; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G15450 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G15450
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr3:11515299..11516624
RNA-Seq ExpressionCSPI03G15450
SyntenyCSPI03G15450
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147637.1 uncharacterized protein LOC101206709 [Cucumis sativus]6.7e-40100Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
XP_008439007.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483930 isoform X3 [Cucumis melo]1.4e-3798.8Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRD PKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
XP_022138108.1 uncharacterized protein LOC111009357 [Momordica charantia]2.1e-3090.36Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ PRD PKKSHSDSEQEKRVDVR+LQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS A  ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
XP_022980000.1 uncharacterized protein LOC111479526 [Cucurbita maxima]3.7e-3090.36Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRD PKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
XP_038898749.1 uncharacterized protein LOC120086267 [Benincasa hispida]3.9e-3291.57Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQN RD PKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS AT  T TCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5H1 Uncharacterized protein3.2e-40100Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
A0A1S3AXS6 uncharacterized protein LOC103483930 isoform X36.7e-3898.8Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRD PKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
A0A5A7U9W0 Uncharacterized protein6.7e-3898.8Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRD PKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
A0A6J1CC51 uncharacterized protein LOC1110093571.0e-3090.36Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ PRD PKKSHSDSEQEKRVDVR+LQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS A  ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
A0A6J1IUX8 uncharacterized protein LOC1114795261.8e-3090.36Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRD PKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48330.1 unknown protein9.3e-1656.34Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSA
        MASWKKTI +PF+KA T FNQ  + +   +    E+ ++  V+ LQG+VMACGYEDV VMWSILD K+NS+
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSA
AT3G17580.1 unknown protein1.1e-1660.26Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKK-------SHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSA
        MASWKKTI +PF+KA T FNQ P+  PKK       + +  E EKR+ V+ LQGEVMACGY+DV VMWSILD K+NS+
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKK-------SHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSA

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTGGAAGAAAACAATCATTTCTCCCTTCAGAAAAGCTTGCACCATCTTCAACCAAAACCCTCGAGATCATCCTAAAAAGTCTCATTCCGACTCAGAGCAAGA
GAAGAGAGTGGATGTGAGGAATCTCCAAGGAGAGGTTATGGCATGTGGGTATGAAGACGTGCATGTGATGTGGTCTATTTTAGATCACAAGGCCAACTCCGCTGCCACCA
CCGCTACCGCTACTTGCAATGTCTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAATAATGATTTGAAGATAAGAAATAAAAAGTTTGTGTTGCTCATCCTTCGGATCTTGCCTACTCATCTTCTTCTCTTTCTCTCTCTTTTTCTTATCTATTGTTTATT
AATAATTCTTTGTGTTCTATATATTGTGACCCATTTCACTTCCAACCCCTTTCAGCCAAACACATTCTCAAACCTCACCAAATTAATATCATTACTATTATTTGTTACTG
CTACAACTACAACAACTCTAATGGCTTCTTGGAAGAAAACAATCATTTCTCCCTTCAGAAAAGCTTGCACCATCTTCAACCAAAACCCTCGAGATCATCCTAAAAAGTCT
CATTCCGACTCAGAGCAAGAGAAGAGAGTGGATGTGAGGAATCTCCAAGGAGAGGTTATGGCATGTGGGTATGAAGACGTGCATGTGATGTGGTCTATTTTAGATCACAA
GGCCAACTCCGCTGCCACCACCGCTACCGCTACTTGCAATGTCTCTTCTTAACAACCACCACCACCACGACCAATGTCTCAGACTATGACTACTGCTTAATTAAATTTGT
TGTAGATAAAGCTTGCTGCTGCTGCTCAATACATGATGATCGATCTCTATGGTATTTTGTGATCAGTTGATGATGATGATGATTTTGTTTATTTAATTATGTGTAGGGAA
TGAATATATAATCAAATGAATCCCCATGATTTGAAGCTCTTAATCATGGTGAGATTTAAGGTTTAAAAAAAACTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
TATTTTCTAGGAAATGGAACCTTATCTCTTGAGGAAAGTGGTTCATCAGATCTGATTGGTTGGTCAGATTTTAGTTATAATTTATGTAAACCACTTCCCAATGTCTTCAT
TTTCAGAAAGAATTCAAGAGAGAAAGAGAAAGAGATAGAGAGTCTTCAATTTTTCAATTTTCTCTTTTGTAAATTACAAATAATATTAATTTTTAGTCATTCATCTTTTT
ATTTTTGTTTTTAGTTAGTTAAGGATATCAATCTTGACATGACATGCAGTATTGTTAATCATTTGCTTTATTATAATAGTAGAATCCGATGTACTCAATATCACTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASWKKTIISPFRKACTIFNQNPRDHPKKSHSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDHKANSAATTATATCNVSS