; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G21990 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G21990
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionWRKY domain-containing protein
Genome locationChr3:18436030..18437596
RNA-Seq ExpressionCSPI03G21990
SyntenyCSPI03G21990
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK03137.1 putative WRKY transcription factor 53 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-15572.95Show/hide
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XP_008465380.1 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 53 [Cucumis melo]2.7e-17780.45Show/hide
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XP_011651414.1 probable WRKY transcription factor 53 [Cucumis sativus]2.8e-19084.88Show/hide
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XP_038901909.1 probable WRKY transcription factor 53 isoform X1 [Benincasa hispida]2.9e-13967.87Show/hide
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        MA+EGSLDDGF WRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQ CLA+KQVQRSDDD T+FEITYRGKHSCSQVSNLS P TT PEFQ QNQGVV  + DQKK 
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XP_038901918.1 probable WRKY transcription factor 53 isoform X2 [Benincasa hispida]9.7e-13566.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LB14 WRKY domain-containing protein1.3e-19084.88Show/hide
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A0A1S3CNR6 probable WRKY transcription factor 531.3e-17780.45Show/hide
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A0A5A7U7U7 Putative WRKY transcription factor 531.3e-17780.45Show/hide
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A0A5D3BUI3 Putative WRKY transcription factor 536.3e-15672.95Show/hide
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A0A6J1E4E2 probable WRKY transcription factor 53 isoform X13.9e-11360.93Show/hide
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              ++++ SSSSSSS S+DG ELLVQKI+ SYEKALSLL+S G+QI  ESPSS N GSPRSEDSDREFKD  D TNA+S R RNILPTWTQKFQVSP
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Query:  AHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLDTT-------PLSY---------DRVEFASASTVDVNFAEFS---SFLSPTTSGSGLSYFSASSSGLSEGFVGNQ
          NQQT+PDALL SW SLRVIT+NLDT        P +Y         DRVE  S    +VNF+EFS    FLSPTTSGSGLSYFSASSSGLSEGF+G+ 
Subjt:  AHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLDTT-------PLSY---------DRVEFASASTVDVNFAEFS---SFLSPTTSGSGLSYFSASSSGLSEGFVGNQ

Query:  NLNNLQPNN---CEIFSSPTSALNTQTTTALDFSFGELQMEPTFSFDNTHFFS
           +LQPN     EIFSSPTSA N+  T  LDF FGELQMEPTF+F NT+FFS
Subjt:  NLNNLQPNN---CEIFSSPTSALNTQTTTALDFSFGELQMEPTFSFDNTHFFS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8H0Y8 Probable WRKY transcription factor 414.7e-3146.63Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQ----------------IMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILP
        SSS S S+SSS  +++  E L+  I+ S++KA+ +LN    Q                 +  SP+S   G+PRSE+        F+L    S +KR +LP
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQ----------------IMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILP

Query:  TWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE
         WT++ ++SP   +EG  DD F+WRKYGQK ILGAK PR YYRCT RN Q C ATKQVQRSD DPTIFE+TYRG H+CSQ   L     T P+
Subjt:  TWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE

Q9FL62 Probable WRKY transcription factor 302.4e-3544.5Show/hide
Query:  SSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRK
        S+SS +  E L +KI+ SY K+L+++N  G         S  GGSP+S+DSD+E   P  + ++     +  +P W+ K +++PG  ++ +LDDGF+WRK
Subjt:  SSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRK

Query:  YGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLST--PCTTTPEFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQ
        YGQK ILGAK PRGYYRCT+R  QGC ATKQVQRSD++  + EI+YRG HSCSQ +N+ T  P       Q Q  G +  + +    +N Q
Subjt:  YGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLST--PCTTTPEFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQ

Q9SKD9 Probable WRKY transcription factor 465.2e-2233.2Show/hide
Query:  SSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGS---PRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIE-GSLDDGFA
        +SS D  + L+  I+  Y+ A+ +L             SFN       RS + D +        + N F+KR +    T+K +V      E GS+DDG  
Subjt:  SSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGS---PRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIE-GSLDDGFA

Query:  WRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPEFQQQN--QGVVVELTDQKKAHNQQTAPDAL
        WRKYGQK I G+K+PR YYRCTHR  Q CLA KQVQ+SD DP++FE+ Y G H+C+ +++  T    +      N  +G  V +T+Q +   + T  + +
Subjt:  WRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPEFQQQN--QGVVVELTDQKKAHNQQTAPDAL

Query:  LDSWSSLRVITQNLDTTPLSYDRVEFASASTVDVNFAEFSSFLSPTTSGSGLS
        + S   L        T   S   +E     + ++    F   LSP TSGS ++
Subjt:  LDSWSSLRVITQNLDTTPLSYDRVEFASASTVDVNFAEFSSFLSPTTSGSGLS

Q9SUP6 Probable WRKY transcription factor 531.2e-3443.85Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLN---SYGVQI---------------MYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNAN-------S
        S SSS SS +++ ++  E+LV++I+ SYE++L LLN   S  VQ+               + ESP+S N GSPRSE    EF D    + ++       +
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLN---SYGVQI---------------MYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNAN-------S

Query:  FRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTP
         +KR +LP W++K ++SP   +EG  DD F+WRKYGQK ILGAK PR YYRCTHR+ Q C ATKQVQRSD D T+FE+TYRG H+CSQ     TP   +P
Subjt:  FRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTP

Query:  EFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLD
        E ++Q+  V   +T + K        D L    S+L V T  LD
Subjt:  EFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G46400.1 WRKY DNA-binding protein 463.7e-2333.2Show/hide
Query:  SSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGS---PRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIE-GSLDDGFA
        +SS D  + L+  I+  Y+ A+ +L             SFN       RS + D +        + N F+KR +    T+K +V      E GS+DDG  
Subjt:  SSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGS---PRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIE-GSLDDGFA

Query:  WRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPEFQQQN--QGVVVELTDQKKAHNQQTAPDAL
        WRKYGQK I G+K+PR YYRCTHR  Q CLA KQVQ+SD DP++FE+ Y G H+C+ +++  T    +      N  +G  V +T+Q +   + T  + +
Subjt:  WRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPEFQQQN--QGVVVELTDQKKAHNQQTAPDAL

Query:  LDSWSSLRVITQNLDTTPLSYDRVEFASASTVDVNFAEFSSFLSPTTSGSGLS
        + S   L        T   S   +E     + ++    F   LSP TSGS ++
Subjt:  LDSWSSLRVITQNLDTTPLSYDRVEFASASTVDVNFAEFSSFLSPTTSGSGLS

AT4G11070.1 WRKY family transcription factor3.3e-3246.63Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQ----------------IMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILP
        SSS S S+SSS  +++  E L+  I+ S++KA+ +LN    Q                 +  SP+S   G+PRSE+        F+L    S +KR +LP
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQ----------------IMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILP

Query:  TWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE
         WT++ ++SP   +EG  DD F+WRKYGQK ILGAK PR YYRCT RN Q C ATKQVQRSD DPTIFE+TYRG H+CSQ   L     T P+
Subjt:  TWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE

AT4G11070.2 WRKY family transcription factor2.3e-3355.73Show/hide
Query:  SPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSD
        SP+S   G+PRSE+        F+L    S +KR +LP WT++ ++SP   +EG  DD F+WRKYGQK ILGAK PR YYRCT RN Q C ATKQVQRSD
Subjt:  SPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSD

Query:  DDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE
         DPTIFE+TYRG H+CSQ   L     T P+
Subjt:  DDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPE

AT4G23810.1 WRKY family transcription factor8.4e-3643.85Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLN---SYGVQI---------------MYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNAN-------S
        S SSS SS +++ ++  E+LV++I+ SYE++L LLN   S  VQ+               + ESP+S N GSPRSE    EF D    + ++       +
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLN---SYGVQI---------------MYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNAN-------S

Query:  FRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTP
         +KR +LP W++K ++SP   +EG  DD F+WRKYGQK ILGAK PR YYRCTHR+ Q C ATKQVQRSD D T+FE+TYRG H+CSQ     TP   +P
Subjt:  FRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTP

Query:  EFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLD
        E ++Q+  V   +T + K        D L    S+L V T  LD
Subjt:  EFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLD

AT5G24110.1 WRKY DNA-binding protein 301.7e-3644.5Show/hide
Query:  SSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRK
        S+SS +  E L +KI+ SY K+L+++N  G         S  GGSP+S+DSD+E   P  + ++     +  +P W+ K +++PG  ++ +LDDGF+WRK
Subjt:  SSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRK

Query:  YGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLST--PCTTTPEFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQ
        YGQK ILGAK PRGYYRCT+R  QGC ATKQVQRSD++  + EI+YRG HSCSQ +N+ T  P       Q Q  G +  + +    +N Q
Subjt:  YGQKGILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLST--PCTTTPEFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAACTTTGGGGAATGGGATCAGAACAAGCTAAAAAATGAGTTACTTAAAGGGATGGAATTAGCAAAGCAACTCCAAATTCAACTCAATGTGAGACCAACACCATC
ATCATCCATGGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAGTGATGGTTGTGAATTATTAGTTCAAAAGATTATATGTTCATATGAAAAGGCACTGTCTTTGCTTAACTCATACGGAGTTCA
AATAATGTATGAATCTCCTTCCTCTTTCAATGGTGGAAGTCCAAGGAGTGAAGATTCTGACCGTGAATTTAAAGACCCATTTGATCTAACCAATGCTAATTCTTTTCGCA
AAAGGAACATTCTTCCAACATGGACACAGAAATTCCAAGTTAGTCCTGGGATGGCCATTGAAGGGTCTCTTGATGATGGATTTGCCTGGAGGAAATATGGTCAAAAAGGG
ATTCTTGGTGCCAAACATCCAAGAGGGTATTACAGATGCACACACAGGAACCTCCAAGGTTGTCTAGCAACCAAACAAGTTCAACGATCCGACGACGACCCGACCATCTT
CGAAATAACGTACAGAGGGAAGCATAGCTGCAGCCAAGTTTCAAACCTCAGCACTCCATGTACAACAACACCAGAGTTTCAACAACAAAATCAGGGTGTAGTAGTAGAAT
TAACTGACCAAAAAAAGGCCCATAACCAACAAACAGCACCTGATGCTCTCTTGGACTCATGGTCATCCTTAAGAGTCATAACTCAAAACCTTGACACAACTCCTTTGAGC
TATGACCGTGTCGAGTTTGCTTCAGCGTCGACTGTGGACGTGAACTTCGCCGAGTTTTCTTCATTCTTGTCCCCAACAACATCTGGTTCTGGGTTGAGCTATTTCTCTGC
CTCATCAAGTGGGTTGAGTGAAGGGTTTGTTGGGAATCAGAATTTGAATAATTTGCAGCCAAACAATTGTGAGATTTTTTCCTCACCAACTTCAGCTTTAAACACTCAAA
CTACTACCGCCTTAGATTTCTCTTTTGGCGAACTTCAAATGGAACCAACTTTTTCATTTGACAACACACACTTCTTCTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAACTTTGGGGAATGGGATCAGAACAAGCTAAAAAATGAGTTACTTAAAGGGATGGAATTAGCAAAGCAACTCCAAATTCAACTCAATGTGAGACCAACACCATC
ATCATCCATGGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAGTGATGGTTGTGAATTATTAGTTCAAAAGATTATATGTTCATATGAAAAGGCACTGTCTTTGCTTAACTCATACGGAGTTCA
AATAATGTATGAATCTCCTTCCTCTTTCAATGGTGGAAGTCCAAGGAGTGAAGATTCTGACCGTGAATTTAAAGACCCATTTGATCTAACCAATGCTAATTCTTTTCGCA
AAAGGAACATTCTTCCAACATGGACACAGAAATTCCAAGTTAGTCCTGGGATGGCCATTGAAGGGTCTCTTGATGATGGATTTGCCTGGAGGAAATATGGTCAAAAAGGG
ATTCTTGGTGCCAAACATCCAAGAGGGTATTACAGATGCACACACAGGAACCTCCAAGGTTGTCTAGCAACCAAACAAGTTCAACGATCCGACGACGACCCGACCATCTT
CGAAATAACGTACAGAGGGAAGCATAGCTGCAGCCAAGTTTCAAACCTCAGCACTCCATGTACAACAACACCAGAGTTTCAACAACAAAATCAGGGTGTAGTAGTAGAAT
TAACTGACCAAAAAAAGGCCCATAACCAACAAACAGCACCTGATGCTCTCTTGGACTCATGGTCATCCTTAAGAGTCATAACTCAAAACCTTGACACAACTCCTTTGAGC
TATGACCGTGTCGAGTTTGCTTCAGCGTCGACTGTGGACGTGAACTTCGCCGAGTTTTCTTCATTCTTGTCCCCAACAACATCTGGTTCTGGGTTGAGCTATTTCTCTGC
CTCATCAAGTGGGTTGAGTGAAGGGTTTGTTGGGAATCAGAATTTGAATAATTTGCAGCCAAACAATTGTGAGATTTTTTCCTCACCAACTTCAGCTTTAAACACTCAAA
CTACTACCGCCTTAGATTTCTCTTTTGGCGAACTTCAAATGGAACCAACTTTTTCATTTGACAACACACACTTCTTCTCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENFGEWDQNKLKNELLKGMELAKQLQIQLNVRPTPSSSMAAAAASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSDGCELLVQKIICSYEKALSLLNSYGVQIMYESPSSFNGGSPRSEDSDREFKDPFDLTNANSFRKRNILPTWTQKFQVSPGMAIEGSLDDGFAWRKYGQKG
ILGAKHPRGYYRCTHRNLQGCLATKQVQRSDDDPTIFEITYRGKHSCSQVSNLSTPCTTTPEFQQQNQGVVVELTDQKKAHNQQTAPDALLDSWSSLRVITQNLDTTPLS
YDRVEFASASTVDVNFAEFSSFLSPTTSGSGLSYFSASSSGLSEGFVGNQNLNNLQPNNCEIFSSPTSALNTQTTTALDFSFGELQMEPTFSFDNTHFFS