; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G25610 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G25610
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationChr2:21735692..21738048
RNA-Seq ExpressionCSPI02G25610
SyntenyCSPI02G25610
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-13190.67Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-12591.97Show/hide
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XP_004138793.1 zinc finger protein 511 [Cucumis sativus]7.1e-138100Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]2.1e-13497.59Show/hide
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XP_023522582.1 zinc finger protein 511-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.9e-12591.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein3.4e-138100Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5111.0e-13497.59Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5113.1e-13190.67Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5114.8e-12491.16Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5112.4e-12390.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5111.5e-2134.67Show/hide
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        DS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R  H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5117.6e-2633.04Show/hide
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        ++P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++           SE  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R +P++RLL +H+ E
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         HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R  HL+  H + A F F K     +   +KT +K+ +      + ++ E +E MD            
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        + +   K   S   PSSI FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5111.1e-2133.02Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E HDS 
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Query:  FQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKTYRKQASQG-REETSKMEVENE-IMDGLISGVSKLSTSDSTP
        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R  H+V  H + A F F K   P K +   +       G R E   ME+ +E +         +       P
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Query:  SSISFGRRHTRG
        S+I FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102012.1e-1229.63Show/hide
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        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R  H +  HK  A++ F            K   KQ 
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Query:  SQGREETSKMEVENEIMD-GLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKVSD
         QG+ + + MEV+  I +   +  V   S    T  S   G+    G T       +E ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding2.4e-9165.88Show/hide
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        M V++  E  FP W P++RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH         I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV
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        YPTSRLLS+H+SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+RH+HL+DKHKF  +FEFFKK   SKK+R+K  R+  S+ + E  K       ME
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Query:  VENE-IMDGLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKVSDSSTA
        VE++  +DGL+S +S L+TSD+TPS++SFGRRH RGLTFVPR+V REK ++SS+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTGCTGGAAGCCTCTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTTTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGC
CAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTCGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACT
TGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCT
GAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCA
GCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAAAAACAAAGACAGAAAACGTATCGTAAACAAGCCAGTCAAGGAA
GGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTGTCTAAACTAAGTACTTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGC
CGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCATCAACAGCTGGAACAAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGAGCTTGAGGTTGGTGGATTTTAACCGGAAACGACGGGATCGAGCTCCGATTAGGGGATTTCGTCGATTGCGGGCCTTCAAAGTTCAAATTAAATTGAAAAGTAAGTA
AGAACAGATTCTTCCATCTGCAACGGTCCATTGCACTTCCATGGAAGTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTGCTGGAAGCCTCTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTC
CCTTTTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGCCAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTCGC
AGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACTTGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAG
AGTTTACCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCTGAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAG
GTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCAGCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAAAAA
CAAAGACAGAAAACGTATCGTAAACAAGCCAGTCAAGGAAGGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTGTCTAAACT
AAGTACTTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGCCGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCATCAA
CAGCTGGAACAAAGAGATGAAAGTAGTGTATCTAGACCAATTGGGATGTAATTTCAGATGATATAGGAAATGGTAGGGGAGATATCGAGTTTCAAGATGGCAGAACTGAT
TCCTATTTGTCTCAGTGGAGGAATCAATGTCGGTTGAAATGGATGGATGCCACAATGTTGATAGTCAAAGTTAGCAATGTCTTTAGATGGATTAGTTAGTTTGTTACGTA
CTTCAAATAGACTGAATATTGATGAAAACATTGTTTGAAATGTTTGAGTCATAGAGTCTTGGGTAGTAAATCACCTCTTGGGATTAGTTGGACTCTTAATCTTAACCGTG
CTTGTGGAGAATTGATGAGGATTGGGAAGGTATTTATTTAGCTTTTCTATTCAATTTAAGACATAGAATACCAAGAAACAGAACTTCACTAAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEVESQSEFPCWKPLQRRFDPDSPFFASGNVEREILAKQVALDLTEDEKLQLHNMAVDARSEIFCPIVGCGAHLKSLDDFEDHYNSRHTASCSVCPRVYPTSRLLSLHVS
EAHDSFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKTYRKQASQGREETSKMEVENEIMDGLISGVSKLSTSDSTPSSISFG
RRHTRGLTFVPRAVQREKVSDSSTAGTKR