; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G23220 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G23220
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationChr3:20018808..20021808
RNA-Seq ExpressionCSPI03G23220
SyntenyCSPI03G23220
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0055072 - iron ion homeostasis (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily
IPR044818 - Transcription factor ILR3-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151959.3 LOW QUALITY PROTEIN: transcription factor ILR3 [Cucumis sativus]6.5e-12599.57Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLR DRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL

Query:  VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_004151962.3 transcription factor ILR3 [Cucumis sativus]4.3e-12196.6Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSWPIQPFNG+HDSGVEIDGSLADLDG LESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLR ET+KLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_008454558.1 PREDICTED: transcription factor ILR3 isoform X1 [Cucumis melo]4.5e-11895.32Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSF+W IQPFNGAHD+GVEIDGSLAD+DGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSET KLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFL PPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PF+GYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_008454561.1 PREDICTED: transcription factor ILR3-like [Cucumis melo]1.6e-12096.6Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSW IQ FNGAHD+GVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_031745357.1 transcription factor ILR3-like, partial [Cucumis sativus]5.5e-124100Show/hide
Query:  PENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILD
        PENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILD
Subjt:  PENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILD

Query:  PGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPF
        PGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPF
Subjt:  PGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPF

Query:  IGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        IGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  IGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L7N8 BHLH domain-containing protein3.2e-12297.45Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSWPIQPFNG+HDSGVEIDGSLADLDG LESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A0A0L7P5 BHLH domain-containing protein2.1e-12197.44Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSWPIQPFNG+HDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKN    EKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKL

Query:  VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  VPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A1S3BYW4 transcription factor ILR3-like8.0e-12196.6Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSW IQ FNGAHD+GVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A5A7TUD2 Transcription factor ILR3 isoform X12.2e-11895.32Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSF+W IQPFNGAHD+GVEIDGSLAD+DGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSET KLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFL PPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PF+GYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A5D3BHU4 Transcription factor ILR3-like8.0e-12196.6Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPV SSSFSW IQ FNGAHD+GVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK
        ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA GNK
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQA-GNK

Query:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        L PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  LVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L467 Transcription factor bHLH1042.1e-3854.39Show/hide
Query:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKA
        S+KR R+ SCS    +KACRE+LRR++LN++F++L S+L+PGR PKTDK AIL DA+R++NQLR E  KL+E+N  L E+IK LKAEKNELR+EK  LKA
Subjt:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKA

Query:  DKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        DKE+ EQQ+KS+ A   GF+P     F     A   + P  GY P   MW +MP +  DTS+D  LRPP A
Subjt:  DKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9C682 Transcription factor bHLH1153.4e-6862.87Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPEN NWL DY LIE      G F   + +F W I   +G+    VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAG
        +L+PGR PKTDK AI+ DA+RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEKIKELK EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ+K+I   P  QP FLP P     AQ   G
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAG

Query:  NKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        +KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  NKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9FH37 Transcription factor ILR34.1e-7465.56Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPI-QPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG
        MVSPEN NW+ D      I    G+F +    FSWP+ QP   + +S   +DGS  + +   E GSKKR R +S SA+SSKACREK RRDRLNDKF+ELG
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPI-QPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG

Query:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFP-----AQG
        +IL+PG PPKTDKAAILVDAVRMV QLR E QKLK+SNSSLQ+KIKELK EKNELRDEKQRLK +KE+LEQQ+K++ A QP F P P P  P     AQG
Subjt:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFP-----AQG

Query:  QA-GNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QA GNK+VP I Y P VAMWQFMPPA+VDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QA-GNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9LT23 Transcription factor bHLH1211.0e-1635.42Show/hide
Query:  DSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERL---
        D  +  S KA REKLRR++LN+ F+ELG++LDP R PK DKA IL D V+++ +L SE  KLK   ++L ++ +EL  EKN+LR+EK  LK+D E L   
Subjt:  DSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERL---

Query:  -EQQVKSIP------------------------AQQPGFLP--PPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQD-HVLRPP
         +Q+++S+                         A  PG +P  P +P++   G     ++P     P      +MPP  V   Q  H+ + P
Subjt:  -EQQVKSIP------------------------AQQPGFLP--PPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQD-HVLRPP

