CuGenDBv2

Gene ID	CSPI03G21390
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	Chr3:17635037..17636755
RNA-Seq Expression	CSPI03G21390
Synteny	CSPI03G21390
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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1.7e-96

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A0A0A0L741 Uncharacterized protein

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A0A1S3C467 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X1

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A0A1S3C4K4 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X3

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A0A1S3C4P1 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X2

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A0A6J1IZQ5 uncharacterized protein LOC111482129

2.3e-62

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        MAS LFLL L TIS S+ S ARPCKSLF+SFSL RHRTLDS  HPFS+MA+IVDITEFKSSS S            P DIL  DLPRP P S   QHFPY
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT1G65720.1 unknown protein

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        M S  +L F   +    S +  + ARPCK+ FL  S     T ++P+  S       +T F                 +P  ++ F + R    P   S 
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        +  P    +  S RDRT+DILSVVVALLFGVGCGALTAATMYL ++L   +  +      DF E+EDD  +D  +  ++KK+GY+ IP    APVK
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGTCGCCTCTCTTTCTCCTCTTTCTCTTCACAATTTCCTTCTCAATTCCATCTCAAGCTCGTCCTTGCAAATCCCTTTTCCTTTCCTTTTCCCTTCACCGTCACCG
AACCCTCGATTCCCCCCATCCCTTCTCCCAGATGGCCATTATCGTCGACATCACCGAATTCAAATCTTCCTCCTTTTCCTCTTCTCCCGATCCCCTTTTCCCCTCCGTCG
CCGACCCCACCGACATCCTCCGCTTCGATCTCCCTCGTCCTACCCCTGTTTCAGCATCAACCCAACACTTCCCTTACGATTTCACCTCTCTCCGTGATCGCACCAAGGAT
ATTCTCAGCGTTGTTGTCGCTTTGCTCTTCGGCGTTGGCTGTGGCGCTCTCACTGCTGCCACTATGTATTTGGCTTACTCTTTGTTTGCTGGTCAATTTGGGCATCGCTC
CTCTGTGTATGATGACTTTGGGGAGGATGAGGATGATCTCAGTGATGATAACAAGGAGAATATTAAGAAGATGGGTTATATCAACATCCCTGACGACGTTGCCCCCGTTA
AATCAGTGGGTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GAAAAATTATAATTTATTTGTGTAGTTTGAAAATGAAAAAAAGAAGTTGTAAAATGGTAAGAGAAAGAAAAGAAAAGAAAATGTGAATGGTTATGATCCATTGGTGAAAG
GGAAGGCGAAGGGGACGGGGGAGGATAGAGAGAGAAGAAAAGATAGGACTGAATTGAATCGACACACAAACAATCAAAACACTTAACAAAGTCTTCTCTCTTCCATTCTC
TTCTCTCAAACCCAAACAAAAAACTTTTTCTCCTTTCTTCAAACCCTTCATCCATGGCGTCGCCTCTCTTTCTCCTCTTTCTCTTCACAATTTCCTTCTCAATTCCATCT
CAAGCTCGTCCTTGCAAATCCCTTTTCCTTTCCTTTTCCCTTCACCGTCACCGAACCCTCGATTCCCCCCATCCCTTCTCCCAGATGGCCATTATCGTCGACATCACCGA
ATTCAAATCTTCCTCCTTTTCCTCTTCTCCCGATCCCCTTTTCCCCTCCGTCGCCGACCCCACCGACATCCTCCGCTTCGATCTCCCTCGTCCTACCCCTGTTTCAGCAT
CAACCCAACACTTCCCTTACGATTTCACCTCTCTCCGTGATCGCACCAAGGATATTCTCAGCGTTGTTGTCGCTTTGCTCTTCGGCGTTGGCTGTGGCGCTCTCACTGCT
GCCACTATGTATTTGGCTTACTCTTTGTTTGCTGGTCAATTTGGGCATCGCTCCTCTGTGTATGATGACTTTGGGGAGGATGAGGATGATCTCAGTGATGATAACAAGGA
GAATATTAAGAAGATGGGTTATATCAACATCCCTGACGACGTTGCCCCCGTTAAATCAGTGGGTTAGACAACGTGCACGGTGTGCTCAGCAGATATTTTAGCTGGAGGAT
CCCTACTTAACTGTTGACTTGTGTTGGACTTCATCAGCCCTTCCCTTATATATGCTCTCTTTTCAGTTCAACTTTTTTTAATTAATTTTTTAATCTATTTACAGGGACCT
GTATTTTTAGACCTCTCTAATGGTTACTTCTTCACAAAATTATTAATTTAAGGTTAAGTATTCCTCATGTGATGGCATGATAAAAGTTTCATTTCATTTTGGTTTTATAC
TG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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ILSVVVALLFGVGCGALTAATMYLAYSLFAGQFGHRSSVYDDFGEDEDDLSDDNKENIKKMGYINIPDDVAPVKSVG

CSPI03G21390 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome