CuGenDBv2

Gene ID	CSPI03G16430
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	Chr3:12334837..12336683
RNA-Seq Expression	CSPI03G16430
Synteny	CSPI03G16430
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0033596.1 hypothetical protein E6C27_scaffold239G00290 [Cucumis melo var. makuwa]

1.4e-103

95.91

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L +CIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
        LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGA+NSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK

Query:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA

KAG6574142.1 hypothetical protein SDJN03_28029, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

4.1e-84

82.96

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L + IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
        LEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TMG A+NSRV+DSSGVAT+TE TGAK NE+   Q  S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

XP_011651127.1 uncharacterized protein LOC101210795 [Cucumis sativus]

2.7e-107

98.64

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L +CIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
        LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGA+NSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK

Query:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA

XP_022141274.1 uncharacterized protein LOC111011714 [Momordica charantia]

3.8e-85

82.51

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK+ WEAASKVVQ+EE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETG--AKPNENVPNQ--TTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
        LEELKRRMEALN  RVSTSVS+D  T+GGA+NSRVSDSSG  T+TETG  A+ NE+ PNQ  T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQ HGRGKGIG
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETG--AKPNENVPNQ--TTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        AVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

XP_038898541.1 uncharacterized protein LOC120086143 [Benincasa hispida]

2.7e-99

91.82

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L +CIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIE+STERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQ+EEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
        LEELKRRMEALNS+RVSTS+SHDV TMGGA+NSR +DSSGVAT+TETGAK +ENVPN    D APVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK

Query:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L8J1 RAB6-interacting golgin

1.3e-107

98.64

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L +CIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
        LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGA+NSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK

Query:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A5D3DFA0 RAB6-interacting golgin

6.6e-104

95.91

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L +CIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQ+EEA KQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
        LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDV  MGGA+NSRVSDSS VATTTETGAK NENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPK

Query:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
        GRSSADSGWTGSGFDVDGRA
Subjt:  GRSSADSGWTGSGFDVDGRA

A0A6J1CI49 uncharacterized protein LOC111011714

1.8e-85

82.51

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK+ WEAASKVVQ+EE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETG--AKPNENVPNQ--TTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
        LEELKRRMEALN  RVSTSVS+D  T+GGA+NSRVSDSSG  T+TETG  A+ NE+ PNQ  T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQ HGRGKGIG
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETG--AKPNENVPNQ--TTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        AVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1G2D4 uncharacterized protein LOC111450054

2.0e-84

82.96

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L + IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
        LEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TMG A+NSRV+DSSGVAT+TE TGAK NE+   Q  S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1HV58 uncharacterized protein LOC111467736

1.7e-83

82.51

Show/hide

Query:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR
        L + IDEN SKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTER+ AAKLKEEQAKK WEAASKVVQ+EEA KQKLC+DLNHLVQES+N QLTR
Subjt:  LSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTR

Query:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
        LEELKRRMEALNS+RVSTSVS    +  TM  A+NSRV+DSSGVAT+TE TGAK NE+   Q  S  APV+NGQNQKP SETE RGKKKNQFHGRGKGIG
Subjt:  LEELKRRMEALNSSRVSTSVS---HDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTE-TGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
        AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G51840.1 unknown protein

1.9e-47

55.61

Show/hide

Query:  VILSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQL
        V L + I+EN +KIRDVERE  NL+ME+KLT+GPKKAA+E LRKKIE+STER+ AAKLKEE+A+K +EAASKVV++EEA KQ LCEDLN LVQ+SSN Q 
Subjt:  VILSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQL

Query:  TRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG
         RLEELKRR+EALN +R STS+      +       V DS+  A   +T   KP  N  N+             Q+P  +E E + KKK Q  GRG+GIG
Subjt:  TRLEELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTET-GAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKP-PSETEGRGKKKNQFHGRGKGIG

