| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| TYK01611.1 THO complex subunit 4D [Cucumis melo var. makuwa] | 9.5e-101 | 86.84 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK----------------------------PPHRMK
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK PPHRMK
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK----------------------------PPHRMK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Query: GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 5.7e-106 | 100 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 2.9e-105 | 99 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 2.0e-98 | 93 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 9.5e-101 | 94.5 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGV+KEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 2.8e-106 | 100 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 1.4e-105 | 99 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 4.6e-101 | 86.84 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK----------------------------PPHRMK
MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK PPHRMK
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRK----------------------------PPHRMK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Query: GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
Subjt: GDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 9.6e-99 | 93 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 9.6e-99 | 93 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGTNGRNRRTVVLT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 1.1e-30 | 43.09 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
M +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GV G GP+ + AR + P R K + +WQHDLF+ A +
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPHRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
Query: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
G++ G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G +K+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I+++
Subjt: GIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 1.3e-60 | 59.31 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVL
TVV+
Subjt: TVVL
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 1.7e-39 | 49.21 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMP
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDIKELFSE+GD+KR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMP
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 4.5e-37 | 47.51 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
M+T LDMSL+D+I KN ++RG A RG G G + R P + R++ Y K P W HD+F ED +GI+ G
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIQIG
Query: TKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE
TKLY+SNLDYGV EDIKELF+E+G++KR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt: TKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 5.7e-56 | 54.72 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVL
G NGR +R+V +
Subjt: GTNGRNRRTVVL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.0e-57 | 54.72 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVL
G NGR +R+V +
Subjt: GTNGRNRRTVVL
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.0e-57 | 54.72 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K R +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPHRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+++GT +Y++NLD GVT EDI+EL++EIG++KR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GTNGRNRRTVVL
G NGR +R+V +
Subjt: GTNGRNRRTVVL
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-40 | 49.21 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMP
G S I+ GTKLY+SNLDYGV+ EDIKELFSE+GD+KR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P
Subjt: GISGIQIGTKLYVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMP
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 9.3e-62 | 59.31 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVL
TVV+
Subjt: TVVL
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 9.3e-62 | 59.31 | Show/hide |
Query: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP R++++ WQ LFED LRA+G SG+++GT+L
Subjt: MTTPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPHRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIQIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
+V+NLD GVT EDI+ELFSEIG+V+R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIKELFSEIGDVKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGTNGRNRR
Query: TVVL
TVV+
Subjt: TVVL
|
|
