; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G25950 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G25950
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionmucin-1
Genome locationChr3:23247242..23248174
RNA-Seq ExpressionCSPI03G25950
SyntenyCSPI03G25950
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066977.1 mucin-1 [Cucumis melo var. makuwa]2.5e-5681.9Show/hide
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        TDSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPT     AADGP AADGPT       ADSPADSPA D+ SSGTDLKLTSA+V G
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        V+A  GF+AF
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KAG6581073.1 hypothetical protein SDJN03_21075, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.3e-3053.21Show/hide
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                      SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS  PDAAD+P
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         ADGP+ ADGP+ ADGP+ ADG + +DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G   VA  G FAF
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XP_008450043.1 PREDICTED: mucin-1 [Cucumis melo]6.7e-5782.38Show/hide
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        TDSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPT     AADGP AADGPT       ADSPADSPA D+ SSGTDLKLTSA+V G
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        V+A  GF+AF
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XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]8.8e-3356.18Show/hide
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        MASQ+ VLVFALIF+AAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                   +PAG+P  +P  T                 
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS  PDAAD+P ADGP+ ADGP+
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         ADGP+ ADG + +DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA  G FAF
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]1.3e-84100Show/hide
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        DSPSDSPASDSPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTADGPAAADGPTAADGPTAADGPVAADSPADSPASDESSGTDLKLTSAMVVGVV
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        ATVGFFAF
Subjt:  ATVGFFAF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein4.8e-6962.28Show/hide
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        DSPSDSPASDSPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTADGPA                                                
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                                                                                      AADGPTAADGPTAADGPVAADS
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        PADSPASDESSGTDLKLTSAMVVGVVATVGFFAF
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A0A1S3BND1 mucin-13.2e-5782.38Show/hide
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        TDSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPT     AADGP AADGPT       ADSPADSPA D+ SSGTDLKLTSA+V G
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A0A5A7VIK3 Mucin-11.2e-5681.9Show/hide
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        V+A  GF+AF
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A0A6J1F318 mucin-1-like4.3e-3356.18Show/hide
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS  PDAAD+P ADGP+ ADGP+
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         ADGP+ ADG + +DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA  G FAF
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A0A6J1J779 mucin-1-like3.3e-2549.08Show/hide
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        MASQ+VLVFALIF+AAVAG FAEAPT SPS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                                  
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Query:  ---------SPAGSPKASPETTSPSPAASSPSSSSDAPTSNSPTSSPTSSPSVSPSPATDSPSDSPA-SDSPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPS-
                 +PA +P AS E +SPSPAAS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSP TDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS 
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         PDAAD+P ADGP+  DGPT             +DSPAD+P  D  SGT  LKLTSA V G   VA  G FAF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCAAACTGTTCTTGTTTTTGCTTTGATCTTCCTTGCCGCTGTTGCCGGAGTTTTTGCGGAGGCACCGACCGAATCTCCTTCAACATCTCCCTCACCTAAAGC
TTCCCCATCGGACTCTGAATCGCCTTCACCGTCTTCTTCTTCTCCTGCAGGCTCTCCAAAGGCCTCACCTGAGACGACATCCCCATCCCCGGCAGCTTCTTCTCCATCTT
CGTCCTCTGATGCTCCAACCAGCAATTCGCCCACCAGCTCTCCAACATCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCTGCCACTGACTCCCCCTCTGACTCTCCTGCTTCTGAC
TCTCCTGTTGCTGACTCTCCTGCTGACAGTCCTGCAGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCACCTGATGCCGCTGATGCCCCCAC
TGCTGATGGTCCTGCTGCTGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTGTTGCCGCCGATTCTCCTGCTGATTCACCCGCCAGTGACGAAA
GCAGCGGTACAGATCTGAAACTCACCTCCGCCATGGTCGTTGGTGTCGTTGCCACTGTTGGATTCTTTGCATTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCCCTCCATCTCTCTAACATTGCAGGGTTTTCTCTCTTCTCCTAAGAGAAAATTACTGCCTTCTCATATCAAATTTCACATTTTTACCCGTTTTTTTTACATTCTAATT
TTACTATGGCTTCTCAAACTGTTCTTGTTTTTGCTTTGATCTTCCTTGCCGCTGTTGCCGGAGTTTTTGCGGAGGCACCGACCGAATCTCCTTCAACATCTCCCTCACCT
AAAGCTTCCCCATCGGACTCTGAATCGCCTTCACCGTCTTCTTCTTCTCCTGCAGGCTCTCCAAAGGCCTCACCTGAGACGACATCCCCATCCCCGGCAGCTTCTTCTCC
ATCTTCGTCCTCTGATGCTCCAACCAGCAATTCGCCCACCAGCTCTCCAACATCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCTGCCACTGACTCCCCCTCTGACTCTCCTGCTT
CTGACTCTCCTGTTGCTGACTCTCCTGCTGACAGTCCTGCAGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCACCTGATGCCGCTGATGCC
CCCACTGCTGATGGTCCTGCTGCTGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTACTGCCGCCGATGGCCCTGTTGCCGCCGATTCTCCTGCTGATTCACCCGCCAGTGA
CGAAAGCAGCGGTACAGATCTGAAACTCACCTCCGCCATGGTCGTTGGTGTCGTTGCCACTGTTGGATTCTTTGCATTCTAAAGATAGCTTATTGATCTAAGCATGTTTA
GAGAGTATGGGTGATAAATTCTCACATTAAATGAGATTGTATTCTTTTAAATTTATATAATTAAAATAAAACAAAAAATGAAGAATGTGTAAACCAATTCATCTGGAAAA
AAAAGTTGAATTATAATTTTGGACATTGTACTATACTCATTTTGCATTTATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASQTVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAGSPKASPETTSPSPAASSPSSSSDAPTSNSPTSSPTSSPSVSPSPATDSPSDSPASD
SPVADSPADSPADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADAPTADGPAAADGPTAADGPTAADGPVAADSPADSPASDESSGTDLKLTSAMVVGVVATVGFFAF