; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G25910 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G25910
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCell wall protein DAN4-like
Genome locationChr3:23211143..23211725
RNA-Seq ExpressionCSPI03G25910
SyntenyCSPI03G25910
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056279.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]6.9e-2177.06Show/hide
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KAA0056285.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-1973.64Show/hide
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KAE8650786.1 hypothetical protein Csa_017544 [Cucumis sativus]3.8e-2782.05Show/hide
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KGN58213.1 hypothetical protein Csa_017497 [Cucumis sativus]3.7e-3898.17Show/hide
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XP_031737565.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]7.7e-2882.2Show/hide
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        +GS S ETSR F+NGFFG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8Q5 Uncharacterized protein1.8e-3898.17Show/hide
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A0A0A0LB81 Uncharacterized protein2.5e-2479.65Show/hide
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A0A1S3BPQ2 cell wall protein DAN4-like3.8e-1770.09Show/hide
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        RLFSNGF
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A0A5D3C1H7 Cell wall protein DAN4-like6.3e-2073.64Show/hide
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A0A5D3C1I1 Cell wall protein DAN4-like3.4e-2177.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTACCAATCTCTTGCTTTCCTGGCTCTCATCATTGTCGCCGTCACTGGTGCTGTTGCTCAAGGTCCTACCTCCTCCACTCCAGCTCCCACGACCTCCTCCACTCC
AGCTCCCACGACCTCCTCTTCCTCTTCTTCATCTTCACTCGACTCAACCACCACCACCACCACCACGTCCTCAGGTTCCTCTATCGATTCTCCATCAATCTCAGCAGCTC
CAGGATTATCACCCGATTCCTCTGCTCAATCACCAACGACCGCAACATCTCCCTCCGGTTCTCCTTCTATTGAGACTTCTCGCTTGTTTTCAAATGGTTTTTTTGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCATCCCTTCTTTCCCTTTTCTTTTTCTTCAATATCATCACTTACATTAATTTATCATAATAATGGCTTACCAATCTCTTGCTTTCCTGGCTCTCATCATTGTCGCCG
TCACTGGTGCTGTTGCTCAAGGTCCTACCTCCTCCACTCCAGCTCCCACGACCTCCTCCACTCCAGCTCCCACGACCTCCTCTTCCTCTTCTTCATCTTCACTCGACTCA
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ATCTCCCTCCGGTTCTCCTTCTATTGAGACTTCTCGCTTGTTTTCAAATGGTTTTTTTGGCTGATGGATTTATGGAGAAGAGATTCAAATCTCAACTTTTTGTACACACT
AATATTATTTTAATCATTTGAGCTATGCTCCTCGAGACAATGTCGTCGTCGAATCACAATTTTACTCTTCTTTTTTATTAAGTTTTATTCCAATGTAATCAAATAAATAA
AAAGAAATTTCATTTGTTACCGTCCAAGTAGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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