTTGCCACCGAGAAGTTGGATG
GTGTTCGCACTTTTGAGCGTACAGTCGTCCTTCTTCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCTCAGGAGGGACCATTTGGTGTCGTGATAAATAGGCCACTCCACAAAAAGATC
AAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGAGTGCTCTCTACATTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTGAAAGCAGGAGAGAA
ATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATCCCAGGCCTCTGCTTTGGTGCTCGAAACACCCTAGATGAAGCTGCAGTGTTGGTGAAGAAGGGAATCCTTAAACCTCAGG
ACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAGTTGAGGGAGGAGATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAAATCTAATTGGTGGA
ATCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGGCTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATTCCGTTAGATAATGGCATATTCGGTGTGAATGTGTATCGCTCTACATCATTTTCACTCTCTTCTCTCTCTGCCCTTACCTTAACTGTTAGCTGCTCATTGTTTG
GCTTTCAATCTTCAATATATATCGCCCAAATATTCTCTCTCTATTTTCTTCTCCTTAGTTCTCTGGATTGGATCATCGTTTCCGACGCCTTCTTCCCACCAAAAAAAAAA
AATCCCTTTCGGATATGGATCTCTTCGCTGCCAATGTCAAGAACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTCCTCCTTCCCCCTTTTCACTCAAACACTCCTTTCCTGATAGACCC
ATTTCCTGCTCTCTGGCGATGACTTCGAGGAAATTCTCTTCCTCATATCCCTTTGGCCCTGAACTTCTCAGCTTGCTTGAGATCCGTGTTTTCAAGCCCAAGCTTTCCTC
TCCCGGTTTTCTCGTGCGGGCCACTGCCAAGAAGAATCACGACAATTCTCCATCTCCTGAAAATGGAGATCATTCTGTTCCTGGAGATGACGCTAAATCAAAGAATATTT
CTGATGGCAACGAAAGTAATGAAACTTCTTCCCAGAAACCACATCTTGTAAATTTGGACTGGCGAGAATTCAGAGCAAACCTATTTGCTCGTGAGCAGGCAGAAAAGGTC
GAAGCTGATGTGGAAACCCAGACTGCAAATGCTCACGAGTCTAAGGGTCTTGCGCTGAAGTGGGCACATCCTATTCCTATGCCTGAGACTGGCTGTGTGCTTGTTGCCAC
CGAGAAGTTGGATGGTGTTCGCACTTTTGAGCGTACAGTCGTCCTTCTTCTCAGATCTGGAAGCAGACACCCTCAGGAGGGACCATTTGGTGTCGTGATAAATAGGCCAC
TCCACAAAAAGATCAAGCATATGAAACCAACCAATATTGACTTAGCAACTACATTTTCTGAGTGCTCTCTACATTTTGGGGGGCCTCTTGAGGCGAGCATGTTTTTGCTG
AAAGCAGGAGAGAAATCGAAACTCCATGGGTTTGAAGAAGTGATCCCAGGCCTCTGCTTTGGTGCTCGAAACACCCTAGATGAAGCTGCAGTGTTGGTGAAGAAGGGAAT
CCTTAAACCTCAGGACTTCAGATTCTTTGTGGGTTATGCTGGTTGGCAACTGGATCAGTTGAGGGAGGAGATTGAATCAGATTACTGGTATGTGGCAGCTTGTAGCTCAA
ATCTAATTGGTGGAATCTCATCAGATTCCTCATCAGAGGGGCTATGGGAAGAGATTTTGCAGTTAATGGGTGGTCACTATTCAGAGTTGAGCAGAAAGCCTAAGCAAGAT
ATGTAGTTTACTTATGTGAAGGAAGCAAACATTGAAAAAACTCTCAACGTTCAAATATGTAATCTACGTTAAAGCCAAATGTACAGAAGTTAGCTGGCTTTTGAAATTTA
GCAGACGGACAGCTACTACTACCTTTTTATAGCCTACTTCTAAATGTAATTTATGTATATTCTGTTCACGTTTGCTTAATTCAATAGCTGTTTTAGAATATGCCTACATC
TGATCATAATTATTATTGTTTCTTGTCATTAAAAATCGAAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLFAANVKNAAAAAAAPPSPFSLKHSFPDRPISCSLAMTSRKFSSSYPFGPELLSLLEIRVFKPKLSSPGFLVRATAKKNHDNSPSPENGDHSVPGDDAKSKNISDGNE
SNETSSQKPHLVNLDWREFRANLFAREQAEKVEADVETQTANAHESKGLALKWAHPIPMPETGCVLVATEKLDGVRTFERTVVLLLRSGSRHPQEGPFGVVINRPLHKKI
KHMKPTNIDLATTFSECSLHFGGPLEASMFLLKAGEKSKLHGFEEVIPGLCFGARNTLDEAAVLVKKGILKPQDFRFFVGYAGWQLDQLREEIESDYWYVAACSSNLIGG
ISSDSSSEGLWEEILQLMGGHYSELSRKPKQDM