; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G25750 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G25750
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationChr2:21814585..21815788
RNA-Seq ExpressionCSPI02G25750
SyntenyCSPI02G25750
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053284.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]8.0e-12494.78Show/hide
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TYK11877.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-12394.76Show/hide
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XP_008455958.1 PREDICTED: fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo]3.4e-13093.92Show/hide
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XP_038900968.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.8e-12390.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQV6 FAS1 domain-containing protein3.6e-13899.24Show/hide
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A0A1S3C2T8 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.6e-13093.92Show/hide
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A0A5A7UDG5 Fasciclin-like arabinogalactan protein 73.9e-12494.78Show/hide
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A0A5D3CIW8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 78.7e-12494.76Show/hide
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A0A6J1CEN1 fasciclin-like arabinogalactan protein 75.3e-11384.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 126.1e-2639.61Show/hide
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        P PA APAP G   ++  +L  AG F  F+  L+ST V      Q  NS+ GITIF P D++F+ LK  +L++LT +Q   L+ FH +P Y + ++F  +
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        S  +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ +F    P  PAP P P V     + S + +     SS
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Query:  TESPSSS
         +SP+ +
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 114.1e-2234.68Show/hide
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        APAP P+G   ++  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q  ++S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q   L+ FH LP   T+  F  +S 
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Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   ++I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   PAPAP     V+    + S   +G  S  S++
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Query:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS
        +  + F  G  +  +  + A S
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 62.0e-2135.61Show/hide
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        APAP      ++L  +L     F   +  L +T+V      Q  +S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q   L+L+H +P YY+L+D   L   
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Query:  SPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPA-ADTPSAETEGSVSPSS
        +P+ T A    G  + LNFT    S  +++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   P  AP P    + + AD+P+A+ E   + SS
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Query:  TESPS
         +  S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 75.9e-6957.41Show/hide
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        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QA N+EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQLK L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
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Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 93.5e-2136.99Show/hide
Query:  ASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTL
        A+   A   APAP PAG  ++L  +L   G F  F+  L  T+V      Q  +S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ D    L+L+H  P YY++
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Query:  ADFNELSQKSPITTFAGEQ----YTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEG
         D   LS  +P+ T A  +    Y LNFT  +  I++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP P        D  S  T+ 
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Query:  SVSPSSTESPSSSFRVGGG
        + SPS  +S S   +VG G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 92.5e-2236.99Show/hide
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        A+   A   APAP PAG  ++L  +L   G F  F+  L  T+V      Q  +S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ D    L+L+H  P YY++
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Query:  ADFNELSQKSPITTFAGEQ----YTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEG
         D   LS  +P+ T A  +    Y LNFT  +  I++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP P        D  S  T+ 
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Query:  SVSPSSTESPSSSFRVGGG
        + SPS  +S S   +VG G
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 74.2e-7057.41Show/hide
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        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QA N+EEGITIFVPKD AF 
Subjt:  KLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFS

Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQLK L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
Subjt:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD

Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
Subjt:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF

AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 74.2e-7057.41Show/hide
Query:  KLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFS
        K+ +     +   ++CS+   A+TA+ P   +P+  P PAPAPAP  ++V+L +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QA N+EEGITIFVPKD AF 
Subjt:  KLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFS

Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQLK L+LFH LPHYY+L++F  LSQ  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
Subjt:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD

Query:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S     G  +L   + + ISG + LF
Subjt:  FPPAPAPVPTPDVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF

AT5G03170.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 112.9e-2334.68Show/hide
Query:  APAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQA-TNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQ
        APAP P+G   ++  +L  AG F  F+  L+ST+  +    Q  ++S  G+T+F P D AF+SLK  +L++L+  Q   L+ FH LP   T+  F  +S 
Subjt:  APAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQA-TNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQ

Query:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE
         +P+ T AG+    ++ LN T +   ++I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   PAPAP     V+    + S   +G  S  S++
Subjt:  KSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSSTE

Query:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS
        +  + F  G  +  +  + A S
Subjt:  SPSSSFRVGGGVLWIQLVLAIS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 124.4e-2739.61Show/hide
Query:  PVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNEL
        P PA APAP G   ++  +L  AG F  F+  L+ST V      Q  NS+ GITIF P D++F+ LK  +L++LT +Q   L+ FH +P Y + ++F  +
Subjt:  PVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNEL

Query:  SQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSS
        S  +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ +F    P  PAP P P V     + S + +     SS
Subjt:  SQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADTPSAETEGSVSPSS

Query:  TESPSSS
         +SP+ +
Subjt:  TESPSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTTCATATGATTTTCTTGTTTGGTATTTGGCTGACGCTGCTGTGCTCTTCACCCGTATGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCAGCTAGTCCGATTCCTGC
ACCGGTACCAGCCCCAGCACCTGCACCAGCTGGCGATCATGTTGACCTTGCTGATTTGCTTACAGTAGCTGGTCCCTTCCACAAGTTCCTTGGCTACCTCGAATCCACCA
AAGTCATTGAGACCTTCCAAAAGCAAGCCACCAATTCTGAAGAGGGAATTACTATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCTCTTAAGAAGCCTTCTCTGTCCAAT
CTCACCAAGGACCAGCTCAAGTCACTGTTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTATACTTTAGCTGACTTCAACGAACTAAGCCAAAAGAGTCCGATTACGACATTTGC
CGGTGAGCAGTACACTTTGAATTTTACTGATGCATCTGGCACTATCCACATAAGCTCAGGTTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGCAGCGTGCTTTCGACCGATCCTGTTG
CAGTTTACCAAGTTGATCACGTACTCCTTCCAGAGGCAATCTTTGGAACTGATTTCCCTCCTGCCCCAGCTCCAGTACCGACCCCTGACGTTGCTCCTGCTGCTGATACT
CCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGTGTTTCTCCATCATCGACGGAGTCACCATCTTCTTCCTTTAGGGTTGGTGGAGGGGTACTCTGGATCCAGTTGGTTTTAGCAATTTC
AGGTGGACTGCTCCTATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACATTCCTCATTTATATACTCCTCTTTCTTCTCCACTTTCCTTCATCCCTCTCCGCTGTTGCCTTCTCTCAGGACAAAACCACAGAAAGAGATGAAACTTCATATGATT
TTCTTGTTTGGTATTTGGCTGACGCTGCTGTGCTCTTCACCCGTATGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCAGCTAGTCCGATTCCTGCACCGGTACCAGCCCCAGC
ACCTGCACCAGCTGGCGATCATGTTGACCTTGCTGATTTGCTTACAGTAGCTGGTCCCTTCCACAAGTTCCTTGGCTACCTCGAATCCACCAAAGTCATTGAGACCTTCC
AAAAGCAAGCCACCAATTCTGAAGAGGGAATTACTATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCTCTTAAGAAGCCTTCTCTGTCCAATCTCACCAAGGACCAGCTC
AAGTCACTGTTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTATACTTTAGCTGACTTCAACGAACTAAGCCAAAAGAGTCCGATTACGACATTTGCCGGTGAGCAGTACACTTT
GAATTTTACTGATGCATCTGGCACTATCCACATAAGCTCAGGTTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGCAGCGTGCTTTCGACCGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGATC
ACGTACTCCTTCCAGAGGCAATCTTTGGAACTGATTTCCCTCCTGCCCCAGCTCCAGTACCGACCCCTGACGTTGCTCCTGCTGCTGATACTCCATCTGCTGAAACTGAG
GGCAGTGTTTCTCCATCATCGACGGAGTCACCATCTTCTTCCTTTAGGGTTGGTGGAGGGGTACTCTGGATCCAGTTGGTTTTAGCAATTTCAGGTGGACTGCTCCTATT
TTAGTGAGGAAGGATAAAGATGAACTATTTTCGCTACAGTTTATGTCTTTCAATTTTGTTCAATGCAATGTTGTGAAGCTAGTATGTTCCTATTCTTTAATGCAATGGCG
TACAACGGTTTTGTTAGTTCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLHMIFLFGIWLTLLCSSPVCARTAAKPPAASPIPAPVPAPAPAPAGDHVDLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQATNSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSN
LTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFNELSQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPTPDVAPAADT
PSAETEGSVSPSSTESPSSSFRVGGGVLWIQLVLAISGGLLLF