Query:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR
         + KGR     GWTG+GFDVDGR
Subjt:  AVPKGRSSADSGWTGSGFDVDGR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCTTCATGGCCTGGCTTGTTATTTTGTCTAGATGTATTGATGAAAATTTATCTAAAATTCGGGATGTTGAACGGGAATTGGCAAATCTTACAATGGAGATGAAACT
CACATCTGGGCCTAAAAAAGCAGCTCTTGAACTTTTGCGGAAGAAAATAGAAATGTCAACTGAGAGAGTACGTGCAGCTAAGTTGAAGGAAGAACAAGCAAAGAAGGTTT
GGGAAGCAGCATCAAAGGTAGTGCAAGAAGAGGAAGCAGCTAAGCAAAAATTGTGTGAAGACTTGAATCATCTGGTTCAAGAAAGCAGTAACTTCCAGTTGACAAGACTT
GAAGAACTAAAAAGGCGCATGGAAGCGTTGAATTCAAGTCGAGTATCAACCTCTGTTTCTCATGATGTCATGACAATGGGAGGTGCTCGGAATAGCAGAGTGTCAGATTC
TTCTGGAGTTGCTACAACAACAGAAACTGGTGCAAAACCAAATGAAAATGTCCCCAATCAAACAACCAGTGATGCAGCTCCAGTGATAAATGGGCAAAATCAAAAGCCCC
CTTCTGAGACAGAAGGAAGAGGAAAAAAGAAAAATCAGTTTCATGGAAGAGGGAAGGGAATTGGAGCAGTGCCTAAAGGAAGAAGCTCTGCAGACTCTGGCTGGACTGGG
TCTGGATTTGATGTGGATGGTAGAGCATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATTTCCTTAAACTTGAAATGTTCTTCATGGCCTGGCTTGTTATTTTGTCTAGATGTATTGATGAAAATTTATCTAAAATTCGGGATGTTGAACGGGAATTGGCAAATCTT
ACAATGGAGATGAAACTCACATCTGGGCCTAAAAAAGCAGCTCTTGAACTTTTGCGGAAGAAAATAGAAATGTCAACTGAGAGAGTACGTGCAGCTAAGTTGAAGGAAGA
ACAAGCAAAGAAGGTTTGGGAAGCAGCATCAAAGGTAGTGCAAGAAGAGGAAGCAGCTAAGCAAAAATTGTGTGAAGACTTGAATCATCTGGTTCAAGAAAGCAGTAACT
TCCAGTTGACAAGACTTGAAGAACTAAAAAGGCGCATGGAAGCGTTGAATTCAAGTCGAGTATCAACCTCTGTTTCTCATGATGTCATGACAATGGGAGGTGCTCGGAAT
AGCAGAGTGTCAGATTCTTCTGGAGTTGCTACAACAACAGAAACTGGTGCAAAACCAAATGAAAATGTCCCCAATCAAACAACCAGTGATGCAGCTCCAGTGATAAATGG
GCAAAATCAAAAGCCCCCTTCTGAGACAGAAGGAAGAGGAAAAAAGAAAAATCAGTTTCATGGAAGAGGGAAGGGAATTGGAGCAGTGCCTAAAGGAAGAAGCTCTGCAG
ACTCTGGCTGGACTGGGTCTGGATTTGATGTGGATGGTAGAGCATGAGCTTAAGCACTACAAAAATCAAGATCCAAATTGTCAATATCAATATAAAAAATGGTTCTTTTA
TTTGAAAAAAAAATAGTACTAAGTGTTATTTTTTCTCCATGTTCACCTTCAGGCCTCAGATGATGGAGTTGTGAGAATATATATTTGACTGGAATAGAAACTATAGATTT
AGCCCCGAGTTCTTTGGTATTTCCATTTGGCTCGACTTGCTTTAAAAATTTCTGTGTTGTCACTAACTGCTCTGTTAAGTCGATTCGTTTATTGATGGTGAGTTGTGAAG
AGTTGTCTACCATAATTGCTCTCTTTTATTCTTTCACTGAAACAAATGGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFFMAWLVILSRCIDENLSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMSTERVRAAKLKEEQAKKVWEAASKVVQEEEAAKQKLCEDLNHLVQESSNFQLTRL
EELKRRMEALNSSRVSTSVSHDVMTMGGARNSRVSDSSGVATTTETGAKPNENVPNQTTSDAAPVINGQNQKPPSETEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSADSGWTG
SGFDVDGRA

CSPI03G16430 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome