; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G18030 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G18030
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionhomeobox protein HAT3.1
Genome locationChr3:13715601..13721102
RNA-Seq ExpressionCSPI03G18030
SyntenyCSPI03G18030
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001965 - Zinc finger, PHD-type
IPR011011 - Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR019786 - Zinc finger, PHD-type, conserved site
IPR019787 - Zinc finger, PHD-finger


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037202.1 pathogenesis-related homeodomain protein [Cucumis melo var. makuwa]5.1e-17194.08Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRID LCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPE AAAAAGRNSD TLGLPSDDSEDGDYDPD+PDTIDQDNELSSDESSSDQ     SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEG RQESSSSDFTSDSEDLAAL+NNCSSKD DLVSSLNNTLPVKN+NG+SSGP+KS LHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL
        LSSLLDSG DKDGLEP+SGRRQVERLDYKKLHDVSILL
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL

XP_008456177.1 PREDICTED: pathogenesis-related homeodomain protein [Cucumis melo]1.4e-16893.99Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRID LCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPE AAAAAGRNSD TLGLPSDDSEDGDYDPD+PDTIDQDNELSSDESSSDQ     SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEG RQESSSSDFTSDSEDLAAL+NNCSSKD DLVSSLNNTLPVKN+NG+SSGP+KS LHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        LSSLLDSG DKDGLEP+SGRRQVERLDYKKLHD
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

XP_011651230.2 homeobox protein HOX1A [Cucumis sativus]7.6e-183100Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

XP_038876083.1 homeobox protein HAT3.1 isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-16191.94Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIM+RKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITD WEKVYPEAAAAAAG+NSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNE SSDESS   S+SD SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSS--GPNKSALH
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSED+DYDPSVPELDEGVR+ESSSSDFTSDSEDLAALDNN  SKD D VSSLNNTL VKNSNGQSS  GP+KSALH
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSS--GPNKSALH

Query:  NELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        NELSSL      KDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
Subjt:  NELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

XP_038876114.1 homeobox protein HAT3.1 isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-16191.94Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIM+RKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITD WEKVYPEAAAAAAG+NSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNE SSDESS   S+SD SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSS--GPNKSALH
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSED+DYDPSVPELDEGVR+ESSSSDFTSDSEDLAALDNN  SKD D VSSLNNTL VKNSNGQSS  GP+KSALH
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSS--GPNKSALH

Query:  NELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        NELSSL      KDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
Subjt:  NELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LA53 PHD-type domain-containing protein1.4e-185100Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL
        LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL

A0A1S3C283 pathogenesis-related homeodomain protein6.8e-16993.99Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRID LCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPE AAAAAGRNSD TLGLPSDDSEDGDYDPD+PDTIDQDNELSSDESSSDQ     SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEG RQESSSSDFTSDSEDLAAL+NNCSSKD DLVSSLNNTLPVKN+NG+SSGP+KS LHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        LSSLLDSG DKDGLEP+SGRRQVERLDYKKLHD
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

A0A5D3CQ03 Pathogenesis-related homeodomain protein2.5e-17194.08Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRID LCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPE AAAAAGRNSD TLGLPSDDSEDGDYDPD+PDTIDQDNELSSDESSSDQ     SNSDTS
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE
        GYASASEGLEV  NDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEG RQESSSSDFTSDSEDLAAL+NNCSSKD DLVSSLNNTLPVKN+NG+SSGP+KS LHNE
Subjt:  GYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNE

Query:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL
        LSSLLDSG DKDGLEP+SGRRQVERLDYKKLHDVSILL
Subjt:  LSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDVSILL

A0A6J1FNP3 homeobox protein HAT3.16.0e-14983.43Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALC+EGR SE+LFDSEGQIDSEDIFC KCGSKELSLENDIILCDG+CDRGFHQFCLEPPLLN+DIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDC+DLLNEFQGSNLSITDGWEKV+PEAAAAAAG++SDHT+ LPSDDS+DGDYDPDVPD IDQD E  SD SSSDQS+SD S+SD S
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GY--ASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSS-LNNTLPVKNSNGQSS--GPNKS
        GY  ASASE LE   NDDQYLGLPSDDSED+DYDP  P  DEGV QESSSSDFTSDSEDLAAL +N SSKD ++ SS LNNT+PV+NS+GQSS  GPNK+
Subjt:  GY--ASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSS-LNNTLPVKNSNGQSS--GPNKS

Query:  ALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        A HN+LSSL+ SGPD+ GLE VSGRR VERLDYKKLHD
Subjt:  ALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

A0A6J1IPM8 homeobox protein HAT3.1-like1.1e-14783.43Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALC+EGR SE+LFDSEGQIDSEDIFC KCGSKELSLENDIILCDG+CDRGFHQFCLEPPLLN+DIPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
        DDEGWLCPGCDCKDDC+DLLNEFQGSNLSITDGWEKV+PEAAAAAAGR+SDHT+ LPSDDS+DGDYDPDVPD IDQD E SSD SSSDQ     S+SD S
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GY--ASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSS-LNNTLPVKNSNGQSS--GPNKS
        GY  ASASE LE   NDDQYLGLPSDDSED+DYDP  P  DEGV QESSSSDFTSDSEDLAAL +N SSKD ++ SS LNNT PV+NSNGQSS  GPNK+
Subjt:  GY--ASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSS-LNNTLPVKNSNGQSS--GPNKS

Query:  ALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
        A HN+LSSL+ SGPD+ GLE VSGRR VERLDYKKLHD
Subjt:  ALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46605 Homeobox protein HOX1A8.5e-7648.96Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S DK++PEKEL+RA +EI+R KL+IR++F+ ID+L ++G++ E+LFDSEG+I  EDIFC+ CGS + +L NDIILCDG CDRGFHQ CL PPL   DIP 
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
         DEGWLCP CDCK DC+DL+NE  GSN+SI D WEKV+P+AAA A     D    LPSDDS+D D+DP++P    +++ +  DE SS++     S+SD S
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLE--VSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSS--SDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSA
         + + S+  E  +    D  L LPS+DSED+DYDP+ P+ D+ V ++SSS  SDFTSDS+D        S    D VSS    LP            ++ 
Subjt:  GYASASEGLE--VSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSS--SDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSA

Query:  LHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
          +     +++  D+  + P S RRQ ERLDYKKL+D
Subjt:  LHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

P48785 Pathogenesis-related homeodomain protein5.0e-3637.67Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S +K++P+KEL+RA  EI+  KL +RD  +++D L + G + E +  S+G I  + IFCA+C S+E   +NDIILCDG C+R FHQ CL+PPL    IPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD
         D+GW C  CDCK + +D +N   G++  +   W+ ++ E A+   G  +  ++    PSDDS+D DYDP+    + ++   +S   S D    +   S 
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD

Query:  TSGYASASEGLEVSS
        ++  + +S+G+ +S+
Subjt:  TSGYASASEGLEVSS

P48786 Pathogenesis-related homeodomain protein1.1e-8052.68Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S DK+KPEKEL+RA  EI  RKLKIRDLFQR+D   +EGRL E LFDS G+IDSEDIFCAKCGSK+++L NDIILCDG CDRGFHQFCL+PPLL   IPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVY-PEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT
        DDEGWLCPGC+CK DC+ LLN+ Q +N+ + D WEKV+  EAAAAA+G+N D   GLPSDDSED DYDP  PD    D ++  D+SS+D+S+        
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVY-PEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT

Query:  SGYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHN
          Y S S+ ++V    +   GLPSDDSED++YDPS    D+ + ++SS SDFTSDSED   + ++                      G++ GP  S   +
Subjt:  SGYASASEGLEVSSNDDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHN

Query:  ELSSLLDSG-PDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDV
          ++    G P++    P+  RRQVE LDYKKL+D+
Subjt:  ELSSLLDSG-PDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHDV

Q04996 Homeobox protein HAT3.11.0e-8453.69Show/hide
Query:  TSSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIP
        +S +K++PEKEL+RA+ EI+RRKLKIRDLFQ +D LCAEG L ESLFD++G+I SEDIFCAKCGSK+LS++NDIILCDG CDRGFHQ+CLEPPL   DIP
Subjt:  TSSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIP

Query:  PDDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT
        PDDEGWLCPGCDCKDD LDLLN+  G+  S++D WEK++PEAAAA  G   +    LPSDDS+D +YDPD  +  + D + S D   +++S ++  +SD 
Subjt:  PDDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT

Query:  SGYASASEGLEVSSNDDQ-----YLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNK
        + + SAS+ +  S  + +      + LPSDDSED+DYDP  P  D+   +ESS+SD TSD+EDL       +S  GD  +      P+++   Q+S    
Subjt:  SGYASASEGLEVSSNDDQ-----YLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNK

Query:  SALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
         A+   L S  D G D DG   VS RR VERLDYKKL+D
Subjt:  SALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

Q8H991 Homeobox protein HAZ11.7e-7650Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S +K++PEKEL+RA  EI+R K +IR+ F+ +D+L +EG+L ES+FDS G+I SEDIFCA CGSK+++L+NDIILCDGICDRGFHQ+CL PPLL  DIP 
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS
         DEGWLCP CDCK DC+D+LNE QG  LSI D WEKV+PEAA+   G        LPSDDS D DYDP +      D E SS E   +  +SD S+S+ S
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTS

Query:  GYASASEGLEVSSN----DDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSS-----SDFTSDSEDLAA-LDNNCSSKD-GDLVSSLNNTLPVKNSNGQS
          +S  E  + S N    DD  LGLPS+DSED D+DP+ P+ D+    ES+S     SDFTSDS+D  A +  +C   +     SS   T+   + +G  
Subjt:  GYASASEGLEVSSN----DDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSS-----SDFTSDSEDLAA-LDNNCSSKD-GDLVSSLNNTLPVKNSNGQS

Query:  SGPNKSALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
          PN     N   + +++  ++D + P+S +RQVERLDYKKL++
Subjt:  SGPNKSALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G19510.1 Homeodomain-like protein with RING/FYVE/PHD-type zinc finger domain7.1e-8653.69Show/hide
Query:  TSSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIP
        +S +K++PEKEL+RA+ EI+RRKLKIRDLFQ +D LCAEG L ESLFD++G+I SEDIFCAKCGSK+LS++NDIILCDG CDRGFHQ+CLEPPL   DIP
Subjt:  TSSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIP

Query:  PDDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT
        PDDEGWLCPGCDCKDD LDLLN+  G+  S++D WEK++PEAAAA  G   +    LPSDDS+D +YDPD  +  + D + S D   +++S ++  +SD 
Subjt:  PDDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDT

Query:  SGYASASEGLEVSSNDDQ-----YLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNK
        + + SAS+ +  S  + +      + LPSDDSED+DYDP  P  D+   +ESS+SD TSD+EDL       +S  GD  +      P+++   Q+S    
Subjt:  SGYASASEGLEVSSNDDQ-----YLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNK

Query:  SALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD
         A+   L S  D G D DG   VS RR VERLDYKKL+D
Subjt:  SALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVERLDYKKLHD

AT4G29940.1 pathogenesis related homeodomain protein A3.6e-3737.67Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S +K++P+KEL+RA  EI+  KL +RD  +++D L + G + E +  S+G I  + IFCA+C S+E   +NDIILCDG C+R FHQ CL+PPL    IPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD
         D+GW C  CDCK + +D +N   G++  +   W+ ++ E A+   G  +  ++    PSDDS+D DYDP+    + ++   +S   S D    +   S 
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD

Query:  TSGYASASEGLEVSS
        ++  + +S+G+ +S+
Subjt:  TSGYASASEGLEVSS

AT4G29940.2 pathogenesis related homeodomain protein A3.6e-3737.67Show/hide
Query:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP
        S +K++P+KEL+RA  EI+  KL +RD  +++D L + G + E +  S+G I  + IFCA+C S+E   +NDIILCDG C+R FHQ CL+PPL    IPP
Subjt:  SSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPP

Query:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD
         D+GW C  CDCK + +D +N   G++  +   W+ ++ E A+   G  +  ++    PSDDS+D DYDP+    + ++   +S   S D    +   S 
Subjt:  DDEGWLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNS--DHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSD

Query:  TSGYASASEGLEVSS
        ++  + +S+G+ +S+
Subjt:  TSGYASASEGLEVSS

AT5G09790.1 ARABIDOPSIS TRITHORAX-RELATED PROTEIN 52.8e-0538.24Show/hide
Query:  DSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPPDDEGWLCPGCDCKD
        + E +    ++ C KCGS E   +++++LCD  CDRGFH  CL P ++   I      WLC   DC D
Subjt:  DSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPPDDEGWLCPGCDCKD

AT5G09790.2 ARABIDOPSIS TRITHORAX-RELATED PROTEIN 52.8e-0538.24Show/hide
Query:  DSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPPDDEGWLCPGCDCKD
        + E +    ++ C KCGS E   +++++LCD  CDRGFH  CL P ++   I      WLC   DC D
Subjt:  DSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPPDDEGWLCPGCDCKD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTTCTTCACTACCAGCTCAGATAAATTGAAGCCCGAAAAGGAACTTCAGCGAGCATCAAATGAAATAATGCGACGCAAATTGAAAATAAGAGATCTATTTCAACG
TATTGATGCCCTTTGTGCTGAAGGGAGGCTTTCTGAATCTTTATTCGATTCTGAAGGACAGATAGACAGCGAGGATATATTCTGTGCAAAATGTGGATCCAAAGAACTGT
CCCTTGAGAATGACATCATATTATGCGATGGCATTTGTGATCGTGGGTTCCATCAGTTCTGTTTAGAACCACCTTTGCTAAACACAGACATTCCGCCGGATGATGAGGGA
TGGCTGTGCCCTGGATGTGATTGCAAAGATGACTGCTTAGATCTTCTCAATGAATTTCAAGGATCAAATCTTTCAATCACTGATGGTTGGGAGAAAGTCTATCCTGAGGC
GGCAGCAGCAGCAGCTGGACGAAATTCTGATCACACCTTAGGTCTTCCTTCAGATGATTCTGAAGATGGTGATTATGATCCTGATGTTCCAGATACCATTGACCAGGACA
ATGAATTGAGTTCTGATGAATCAAGTTCTGATCAATCTAACTCTGATCCGTCAAACTCTGATACATCTGGTTATGCTTCTGCTTCTGAGGGATTAGAGGTTTCATCTAAT
GATGACCAGTACTTAGGTCTCCCTTCTGATGACTCGGAGGATAATGACTATGATCCCAGTGTTCCAGAACTTGATGAGGGTGTTAGACAGGAAAGCTCAAGTTCTGACTT
TACATCTGATTCTGAGGATCTAGCTGCCCTTGACAATAACTGTTCTTCGAAAGATGGTGACCTTGTGTCTTCATTAAATAATACTTTGCCTGTCAAAAACTCTAATGGGC
AAAGTTCCGGTCCCAACAAGAGTGCACTACATAATGAGTTATCAAGTCTACTAGACTCTGGTCCTGATAAGGATGGTCTTGAGCCTGTTTCGGGAAGAAGGCAGGTTGAA
CGGTTGGATTATAAGAAGCTCCATGATGTGAGTATTCTCTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCTTCTTCACTACCAGCTCAGATAAATTGAAGCCCGAAAAGGAACTTCAGCGAGCATCAAATGAAATAATGCGACGCAAATTGAAAATAAGAGATCTATTTCAACG
TATTGATGCCCTTTGTGCTGAAGGGAGGCTTTCTGAATCTTTATTCGATTCTGAAGGACAGATAGACAGCGAGGATATATTCTGTGCAAAATGTGGATCCAAAGAACTGT
CCCTTGAGAATGACATCATATTATGCGATGGCATTTGTGATCGTGGGTTCCATCAGTTCTGTTTAGAACCACCTTTGCTAAACACAGACATTCCGCCGGATGATGAGGGA
TGGCTGTGCCCTGGATGTGATTGCAAAGATGACTGCTTAGATCTTCTCAATGAATTTCAAGGATCAAATCTTTCAATCACTGATGGTTGGGAGAAAGTCTATCCTGAGGC
GGCAGCAGCAGCAGCTGGACGAAATTCTGATCACACCTTAGGTCTTCCTTCAGATGATTCTGAAGATGGTGATTATGATCCTGATGTTCCAGATACCATTGACCAGGACA
ATGAATTGAGTTCTGATGAATCAAGTTCTGATCAATCTAACTCTGATCCGTCAAACTCTGATACATCTGGTTATGCTTCTGCTTCTGAGGGATTAGAGGTTTCATCTAAT
GATGACCAGTACTTAGGTCTCCCTTCTGATGACTCGGAGGATAATGACTATGATCCCAGTGTTCCAGAACTTGATGAGGGTGTTAGACAGGAAAGCTCAAGTTCTGACTT
TACATCTGATTCTGAGGATCTAGCTGCCCTTGACAATAACTGTTCTTCGAAAGATGGTGACCTTGTGTCTTCATTAAATAATACTTTGCCTGTCAAAAACTCTAATGGGC
AAAGTTCCGGTCCCAACAAGAGTGCACTACATAATGAGTTATCAAGTCTACTAGACTCTGGTCCTGATAAGGATGGTCTTGAGCCTGTTTCGGGAAGAAGGCAGGTTGAA
CGGTTGGATTATAAGAAGCTCCATGATGTGAGTATTCTCTTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFFFTTSSDKLKPEKELQRASNEIMRRKLKIRDLFQRIDALCAEGRLSESLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKELSLENDIILCDGICDRGFHQFCLEPPLLNTDIPPDDEG
WLCPGCDCKDDCLDLLNEFQGSNLSITDGWEKVYPEAAAAAAGRNSDHTLGLPSDDSEDGDYDPDVPDTIDQDNELSSDESSSDQSNSDPSNSDTSGYASASEGLEVSSN
DDQYLGLPSDDSEDNDYDPSVPELDEGVRQESSSSDFTSDSEDLAALDNNCSSKDGDLVSSLNNTLPVKNSNGQSSGPNKSALHNELSSLLDSGPDKDGLEPVSGRRQVE
RLDYKKLHDVSILL