Q9LTC7 Transcription factor bHLH341.9e-3954.6Show/hide
Query:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRL
        E  S KR R+ SCS   +KACREKLRR++LNDKF++L S+L+PGR PKTDK+AIL DA+R+VNQLR E  +L+E+N  L E+IK LKA+KNELR+EK  L
Subjt:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRL

Query:  KADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIP-TFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        KA+KE++EQQ+KS+    PGF+P   P  F +   A     P+  Y P++ MW  +PPA  DTS+D    PPVA
Subjt:  KADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIP-TFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51070.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.4e-6962.87Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        MVSPEN NWL DY LIE      G F   + +F W I   +G+    VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAG
        +L+PGR PKTDK AI+ DA+RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEKIKELK EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ+K+I   P  QP FLP P     AQ   G
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAG

Query:  NKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        +KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  NKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT1G51070.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.9e-6251.36Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIE------DIPVP---DGNFPVASSSFSW-----------------------------------------PIQPFNGAHD-----
        MVSPEN NWL DY LIE      +   P   DG+  V   S+ W                                         P+ P           
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIE------DIPVP---DGNFPVASSSFSW-----------------------------------------PIQPFNGAHD-----

Query:  --SGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEK
            VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S+L+PGR PKTDK AI+ DA+RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEK
Subjt:  --SGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEK

Query:  IKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        IKELK EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ+K+I   P  QP FLP P     AQ   G+KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  IKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSI---PAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT3G23210.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.4e-4054.6Show/hide
Query:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRL
        E  S KR R+ SCS   +KACREKLRR++LNDKF++L S+L+PGR PKTDK+AIL DA+R+VNQLR E  +L+E+N  L E+IK LKA+KNELR+EK  L
Subjt:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRL

Query:  KADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIP-TFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        KA+KE++EQQ+KS+    PGF+P   P  F +   A     P+  Y P++ MW  +PPA  DTS+D    PPVA
Subjt:  KADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIP-TFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT4G14410.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.5e-3954.39Show/hide
Query:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKA
        S+KR R+ SCS    +KACRE+LRR++LN++F++L S+L+PGR PKTDK AIL DA+R++NQLR E  KL+E+N  L E+IK LKAEKNELR+EK  LKA
Subjt:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKA

Query:  DKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        DKE+ EQQ+KS+ A   GF+P     F     A   + P  GY P   MW +MP +  DTS+D  LRPP A
Subjt:  DKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT5G54680.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.9e-7565.56Show/hide
Query:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPI-QPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG
        MVSPEN NW+ D      I    G+F +    FSWP+ QP   + +S   +DGS  + +   E GSKKR R +S SA+SSKACREK RRDRLNDKF+ELG
Subjt:  MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPI-QPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG

Query:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFP-----AQG
        +IL+PG PPKTDKAAILVDAVRMV QLR E QKLK+SNSSLQ+KIKELK EKNELRDEKQRLK +KE+LEQQ+K++ A QP F P P P  P     AQG
Subjt:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFP-----AQG

Query:  QA-GNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QA GNK+VP I Y P VAMWQFMPPA+VDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QA-GNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTATCCCCCGAAAATCCCAATTGGTTGTTCGATTATGGTTTGATCGAAGACATCCCTGTACCCGATGGGAATTTCCCGGTCGCGAGCTCAAGCTTCTCTTGGCCTAT
TCAGCCCTTTAACGGCGCCCATGATTCCGGTGTGGAAATTGATGGTTCGTTGGCAGATCTGGATGGCCGTCTAGAATCAGGCTCAAAGAAGCGGGTTAGATCTGATTCAT
GTAGTGCATCAAGCTCCAAAGCATGTAGGGAGAAATTGCGGAGGGATAGGCTCAATGACAAGTTTCTGGAACTGGGCTCCATTTTGGATCCTGGAAGACCACCCAAAACT
GACAAGGCTGCAATTTTAGTTGATGCAGTTCGAATGGTGAATCAGCTACGTAGTGAAACGCAGAAACTAAAGGAATCGAATTCAAGTCTCCAGGAGAAGATCAAAGAGTT
GAAGGCTGAGAAGAACGAGCTTCGCGACGAGAAGCAGAGGCTCAAGGCAGATAAGGAGAGGCTAGAGCAGCAAGTAAAGTCCATTCCTGCTCAACAACCTGGCTTCTTAC
CTCCACCAATACCCACATTTCCTGCTCAGGGTCAAGCTGGCAATAAGTTAGTTCCTTTCATTGGTTACCACCCTAGTGTTGCCATGTGGCAATTCATGCCACCTGCTGCG
GTGGACACGTCACAGGATCACGTACTCCGGCCACCTGTTGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTGAAAGCCCATGACCAAAACTACGCGTTTAGATGACGTGTTTCTCCCACTCGATCCTAACATGATCGATCATCTGCCATCGCTACCCTCAAATCCCTAATCTTCTTC
GATTCTTGTCGTCCTCTAAAATCCACCTTCCTCCATTTTCTCCCTCCTCAATCCTTCCAGCCCTAACCCTAACTCTCCTCTTCTCAATTTCTCTTCAATTTTCATTCCCA
TCTTTTTTCCAATTCTTCTGGTCGGAAAATTTTATTATTTTCCGACAATCTCGCGTTCTTTTTTTTCAATAACTGTTTGAGAAATGGTATCCCCCGAAAATCCCAATTGG
TTGTTCGATTATGGTTTGATCGAAGACATCCCTGTACCCGATGGGAATTTCCCGGTCGCGAGCTCAAGCTTCTCTTGGCCTATTCAGCCCTTTAACGGCGCCCATGATTC
CGGTGTGGAAATTGATGGTTCGTTGGCAGATCTGGATGGCCGTCTAGAATCAGGCTCAAAGAAGCGGGTTAGATCTGATTCATGTAGTGCATCAAGCTCCAAAGCATGTA
GGGAGAAATTGCGGAGGGATAGGCTCAATGACAAGTTTCTGGAACTGGGCTCCATTTTGGATCCTGGAAGACCACCCAAAACTGACAAGGCTGCAATTTTAGTTGATGCA
GTTCGAATGGTGAATCAGCTACGTAGTGAAACGCAGAAACTAAAGGAATCGAATTCAAGTCTCCAGGAGAAGATCAAAGAGTTGAAGGCTGAGAAGAACGAGCTTCGCGA
CGAGAAGCAGAGGCTCAAGGCAGATAAGGAGAGGCTAGAGCAGCAAGTAAAGTCCATTCCTGCTCAACAACCTGGCTTCTTACCTCCACCAATACCCACATTTCCTGCTC
AGGGTCAAGCTGGCAATAAGTTAGTTCCTTTCATTGGTTACCACCCTAGTGTTGCCATGTGGCAATTCATGCCACCTGCTGCGGTGGACACGTCACAGGATCACGTACTC
CGGCCACCTGTTGCCTAACCTGGTGGCAACCAAGGTTGCCAAAAGAAAACCATTGGCAGCACGCGATTGCTTGGGATTTTTCCCTGGACCTTCATTTTTACCCTGCCATT
GTCAACTAATATATATTAGTTTTTTTAGTTAGTAGGCTCGCCTGTCAATTGATTTTTTGAGGGCTGCTTATGTTATTTGTCATTGGATACTTGAAAGAACCCTACCTGTT
TTTCTTAAGTTTTGTAATTGTAAATGTGAATAAGTGAGTGATTTGGTAATTGGTTCTGTCTTTTCAGAAGTCGTGGTCAAGTTAGGAATGCCATTAATTTTTTGGGAAAA
TTTCTAATTTTAAAATAAAAATTGTCAACCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVSPENPNWLFDYGLIEDIPVPDGNFPVASSSFSWPIQPFNGAHDSGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKT
DKAAILVDAVRMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSIPAQQPGFLPPPIPTFPAQGQAGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAA
VDTSQDHVLRPPVA