; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G06100 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G06100
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCone-rod homeobox protein
Genome locationChr3:5253784..5254694
RNA-Seq ExpressionCSPI03G06100
SyntenyCSPI03G06100
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF6271309.1 hypothetical protein mRhiFer1_001731 [Rhinolophus ferrumequinum]4.5e-0441.22Show/hide
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        PGP   PGP L P  GP   G  L P P P P       LGPA GP +         LGPAP        PGP  GP   P + L   P P P LGPA G
Subjt:  PGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGTLGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPPTPRPALGPAFG

Query:  PIPKLVTPLSTGPALG--SGVGEDMEPKPSP
        P P L      G  LG   G G D+ P P P
Subjt:  PIPKLVTPLSTGPALG--SGVGEDMEPKPSP

KFO26263.1 Cone-rod homeobox protein [Fukomys damarensis]1.1e-0542.42Show/hide
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        GP     PGP L P  GP  +G  L P P P+   +G   LGPALGPA     P LG  LGPAP   +    PGP  GP   P+    + P P P LGPA
Subjt:  GPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGT-LGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPPTPRPALGPA

Query:  FGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPS
         GP P        GPALG  +G    P P P+
Subjt:  FGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPS

XP_032846264.1 tetra-peptide repeat homeobox protein 1-like, partial [Tyto alba alba]5.9e-0440.82Show/hide
Query:  PGPYHP--PGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGP--ALGPASILL-TPNLGT-----------LGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSST
        PGP H   P PGL P  GP +     TP+  P+P +     LGP  ALGPA  L  TP LG            LGP P     + TP PA GPG     T
Subjt:  PGPYHP--PGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGP--ALGPASILL-TPNLGT-----------LGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSST

Query:  LLIPPTPRPALGPAFGPIPKLVTPLSTGPALG--SGVGEDMEPKPSP
            PT  P+ GPA GP P L   L  GPA G   G+G    P+P+P
Subjt:  LLIPPTPRPALGPAFGPIPKLVTPLSTGPALG--SGVGEDMEPKPSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A091D725 Cone-rod homeobox protein5.2e-0642.42Show/hide
Query:  GPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGT-LGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPPTPRPALGPA
        GP     PGP L P  GP  +G  L P P P+   +G   LGPALGPA     P LG  LGPAP   +    PGP  GP   P+    + P P P LGPA
Subjt:  GPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGT-LGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPPTPRPALGPA

Query:  FGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPS
         GP P        GPALG  +G    P P P+
Subjt:  FGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPS

A0A0A0L6L6 Uncharacterized protein7.1e-7299.3Show/hide
Query:  MQLLYGSCIIGPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGTLGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPP
        MQLLYGSCIIGPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGTLGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPP
Subjt:  MQLLYGSCIIGPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGTLGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPP

Query:  TPRPALGPAFGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPSS
        TPRPALGPAFGPIPKL+TPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPSS
Subjt:  TPRPALGPAFGPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAATTATTGTACGGTTCTTGTATTATTGGCCCAGGCCCATACCACCCTCCTGGTCCCGGCCTTATCCCCATTTTTGGACCTCCAAATATAGGAGGCAAATTGACTCC
GACTCCGACACCGAGTCCAGTAACAATTGGATCAACACCTTTAGGCCCAGCTCTTGGACCGGCCTCAATACTACTTACCCCTAACTTAGGTACTCTCGGACCAGCACCGA
CATTGCTCATCTCTTCTTTGACTCCTGGGCCAGCTTTCGGTCCAGGATCTGAACCATCATCCACATTACTTATTCCTCCAACTCCTAGGCCAGCTCTCGGTCCGGCTTTC
GGACCGATACCGAAATTGGTCACCCCTCTATCGACTGGGCCAGCACTCGGATCAGGTGTTGGCGAAGACATGGAACCGAAACCAAGTCCATCGTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGTACAAGACAGTATATTAAAGAAGGTTGTACTTAAACATTGCAGCTTTATTTTAATGTTTTTTTCTAAGGTTCTTTTTATTTAAGAGGTGAAATAAGATTATTTAATA
TTTGCATGATCGGAAGGAGCCGGCCGTGAAGAAAACGTATAGATTAGACACCATGTTGGGCCTTCTTAGTGGGCTGAGTCAATGTGAATACCTGGTCCAGATTCACCATG
TTGGGCGGTTTCAACAGACTTGCTTTTGGCCCAATTGATTTTAACATCATGCAATTCCGTAGAAGCCGACAATGGACGAAAGTTATAAGACTCACAAAGTCCATATCCAA
CTTTGCCGCATGCCCAAGGCCTATTTGTTGGACAGACATAGCCCAACATGCAATTATTGTACGGTTCTTGTATTATTGGCCCAGGCCCATACCACCCTCCTGGTCCCGGC
CTTATCCCCATTTTTGGACCTCCAAATATAGGAGGCAAATTGACTCCGACTCCGACACCGAGTCCAGTAACAATTGGATCAACACCTTTAGGCCCAGCTCTTGGACCGGC
CTCAATACTACTTACCCCTAACTTAGGTACTCTCGGACCAGCACCGACATTGCTCATCTCTTCTTTGACTCCTGGGCCAGCTTTCGGTCCAGGATCTGAACCATCATCCA
CATTACTTATTCCTCCAACTCCTAGGCCAGCTCTCGGTCCGGCTTTCGGACCGATACCGAAATTGGTCACCCCTCTATCGACTGGGCCAGCACTCGGATCAGGTGTTGGC
GAAGACATGGAACCGAAACCAAGTCCATCGTCGTAATTGAAGACTCCATTGGCAAAGGTGTAGCTTAAGCAAAGGAAAAGAAAGGGAGAGAGAAGGAAATATTTGAGGGA
AGCCATGGTTTATTTTATGATTTGGATGAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQLLYGSCIIGPGPYHPPGPGLIPIFGPPNIGGKLTPTPTPSPVTIGSTPLGPALGPASILLTPNLGTLGPAPTLLISSLTPGPAFGPGSEPSSTLLIPPTPRPALGPAF
GPIPKLVTPLSTGPALGSGVGEDMEPKPSPSS