; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G28080 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G28080
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
Genome locationChr3:25667591..25675954
RNA-Seq ExpressionCSPI03G28080
SyntenyCSPI03G28080
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR019734 - Tetratricopeptide repeat


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004144414.1 uncharacterized protein LOC101220521 isoform X3 [Cucumis sativus]8.8e-102100Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

XP_008465106.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103502794 [Cucumis melo]3.8e-9796.35Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKL EDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDE+VQFLLD R++L +VKL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

XP_031738478.1 uncharacterized protein LOC101220521 isoform X1 [Cucumis sativus]8.8e-102100Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

XP_031738479.1 uncharacterized protein LOC101220521 isoform X2 [Cucumis sativus]8.8e-102100Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

XP_038881142.1 uncharacterized protein LOC120072738 [Benincasa hispida]5.9e-9089.23Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAV SAELGEYA+AASLLEDLIKEK DDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSAT L EDVNFEVLRGLTN+LLAAGK DEAVQFLLD R+ L ++KL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        G   EGKEMETKLSIDP+QV+LLLGKSYSDWGHV DA+SVYDQLISSHP+DFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LE87 Uncharacterized protein7.0e-10591.44Show/hide
Query:  MAVLNIFFEIGMGAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFL
        MAVLNIFFEIG+GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFL
Subjt:  MAVLNIFFEIGMGAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFL

Query:  LDYRDNLNNVKLGEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAK------------------GIILKENGRSGDAER
        LDYRDNLNNVKLGEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAK                  GIILKENGRSGDAER
Subjt:  LDYRDNLNNVKLGEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAK------------------GIILKENGRSGDAER

Query:  MFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        MFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  MFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

A0A1S3CN41 uncharacterized protein LOC1035027941.8e-9796.35Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKL EDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDE+VQFLLD R++L +VKL
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

A0A6J1GV96 uncharacterized protein LOC111457503 isoform X22.0e-8886.67Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELG+YA+AASLLEDLIK KSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGS+AAYKSAT++ EDVNFEVLRGLTN+LLAAGKPDEAVQFLLD R+ L +V L
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        G   EG+EM+TKL IDPVQV+LLLGK+YSDWGHVSDAVSVYDQLI+SHPNDFRGYLAKGIILKENG +GDAERMFIQARFFAPENAKMLV+RYSR
Subjt:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

A0A6J1GWF7 uncharacterized protein LOC111457503 isoform X12.0e-8886.67Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELG+YA+AASLLEDLIK KSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGS+AAYKSAT++ EDVNFEVLRGLTN+LLAAGKPDEAVQFLLD R+ L +V L
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        G   EG+EM+TKL IDPVQV+LLLGK+YSDWGHVSDAVSVYDQLI+SHPNDFRGYLAKGIILKENG +GDAERMFIQARFFAPENAKMLV+RYSR
Subjt:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

A0A6J1IZV0 uncharacterized protein LOC111479948 isoform X15.9e-8886.15Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVTSAELG+YA+AASLLEDLIK KSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGS+AAYKSAT++ EDVNFEVLRGLTN+LLAAGKPDEAVQFLLD R+ L +V L
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
        G   EG++M+TKL IDPVQV+LLLGK+YSDWGHVSDAVSVYDQLI+SHPNDFRGYLAKGIILKENG +GDAERMFIQARFFAPENAKMLV+RYSR
Subjt:  G---EGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G78915.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.7e-6964.06Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVT  ELG+Y++AA+ LE L KE+  D D+FRLLGEV Y+L +Y+GS+AAYK + K+ + ++ EV RGL N+ LAA KPDEAV+FLLD R+ LN  K 
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
             +  + ++DP+QV+LLLGK+YSDWGH+SDA++VYDQLIS+HP DFRGYLAKGIIL+ENG  GDAERMFIQARFFAP  AK LVDRYS+
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

AT1G78915.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.7e-6964.06Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVT  ELG+Y++AA+ LE L KE+  D D+FRLLGEV Y+L +Y+GS+AAYK + K+ + ++ EV RGL N+ LAA KPDEAV+FLLD R+ LN  K 
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
             +  + ++DP+QV+LLLGK+YSDWGH+SDA++VYDQLIS+HP DFRGYLAKGIIL+ENG  GDAERMFIQARFFAP  AK LVDRYS+
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR

AT1G78915.3 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.7e-6964.06Show/hide
Query:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL
        GAAVT  ELG+Y++AA+ LE L KE+  D D+FRLLGEV Y+L +Y+GS+AAYK + K+ + ++ EV RGL N+ LAA KPDEAV+FLLD R+ LN  K 
Subjt:  GAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNVKL

Query:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR
             +  + ++DP+QV+LLLGK+YSDWGH+SDA++VYDQLIS+HP DFRGYLAKGIIL+ENG  GDAERMFIQARFFAP  AK LVDRYS+
Subjt:  GEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGTTCTTAATATTTTCTTTGAAATTGGAATGGGTGCGGCAGTTACCTCAGCTGAATTAGGTGAATATGCACAAGCAGCCTCTTTGCTTGAAGACTTGATAAAGGA
GAAGTCGGATGATTCTGACATTTTCCGCTTGCTTGGGGAAGTAAAATATAAGCTTAAAGATTATGATGGGAGTGTTGCGGCTTACAAGAGTGCCACAAAGTTATTTGAAG
ATGTCAATTTTGAGGTTCTACGTGGCCTTACAAATTCACTACTTGCTGCCGGGAAACCAGATGAGGCTGTTCAATTCCTTTTGGACTATCGGGACAATCTTAACAATGTA
AAATTAGGAGAGGGCAAGGAAATGGAAACAAAATTATCGATTGATCCTGTACAAGTTGACTTACTGCTTGGAAAATCGTACTCAGATTGGGGACATGTTAGTGATGCTGT
ATCTGTTTATGATCAGCTTATCTCCAGCCACCCTAATGACTTCCGTGGTTACTTAGCTAAGGGAATTATTCTAAAGGAAAATGGTAGGTCTGGAGATGCTGAGAGGATGT
TCATCCAAGCCCGATTCTTTGCTCCTGAGAATGCCAAGATGCTTGTAGATCGGTATTCTAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGTTCTTAATATTTTCTTTGAAATTGGAATGGGTGCGGCAGTTACCTCAGCTGAATTAGGTGAATATGCACAAGCAGCCTCTTTGCTTGAAGACTTGATAAAGGA
GAAGTCGGATGATTCTGACATTTTCCGCTTGCTTGGGGAAGTAAAATATAAGCTTAAAGATTATGATGGGAGTGTTGCGGCTTACAAGAGTGCCACAAAGTTATTTGAAG
ATGTCAATTTTGAGGTTCTACGTGGCCTTACAAATTCACTACTTGCTGCCGGGAAACCAGATGAGGCTGTTCAATTCCTTTTGGACTATCGGGACAATCTTAACAATGTA
AAATTAGGAGAGGGCAAGGAAATGGAAACAAAATTATCGATTGATCCTGTACAAGTTGACTTACTGCTTGGAAAATCGTACTCAGATTGGGGACATGTTAGTGATGCTGT
ATCTGTTTATGATCAGCTTATCTCCAGCCACCCTAATGACTTCCGTGGTTACTTAGCTAAGGGAATTATTCTAAAGGAAAATGGTAGGTCTGGAGATGCTGAGAGGATGT
TCATCCAAGCCCGATTCTTTGCTCCTGAGAATGCCAAGATGCTTGTAGATCGGTATTCTAGATGACCTTAGCATCTCCTACATTACGTTTATAGTTTGTATACACAATTA
TCATTTATCACCATAAGTTTTGGTTCTACGATGTGAAAATCTGAAACGCAGAATGTGCGTTTTGCTGATGTACAATAGAAATTTGTAAAAAAGTTGTATTTCATGTATAT
AATACATATATGTATGTGTCTATATATTAATGTTTGGTTTAAAATCACTATTGATCAAAGTAACAATTCTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVLNIFFEIGMGAAVTSAELGEYAQAASLLEDLIKEKSDDSDIFRLLGEVKYKLKDYDGSVAAYKSATKLFEDVNFEVLRGLTNSLLAAGKPDEAVQFLLDYRDNLNNV
KLGEGKEMETKLSIDPVQVDLLLGKSYSDWGHVSDAVSVYDQLISSHPNDFRGYLAKGIILKENGRSGDAERMFIQARFFAPENAKMLVDRYSR