; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G25480 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G25480
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr3:22847613..22848258
RNA-Seq ExpressionCSPI03G25480
SyntenyCSPI03G25480
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042928.1 hypothetical protein E6C27_scaffold44G004520 [Cucumis melo var. makuwa]6.2e-5591.74Show/hide
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KAE8650773.1 hypothetical protein Csa_017653 [Cucumis sativus]7.1e-4380.83Show/hide
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KAG6588895.1 hypothetical protein SDJN03_17460, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-3172.28Show/hide
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        L
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KAG7022660.1 hypothetical protein SDJN02_16394, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-1850.94Show/hide
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        MPFYKQY G+KTK TGLVGYVFHR+   ++S HN+ LLV ++PG DT  TRDSL+QFD  YGI+ADEG+D         V+  + +S+ L  F  L  + 
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        + ++LS
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XP_021648774.1 uncharacterized protein LOC110641383 [Hevea brasiliensis]1.6e-1040.68Show/hide
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        ME+N RK RGFM+GKLMPFY+         QY  SK       +  T  VG+  H++   +   Q+ +  ++   P     + RD L+QFD+ YG+  DE
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         VD+KAA+YISS   RFK
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A067LN74 Uncharacterized protein1.7e-1040.87Show/hide
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        ME+N RK RGFM+GKL+PFY+    + T Q                VG+V H++   +  +  +  +V   D  RD       LSQFD+ YG+  DEGVD
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        +KAA YISS   RFK
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A0A0A0LVE7 Uncharacterized protein1.3e-61100Show/hide
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A0A2P5FC89 Uncharacterized protein3.2e-0942.86Show/hide
Query:  MEANKRKLRGFMRGKLMPFYKQYNGSKTKQTGLVGYVFH-RECYSSVSQHNIGLLVQDD-----PGRDTT-----ATRDSLSQFDRSYGIIADEGVDVKA
        ME+N RK RGFM+GKLMPFY+    + +  T  V Y    +   SS S  ++G LV  D     P    +      +RDS+ Q D  YG+  DE VD KA
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        A+YISS   RFK
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A0A5D3C0J6 Uncharacterized protein3.0e-5591.74Show/hide
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        MEANKRKLRGFM+GKLMPFYKQYNGSKTKQTGLVGYVFHRECYSSV SQHNI LLVQD+P RDTTATR SLSQ D SYGI+ADEGVDVKAANYISSTLAR
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        FKSLNELPHPIE+SSIPLPHQ
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A0A6A6LUB7 Uncharacterized protein7.7e-1140.68Show/hide
Query:  MEANKRKLRGFMRGKLMPFYK---------QYNGSK-------TKQTGLVGYVFHRE-CYSSVSQHNIGLLVQDDPGRDTTATRDSLSQFDRSYGIIADE
        ME+N RK RGFM+GKLMPFY+         QY  SK       +  T  VG+  H++   +   Q+ +  ++   P     + RD L+QFD+ YG+  DE
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Query:  GVDVKAANYISSTLARFK
         VD+KAA+YISS   RFK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGCAAACAAAAGAAAACTTAGAGGCTTCATGAGAGGGAAATTGATGCCTTTCTACAAGCAATATAATGGAAGCAAAACAAAGCAAACTGGTTTGGTTGGCTATGT
CTTCCATAGGGAGTGCTATAGTAGTGTTTCTCAACATAACATTGGTTTATTGGTGCAGGATGACCCCGGTCGGGACACGACGGCCACTCGTGACTCATTAAGTCAGTTTG
ATCGTTCATATGGAATCATAGCTGACGAAGGTGTCGATGTAAAGGCAGCAAATTATATTTCCTCCACGTTAGCAAGATTCAAAAGCTTGAATGAGTTACCTCATCCAATA
GAATTGTCGTCGATTCCATTGCCCCACCAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCCCACCATATTAAGTAGCTTTATACAGTCTCAAAAGAAGTTTGTGTAGAAGAAGAGAAATTGATCGATGGAGGCAAACAAAAGAAAACTTAGAGGCTTCATGAGAGG
GAAATTGATGCCTTTCTACAAGCAATATAATGGAAGCAAAACAAAGCAAACTGGTTTGGTTGGCTATGTCTTCCATAGGGAGTGCTATAGTAGTGTTTCTCAACATAACA
TTGGTTTATTGGTGCAGGATGACCCCGGTCGGGACACGACGGCCACTCGTGACTCATTAAGTCAGTTTGATCGTTCATATGGAATCATAGCTGACGAAGGTGTCGATGTA
AAGGCAGCAAATTATATTTCCTCCACGTTAGCAAGATTCAAAAGCTTGAATGAGTTACCTCATCCAATAGAATTGTCGTCGATTCCATTGCCCCACCAATAGATTTGATG
ACCTTGTCGAGCACTTCTCTATTATTTATCTTGGACTTTACTAGTTGATTATTATTCTAAGTAAAGAACCGATGCTCATGTGGTTGGATATAGTGTTTCTCTCACGTATA
TAGAAGGTTTGAATCCCCACCTTTTATATATTTATAATGAAAAAAAACTTGAATGCATCTTCTCATATATTTCTTATCTCTCCATATACAAAAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ELSSIPLPHQ