; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G28020 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G28020
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionsyntaxin-71-like
Genome locationChr3:25600856..25604820
RNA-Seq ExpressionCSPI03G28020
SyntenyCSPI03G28020
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044019.1 syntaxin-71 [Cucumis melo var. makuwa]4.7e-13296.95Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY +
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV

XP_004144411.1 syntaxin-71 [Cucumis sativus]6.4e-13799.25Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008442667.1 PREDICTED: syntaxin-71 [Cucumis melo]7.8e-13597.74Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008461731.1 PREDICTED: syntaxin-71-like [Cucumis melo]3.5e-13597.74Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_038904060.1 syntaxin-71 [Benincasa hispida]1.9e-13396.23Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYA+VEADIEAALQKAEDASKEKNRAS+VALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVT+TKNNGGWT+SASR EIKFDS GRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LE82 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein3.1e-13799.25Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A0A0LFR8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein2.7e-13396.6Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADI+AALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQV LMDEIDTKVDKAASDLKNTN RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3B689 syntaxin-713.8e-13597.74Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3CFA3 syntaxin-71-like1.7e-13597.74Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A5A7TS26 Syntaxin-712.3e-13296.95Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLT RNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY +
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B1.0e-0423.18Show/hide
Query:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEDVPKLQ-RLAVKRVKGLSPEDLTNRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT
        D   +L  ++ ADI+      E + +++N   +V  N  A++R     +  ++ +LQ  L     + +  ++L  R + V   +++ +++ +  D  +  
Subjt:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEDVPKLQ-RLAVKRVKGLSPEDLTNRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT

Query:  TKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
        T        + +   I + S  +F     + TE + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D  + 
Subjt:  TKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS

Query:  DLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL
         L+N N R+ +T+ Q   S    + I++L I++
Subjt:  DLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-732.1e-9067.04Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW  S S + I+FD   S  R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Q94KK6 Syntaxin-727.4e-8865.79Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M VID++ RVD IC+KYDKYDI+K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL EDV KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TTSASRTEIKFD-SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W   SA    IKFD S    DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TTSASRTEIKFD-SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

Q9SF29 Syntaxin-712.0e-10977.82Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYD++KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL E+VPKLQRLAVKRVKGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSA--SRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT S+  SR +IKFDS GRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSA--SRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09740.1 syntaxin of plants 711.4e-11077.82Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYD++KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL E+VPKLQRLAVKRVKGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSA--SRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT S+  SR +IKFDS GRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSA--SRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G45280.1 syntaxin of plants 725.3e-8965.79Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M VID++ RVD IC+KYDKYDI+K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL EDV KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TTSASRTEIKFD-SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W   SA    IKFD S    DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TTSASRTEIKFD-SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

AT3G61450.1 syntaxin of plants 731.5e-9167.04Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW  S S + I+FD   S  R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G61450.2 syntaxin of plants 734.9e-9568.16Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSP

Query:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW  S S + I+FD   S  R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTNRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFD---SGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGACATAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGATGATGCCTTCGC
TCGTCTCTACGCCACTGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGAAAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGATGTCCCCAAGTTGCAGAGGTTGGCTGTGAAGAGGGTTAAAGGGCTATCACCTGAAGATCTTACCAATCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGAATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGACTACCACGAAAAATAATGGGGGCTGGACAACCTCAGCTTCACGTACAGAAATCAAATTTGACTC
AGGTGGGCGATTTGATGATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCCAGTCAGTTCAGACAGGAGTATGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTCCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAAGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGTAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATTGCTGC
CTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGTAATATTCAATCGTACAGCGAAAATAAATTGGAAATATGTAGGAAATTGAGTCCAGTGTATGAGTCATTACAGTTGCTTTTGTGCACGACTTCTGTAGAGATTCTCG
GAACCACTTTCACCGCCGTAAGTAACCGGAAACCTACCGGAGCCCGGAGGCTAAGGATTGAAGATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAA
GTACGACAAATATGACATAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGATGATGCCTTCGCTCGTCTCTACGCCACTGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGA
AAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTCGTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGATGTCCCCAAGTTGCAGAGG
TTGGCTGTGAAGAGGGTTAAAGGGCTATCACCTGAAGATCTTACCAATCGAAATGATTTGGTGCTTGCATTGCCGGATAGAATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGAC
TACCACGAAAAATAATGGGGGCTGGACAACCTCAGCTTCACGTACAGAAATCAAATTTGACTCAGGTGGGCGATTTGATGATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCCA
GTCAGTTCAGACAGGAGTATGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACATGATATCAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAG
GAAATAGACAGGCAAGTCCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCTGACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAAGGACACAGTTAACCAGCT
AAGGTCCAGTAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATTGCTGCCTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGAGCTAACAAAGAGGAAAAAT
CTTCATGTTCTTGTGGAATATTTGTGTCAAGGTTGCTAGGAAGAGTATCTGTATCCAGTACATTATCTGATCGTGTTTGTGTTGTTTATAATATTTGTATATCATATTCT
TTTACACCGGACTCGCTGTGTACTATCAATTCTTGGTTATGTTGCTTGATTCTTTAATGTTGCACTTGTGTAACCTGTCTGTGCTTTTGGCTTCAAATTTGAATACTGAT
CTCCCATGCTTGACATTTTAGATCATATGTAGAAATCAAGACAACAATATGCATACTTAGGCATTTATTCATGCATTGAAATGCATCTCAGAGTCGATCATGTTCAAACT
TTGCTCTACAAATCGATTAAGATGGTAGACCTTTTGGGGCTTCTCCCTACTACCCACCCATTATAGCCCGGGAGAAAATGGAGATGAGGAATAAGGATTGAGACCCCATG
TTTTACTAAGCACTCTTAGACCACAAACAGTGTTCACATAAAAGCAATAATTTTGCTCTTTAATATTCAAAGGAATATATTTTATTTTTACTCAAAATTACTTGACCCCT
CCCAAACGAGGATAATCGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEDVPKLQRLAVKRVKGLSPEDLTNRNDLV
LALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTTSASRTEIKFDSGGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNVRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK