; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G27070 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G27070
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionribokinase isoform X2
Genome locationChr3:24493742..24495175
RNA-Seq ExpressionCSPI03G27070
SyntenyCSPI03G27070
Gene Ontology termsGO:0019252 - starch biosynthetic process (biological process)
GO:0044281 - small molecule metabolic process (biological process)
GO:0046835 - carbohydrate phosphorylation (biological process)
GO:0016773 - phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor (molecular function)
GO:0019200 - carbohydrate kinase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8650838.1 hypothetical protein Csa_017413 [Cucumis sativus]1.7e-44100Show/hide
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XP_004152009.1 ribokinase isoform X1 [Cucumis sativus]1.7e-44100Show/hide
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XP_008447353.1 PREDICTED: ribokinase isoform X1 [Cucumis melo]3.9e-4498.9Show/hide
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XP_008447354.1 PREDICTED: ribokinase isoform X2 [Cucumis melo]3.9e-4498.9Show/hide
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XP_038888958.1 ribokinase isoform X2 [Benincasa hispida]4.7e-4295.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LE05 PfkB domain-containing protein6.9e-47100Show/hide
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A0A1S3BH76 ribokinase isoform X21.9e-4498.9Show/hide
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A0A1S3BH87 ribokinase isoform X11.9e-4498.9Show/hide
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A0A6J1HGB8 ribokinase-like isoform X21.5e-4193.41Show/hide
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A0A6J1HH81 ribokinase-like isoform X11.5e-4193.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1A6H3 Ribokinase5.3e-0440Show/hide
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        IP +++VDTTGAGD F  A   A+      E+ L F+A  A+ C +  GA   +P
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O29891 Uncharacterized sugar kinase AF_03569.0e-0442.86Show/hide
Query:  SEIVDTTGAGDAFIGAVLYALCANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARSGLPYHTD
        +++VDTTGAGDAF    LY        E+       VAA C    GAR GLP   D
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O32153 Fructosamine kinase FrlD9.0e-0438.71Show/hide
Query:  EKIPESEIVDTTGAGDAFIGAVLYALCANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARS-GLPYHTD
        + I E++I+DT GAGD+FI   L A C        L  +A+ AA  C   GA   G PY  +
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Q8R1Q9 Ribokinase3.3e-0638.55Show/hide
Query:  GRLLLGTAEKIPES------EIVDTTGAGDAFIGAVLYALC--ANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARSGLPYHTDPRLASF
        G ++L  AE +P+       + VDTTGAGD+F+GA+ + L    N+  E++L  S  +AA   +A G +S  PY  D  LA F
Subjt:  GRLLLGTAEKIPES------EIVDTTGAGDAFIGAVLYALC--ANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARSGLPYHTDPRLASF

Q9H477 Ribokinase2.4e-0440.58Show/hide
Query:  IPESEI--VDTTGAGDAFIGAVLYALC--ANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARSGLPYHTDPRLASF
        IP  ++  VDTTGAGD+F+GA+ + L    N+  E +L  S  +AA   +A G +S  PY  D  L  F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G28706.1 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.3e-3475.86Show/hide
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        KL+A G+GT+ GRL LGTAEKIP  E+VDTTGAGDAFIGAVLYA+CA MPPEK+LPF+AQVA   CRALGAR+GLP+ TDPRL  FL
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AT4G28706.2 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.3e-3475.86Show/hide
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AT4G28706.3 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.3e-3475.86Show/hide
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AT4G28706.4 pfkB-like carbohydrate kinase family protein2.3e-3475.86Show/hide
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AT5G43910.2 pfkB-like carbohydrate kinase family protein6.6e-2665Show/hide
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        G V GRL++ TAEKIP SE++DTTGAGDAF GA+LY LC  M  E++L F+++VAA CCR LGAR+ LPY TDP LA+FL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCCACCAGTGGCCAAGTTGAGAGCTCAGGGGATAGGGACAGTTTGTGGTAGGCTGTTGCTCGGGACAGCTGAAAAAATACCAGAGTCCGAGATTGTTGATACAAC
TGGTGCTGGAGATGCATTCATTGGAGCAGTTCTTTATGCCTTATGTGCCAACATGCCACCAGAGAAGTTATTGCCATTTTCTGCCCAAGTGGCTGCTGGATGTTGTCGTG
CTTTGGGTGCTCGAAGCGGTCTTCCATATCATACGGATCCACGGCTGGCATCTTTCTTACACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTCCACCAGTGGCCAAGTTGAGAGCTCAGGGGATAGGGACAGTTTGTGGTAGGCTGTTGCTCGGGACAGCTGAAAAAATACCAGAGTCCGAGATTGTTGATACAAC
TGGTGCTGGAGATGCATTCATTGGAGCAGTTCTTTATGCCTTATGTGCCAACATGCCACCAGAGAAGTTATTGCCATTTTCTGCCCAAGTGGCTGCTGGATGTTGTCGTG
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CCATTAACTCACGATTTTTTGTGAAAATGTAATTCAGCCCAAAGCATGAATATTGATTTAATAGAAGCGTCATTGAGTTCCATGCCATGCCTTCTCTTCTTTTGAATTTC
TTTCAACAGGTTTTACGGCCAAAAAACTTGGGGAAAACAAGCTCCAATGTCAGAAACTTGATGCTTTCTTCGATTGAAACAGTTATTATGGGTACGCAAATTATCTATTC
TTGGTTATCTTTACGTCTGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGPPVAKLRAQGIGTVCGRLLLGTAEKIPESEIVDTTGAGDAFIGAVLYALCANMPPEKLLPFSAQVAAGCCRALGARSGLPYHTDPRLASFLH