CuGenDBv2

Gene ID	CSPI02G25000
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	Chr2:21384968..21385913
RNA-Seq Expression	CSPI02G25000
Synteny	CSPI02G25000
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7015908.1 hypothetical protein SDJN02_21012, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.9e-78

81.12

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF
        MFQSSRR+HSFSS+SSS+ S SSSSSSSRGS YFP++SPFSAAATP+R+FSG+IPFSWEHLPGIPKKQSPARLRR SASPL+S LPLPPNS+T  SSKR 
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        GFQDWRKSN Q +QRDPFFDAF+ECSKEP    A   ELW G SNGK ++RSLSDRFGF+NLYSSCKRTC VSESIVYLPRT RSSFDLLNQRTGG
Subjt:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

XP_008441227.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485423 [Cucumis melo]

7.4e-90

91.84

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF
        MFQSSRRTHSFSS+SS++ S SSSSSSSRGSYYFP +SPFSA+ATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSS LPLPPNSTT SSSKRF
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        GFQDWRKSNRQN QRDPFFDAFLECSKEPTN AAVDAELWSG SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT  SSFDLLNQR+GG
Subjt:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

XP_011649907.1 uncharacterized protein LOC105434677 [Cucumis sativus]

1.1e-101

100

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG
        MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG

Query:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
Subjt:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

XP_023549797.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.4e-78

79.5

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSA-----SSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSS
        MFQSSRR+HSFSS+     SSS+S SSSSSSSRGS YFP++SPFSAAATP+R+FSG+IPFSWEHLPGIPKKQSPARLRR SASPL+S LPLPPNS+T  S
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSA-----SSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSS

Query:  SKRFGFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        SKR GFQDWRKSN Q +QRDPFFDAF+ECSKEP    A   ELW G SNGK ++RSLSDRFGF+NLYSSCKRTC VSESIVYLPRT RSSFDLLNQRTGG
Subjt:  SKRFGFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]

3.5e-92

92.89

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG
        MFQSSRRTHSFSS SSSNSLSSSSSSSRGSYYFPD+SPFS AATPIRSFSG+IPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSS LPLPPNS TP SSKRFG
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG

Query:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWS--GGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        FQDWRKSNRQN+QRDPFFDAFLECSKEP+ AAAVDAELWS  GGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT RSSFDLLNQR+GG
Subjt:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWS--GGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

3.6e-90

91.84

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF
        MFQSSRRTHSFSS+SS++ S SSSSSSSRGSYYFP +SPFSA+ATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSS LPLPPNSTT SSSKRF
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        GFQDWRKSNRQN QRDPFFDAFLECSKEPTN AAVDAELWSG SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT  SSFDLLNQR+GG
Subjt:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

3.6e-90

91.84

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF
        MFQSSRRTHSFSS+SS++ S SSSSSSSRGSYYFP +SPFSA+ATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSS LPLPPNSTT SSSKRF
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSN-SLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        GFQDWRKSNRQN QRDPFFDAFLECSKEPTN AAVDAELWSG SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRT  SSFDLLNQR+GG
Subjt:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC111020211

5.2e-73

81.87

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKK-QSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF
        MFQSSRRTHSFSS+SS     SSSSSSRGSYYFPDDSP S +ATPIRSFSG IPFSWEHLPGIPKK QSPARLR+ SASPL+S LPLPPNSTTP SSKRF
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKK-QSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGG---SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLL
        GFQ+WRKSNR N+QRDPFFDAF+ECSK+  +AA   AELWSGG   + GKAI+RSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIV LPRT RSSFDLL
Subjt:  GFQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGG---SNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLL

A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

1.1e-75

80.4

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG
        MFQSSRRT SFSS+S S+S SSSSSSSRGSYYFPDDSP S AATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+S LPLPP STT  SSKRFG
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG

Query:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVD----AELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        F DWRKSNRQN+QRDPFFDAF+ECSKEP+ A A +    AELW+ GSNGKA++RSLSDRFGFLN  SSCKRTCGVSESIVY PR  RSSFDLLN R GG
Subjt:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVD----AELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

4.2e-75

79.4

Show/hide

Query:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG
        MFQSSRRT SFSS+SSS+  SSSSSSSRGSYYFPDDSP S AATPIRSFSG+IPFSWE+LPGIPKKQSPARLR  SASPL+  LPLPP ST   SSKRFG
Subjt:  MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFG

Query:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVD----AELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
        F DWRKSNRQN+QRDPFFDAF+ECSKEP+ A A +    AELW+ GSNGKA++RSLSDRFGFLN YSSCKRTC VSESIVY PR  RSSFDLLN R+GG
Subjt:  FQDWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVD----AELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G22680.1 unknown protein

7.7e-21

43.01

Show/hide

Query:  SRRTHS--FSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFGFQ
        +RR++S  FSS  + ++  S SSSS  S  F  +SP    ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        LS+ LPLPP+ +  S + R    
Subjt:  SRRTHS--FSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFGFQ

Query:  DWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG
          +K+    A RDPF  A +ECSK     A  D E  +GG + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +S+D L+  T G
Subjt:  DWRKSNRQNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

AT1G71970.1 unknown protein

4.4e-24

40.58

Show/hide

Query:  FQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPP--NSTTPSSSKRF
        F +     S  S SSS+S SS SS S  S  FP DSP ++ ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R +    +  LPLPP  N + P++ K+ 
Subjt:  FQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPP--NSTTPSSSKRF

Query:  GFQDWRKSNR-QNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAEL------------WSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTER-SS
           +  K N      +DPF  A LECSK+    +  D ++             SGGS+      S+ DRFG +NLY SC+RTC V+ESIVYLPR  + +S
Subjt:  GFQDWRKSNR-QNAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAEL------------WSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTER-SS

Query:  FDLLNQR
        +D L  R
Subjt:  FDLLNQR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCCGCTTCTTCTTCTAATTCCCTTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTCCCCGATGATTC
TCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCCGGAATCCCCAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCCGAC
GAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTTCTTTCCTTCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGGTTTCAAGACTGGAGGAAATCGAACCGCCAA
AATGCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGGCGGTAGCAATGGTAAGGC
GATTACAAGAAGTCTGAGCGATCGTTTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTTCCTAGAACGGAAAGGA
GTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCACCGGCGGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATATAACAAAAATGTTAGAAAGTTGAAGTGGGTTTTTGTTTGAGCAAAAAGCCAAATTGGGATTCCCAAATTTCTCTGAAAAAGAGAATGTGAAGAATCAAAGAGAAAAG
AAAAAGAAAGTGAATACAATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCATTCTCTTCCGCTTCTTCTTCTAATTCCCTTTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTCGCGGTTCTTA
CTATTTCCCCGATGATTCTCCTTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAACATTCCCTTCTCTTGGGAGCATTTACCCGGAATCCCCAAAAAACAGT
CTCCGGCCAGGCTCCGACGAGGTTCCGCCTCTCCTCTCTCTTCTTTCCTTCCTTTACCTCCCAATTCCACCACCCCATCCTCTTCCAAACGCTTCGGGTTTCAAGACTGG
AGGAAATCGAACCGCCAAAATGCACAGCGAGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAATGCTCTAAAGAACCTACCAACGCTGCTGCCGTTGACGCCGAGCTCTGGAGTGG
CGGTAGCAATGGTAAGGCGATTACAAGAAGTCTGAGCGATCGTTTCGGATTCTTGAATCTGTATTCTTCTTGTAAACGGACATGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACC
TTCCTAGAACGGAAAGGAGTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGCACCGGCGGTTGAAGAAGAACAAAAAAAAGAAAAACAAGAGATAAGTTGGTGATTTGATTAAATGTT
TGTTTAGTTTAATTAATCTCTTTGTTTGTGGTGAAATGATTATGATTATCATTATGATTATGAATATGGAATGATGGCTTAATCCCAATTTGGGTTTGTTAATCTGTGAT
TACTGCGCTGGATTTGTTTGAGAAATTTACCTCAAAATTTGAATTGAAAAGTTGCAAAATTAGTCT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFQSSRRTHSFSSASSSNSLSSSSSSSRGSYYFPDDSPFSAAATPIRSFSGNIPFSWEHLPGIPKKQSPARLRRGSASPLSSFLPLPPNSTTPSSSKRFGFQDWRKSNRQ
NAQRDPFFDAFLECSKEPTNAAAVDAELWSGGSNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTERSSFDLLNQRTGG

CSPI02G25000 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome