; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G26110 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G26110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionRibonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationChr3:23393934..23395458
RNA-Seq ExpressionCSPI03G26110
SyntenyCSPI03G26110
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-18094.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.0e-190100Show/hide
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A0A1S3BNB8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain8.7e-18295.14Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain8.2e-18094.22Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.0e-17893.92Show/hide
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B9RBH6 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain, putative2.8e-17289.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B1.9e-15779.88Show/hide
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain4.0e-16886.02Show/hide
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A5.5e-14174.07Show/hide
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        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D + W++LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV E RAFYGFQIA+
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Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AI+T+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
Subjt:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH

Query:  CDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L +++V +IV EAV IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG ++ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY

Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

P79733 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M26.1e-13270.12Show/hide
Query:  SIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFYGFQ
        ++ +EPLL  NP RF +FPIQY  IW+MYKKAEASFWTAEEVDLS+D +HWDSL  +E++FI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF +EVQV E R FYGFQ
Subjt:  SIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFYGFQ

Query:  IAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
        IA+ENIHSEMYSLL++TYIKDS E+  LF+AI+T+PCVKKKADWAL WI D    + ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
Subjt:  IAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD

Query:  EGLHCDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKR
        EGLHCDFACL++  L  K + + VK+I+M AV IE+EF+ DALPV L+GMN DLM QYIEFVADRL+  LG+DK+Y V+NPFD+ME ISL+GKTNFFEKR
Subjt:  EGLHCDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKR

Query:  VGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        VGEYQ+  VMS    N     F +D DF
Subjt:  VGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C1.0e-15881.02Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+E RAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AI+T+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KL+ +RVK IV +AV IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A3.9e-14274.07Show/hide
Query:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D + W++LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV E RAFYGFQIA+
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Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AI+T+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
Subjt:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH

Query:  CDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSLL+K+L +++V +IV EAV IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRL+  LG ++ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
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Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein7.1e-16081.02Show/hide
Query:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFY
        MPS+P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R W+ SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+E RAFY
Subjt:  MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWD-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AI+T+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KL+ +RVK IV +AV IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRL+GALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLNVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTTCCATTCCCGATGAGCCTCTCCTCGCCCCTAACCCTGATCGCTTCTGCATGTTCCCCATTCAATATCCCCAAATCTGGGAGATGTACAAGAAGGCCGAAGCCTC
CTTCTGGACCGCCGAAGAGGTCGATCTCTCTCAAGACACTCGCCATTGGGATTCCTTAACTTCCGACGAGAAGCATTTCATCACTCACGTCCTTGCCTTCTTCGCTGCCT
CTGATGGTATCGTCTTGGAGAACCTTGCCGGTCGGTTCATGAAGGAAGTTCAAGTCGCTGAAGTCAGAGCCTTCTACGGTTTCCAAATTGCTATCGAGAACATTCATTCC
GAGATGTATAGTCTTCTCCTCGAAACTTACATCAAAGATTCGAATGAGAAGAATCGCTTGTTTCATGCTATTGATACTGTCCCCTGTGTCAAGAAGAAGGCCGATTGGGC
GTTGAAGTGGATTGACAGCACGGAGTCATTTGCTGAGCGGATTTTGGCATTTGCTTGTGTTGAGGGAATTTTCTTCTCAGGTAGTTTCTGCTCTATTTTCTGGTTGAAAA
AACGTGGGTTAATGCCTGGACTAACATTCTCAAACGAGTTGATTTCAAGAGATGAAGGTCTTCATTGTGATTTTGCATGTTTGTTGTATTCGTTGTTGAGGAAGAAATTG
AATGTGGATCGAGTGAAGGAGATTGTTATGGAGGCTGTGAATATAGAGAGGGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGGCTCTAGTTGGAATGAATGGAGACTTGATGAG
CCAATACATTGAATTTGTGGCAGATAGATTGGTTGGAGCATTGGGGTATGACAAAATCTACAATGTGCAAAATCCATTTGATTGGATGGAGTTGATTTCCTTGCAAGGGA
AGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATATCAAAAGGCATCTGTGATGTCAAATCTAAATGGAAATGGAGGAATTCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCACCCGCTATTTTTCAAAACCCTATCCCCAATTTCATTCTATAAAAACCCTACCTCTCCACTCCTTCCTCCACCATCGAAAAATCCCCCATTTTCACAGCCTCAACCT
TTTTATTCATCCCCTCTTCCAATTCCCCGCCATGCCTTCCATTCCCGATGAGCCTCTCCTCGCCCCTAACCCTGATCGCTTCTGCATGTTCCCCATTCAATATCCCCAAA
TCTGGGAGATGTACAAGAAGGCCGAAGCCTCCTTCTGGACCGCCGAAGAGGTCGATCTCTCTCAAGACACTCGCCATTGGGATTCCTTAACTTCCGACGAGAAGCATTTC
ATCACTCACGTCCTTGCCTTCTTCGCTGCCTCTGATGGTATCGTCTTGGAGAACCTTGCCGGTCGGTTCATGAAGGAAGTTCAAGTCGCTGAAGTCAGAGCCTTCTACGG
TTTCCAAATTGCTATCGAGAACATTCATTCCGAGATGTATAGTCTTCTCCTCGAAACTTACATCAAAGATTCGAATGAGAAGAATCGCTTGTTTCATGCTATTGATACTG
TCCCCTGTGTCAAGAAGAAGGCCGATTGGGCGTTGAAGTGGATTGACAGCACGGAGTCATTTGCTGAGCGGATTTTGGCATTTGCTTGTGTTGAGGGAATTTTCTTCTCA
GGTAGTTTCTGCTCTATTTTCTGGTTGAAAAAACGTGGGTTAATGCCTGGACTAACATTCTCAAACGAGTTGATTTCAAGAGATGAAGGTCTTCATTGTGATTTTGCATG
TTTGTTGTATTCGTTGTTGAGGAAGAAATTGAATGTGGATCGAGTGAAGGAGATTGTTATGGAGGCTGTGAATATAGAGAGGGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGG
CTCTAGTTGGAATGAATGGAGACTTGATGAGCCAATACATTGAATTTGTGGCAGATAGATTGGTTGGAGCATTGGGGTATGACAAAATCTACAATGTGCAAAATCCATTT
GATTGGATGGAGTTGATTTCCTTGCAAGGGAAGACTAATTTCTTTGAGAAAAGAGTTGGGGAATATCAAAAGGCATCTGTGATGTCAAATCTAAATGGAAATGGAGGAAT
TCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTCTGAAGATTGAAGATAAAGATGAGTTCACTGTGTAGAATAATATTTGTGGGTTCTTCTTTCTTTTAATTCTTATATGTAGTTT
AGTATTTAAGGATTAGATTTGATTAAGTATGGTTAATTTAAGATTAAAAAAAAAAAATGTTTCATGGTTTGGGTTTAGGTTTATGTTGAATTTGGTGTGTTATGGCCACA
AACTATGGCAGATTTAAGAAGCCTAAGATATGATGAGGGAAAAGAACCATTTTGTGATACTTGTTTTGCTGCTGTTATGCATCTTTGTTAAAGCATTATTATGTATTATA
GTGTTTCATCATACAACACTGGCAACTCTACTTGCCAAATCTATTTTTATATCCTTTGATGACAAAATTTGAAGGTTTTTTTTTTTTATTTGGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPSIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDTRHWDSLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEVRAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSNEKNRLFHAIDTVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
NVDRVKEIVMEAVNIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLVGALGYDKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF