; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI02G27900 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI02G27900
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCell wall assembly regulator SMI1
Genome locationChr2:23885488..23885955
RNA-Seq ExpressionCSPI02G27900
SyntenyCSPI02G27900
Gene Ontology termsGO:0071840 - cellular component organization or biogenesis (biological process)
GO:0005856 - cytoskeleton (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648317.1 hypothetical protein Csa_004676, partial [Cucumis sativus]4.4e-1381.25Show/hide
Query:  MEKEKIPKNMEKEK----ISKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKME
        MEKE+IPKNMEK +    I+  MEKEKIPKNME EKISKNMEK+KIPKNMEKGENCGVITVKME
Subjt:  MEKEKIPKNMEKEK----ISKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKME

KAG7320641.1 hypothetical protein KOW79_016494 [Hemibagrus wyckioides]1.4e-0642.28Show/hide
Query:  MEKEKIPKNMEKEK--IPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISK
        +EKEK+    EKEK  + K  EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+    EKEK+  
Subjt:  MEKEKIPKNMEKEK--IPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISK

Query:  NMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEK
          EKEK+    EKEK+    EK+K+    EK +    +  + EK+E EK
Subjt:  NMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEK

SBT73853.1 conserved Plasmodium protein, unknown function, partial [Plasmodium ovale]6.4e-1240.67Show/hide
Query:  EKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNME
        EKE++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++ K +E
Subjt:  EKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNME

Query:  KEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITV-KMEKMEKEKIVP
         E++PK +E E++ K +E +++PK +E  E   ++ V ++ KM + + VP
Subjt:  KEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITV-KMEKMEKEKIVP

VWU52115.1 conserved protein, unknown function, partial [Hepatocystis sp. ex Piliocolobus tephrosceles]3.1e-0649.18Show/hide
Query:  KNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKIPK
        KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK + +KN++K    K
Subjt:  KNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKIPK

Query:  NMEKEKISKNMEKKKIPKNMEK
            +   KN+ KK+  KN+ K
Subjt:  NMEKEKISKNMEKKKIPKNMEK

XP_033752032.1 flocculation protein FLO11-like [Pecten maximus]4.3e-0836.59Show/hide
Query:  IPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKI
        +P N++   IP+N E   IP+N E   IP+N E   IP+N E   IP+N E   IP+N E   IP+N+E   +P+N+E   +P+N++   + +N+E + +
Subjt:  IPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKI

Query:  PKNMEKEKISKNMEKKKIPKNME
        P+N+E + + +N+E + +P+N+E
Subjt:  PKNMEKEKISKNMEKKKIPKNME

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1C3KJ02 Uncharacterized protein (Fragment)3.1e-1240.67Show/hide
Query:  EKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNME
        EKE++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++PK +E E++ K +E
Subjt:  EKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNME

Query:  KEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITV-KMEKMEKEKIVP
         E++PK +E E++ K +E +++PK +E  E   ++ V ++ KM + + VP
Subjt:  KEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITV-KMEKMEKEKIVP

A0A2P9GFU3 Uncharacterized protein2.8e-0544.26Show/hide
Query:  KIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEK
        KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KIP N +  KI  N +  K
Subjt:  KIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEK

Query:  IPKNMEKEKISKNMEKKKIPKN
        IP N +  KI  N +  KIP N
Subjt:  IPKNMEKEKISKNMEKKKIPKN

A0A5N5PE54 Microtubule-associated protein2.8e-0538Show/hide
Query:  MEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNM
        +EK++ PK +E+ + PK + KE+ P+ +EK++ PK +EK++ PK + KE+ PK +EK++ PK +EK++ P+ +E+ + PK +EK++ P+ +EK++  + +
Subjt:  MEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNM

Query:  EKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEKIVP
        EK++ PK +EK+++ K++EK ++PK +EK +   V+    EK E+ K+VP
Subjt:  EKEKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEKIVP

A0A653HNR8 Uncharacterized protein (Fragment)1.5e-0649.18Show/hide
Query:  KNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKIPK
        KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK K  KN+EK + +KN++K    K
Subjt:  KNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKIPK

Query:  NMEKEKISKNMEKKKIPKNMEK
            +   KN+ KK+  KN+ K
Subjt:  NMEKEKISKNMEKKKIPKNMEK

C3YW55 Uncharacterized protein1.3e-0536Show/hide
Query:  KEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEK
        KE++ K + KE +PK + KE+  K + KE +PK + KE +PK + KE++ + + KE +P+ + K+++PK + KE +PK + KE +PK + KE++ + + K
Subjt:  KEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEK

Query:  EKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEKIVPIL
        E +PK + KE++ K + K+ +PK + K E  GV  V  E + KE +  ++
Subjt:  EKIPKNMEKEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEKIVPIL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATAT
GGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGG
AGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAGGAGAAAATATCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAG
AAGGAGAAAATATCGAAGAATATGGAGAAGAAGAAAATACCAAAGAATATGGAGAAGGGAGAAAATTGTGGAGTAATAACGGTGAAGATGGAGAAGATGGAGAAGGAGAA
AATCGTACCCATTTTAAACCGAGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATAT
GGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGG
AGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAGAAGGAGAAAATATCGAAGAATATGGAGAAAGAGAAAATACCGAAGAATATGGAG
AAGGAGAAAATATCGAAGAATATGGAGAAGAAGAAAATACCAAAGAATATGGAGAAGGGAGAAAATTGTGGAGTAATAACGGTGAAGATGGAGAAGATGGAGAAGGAGAA
AATCGTACCCATTTTAAACCGAGGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKIPKNMEKEKISKNMEKEKIPKNME
KEKISKNMEKKKIPKNMEKGENCGVITVKMEKMEKEKIVPILNRG