; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G31860 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G31860
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationChr3:28650895..28652698
RNA-Seq ExpressionCSPI03G31860
SyntenyCSPI03G31860
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_031738650.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X2 [Cucumis sativus]2.5e-7498.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD07 Uncharacterized protein1.7e-7699.31Show/hide
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A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X13.4e-6187.25Show/hide
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A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X23.2e-5986.58Show/hide
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A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X39.8e-6186.99Show/hide
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A0A5D3DN19 Uncharacterized protein3.4e-6187.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein2.4e-1136Show/hide
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        M +KK    SS S +S L   FG R + S SS+     +F S F P        +  ++ A  Y P    N +    +   + ++E  S+  E+   PC+
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        LSSSIYYGGQD Y+ +     N    +  G E DS  ASRGNWW+GS  Y
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AT3G55646.1 unknown protein1.4e-1439.72Show/hide
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        S +SS S    +FG R + S SS+     +F S F P     ++G +      F    G+ KY+    K   ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGG
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        Q+ Y+    T  ++  K+D G E DS  ASRGNWW+GSLYY
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AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).6.8e-2248.28Show/hide
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        S  SS S TS+LFG R+ PS  SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +   KT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
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        YYGG DVY Q   +  NS  K+D GGEDDSG ASRGNWWQGSLYY
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AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).8.6e-0940.68Show/hide
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        S  SS S TS+LFG R+ PS  SS+ I G +F    K  G     Q +  GG     +   KT GN      +N          + Q+QR  PCHLSSSI
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        YYGG DVY Q   +  NS
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AT5G59080.1 unknown protein3.5e-1840.82Show/hide
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        S ++S SFT++LFG +D +P  SS+ IF  +F    K S +                 +G++     K+GS + R      QE R  PCHLSSS+YYGGQ
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        DVY ++       P+K D    GEDD+ G      SRGNWWQGSLYY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAACCATCCGATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTCCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCTTCTTCTTTCAAGCCCTCCGGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACCTGCTCTTTCATACTTCCCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGA
ATGGGAGCACATCAAGCAGAGAGATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGTGGTCAGGATGTCTATACTCAA
AATCCAGCAACTGGGTTCAACTCCCCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCTGGCGGTGCTTCTAGGGGAAATTGGTGGCAAGGCTCTCTTTACTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGCAATACAATGGCTTTCACTAATCCTTTTCTTTCCCCTCCTTGTTATATTTTGTTCCGGCGACGGCAACTGATTCCTTTTCTGAAATATGTCGGAGAAGAAACCATCCG
ATGCCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGATCAGAGACACTCCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTTCTCTTCTTCTTTCAAGCCCTCC
GGCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACCTGCTCTTTCATACTTCCCCAAAACTGAAGGAAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGAATGGGAGCACATCAAGCAGAGA
GATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGTGGTCAGGATGTCTATACTCAAAATCCAGCAACTGGGTTCAACT
CCCCTTTAAAGAGAGATCATGGGGGAGAAGATGATTCTGGCGGTGCTTCTAGGGGAAATTGGTGGCAAGGCTCTCTTTACTATTGAGAAACTCACACCCCGCCATCAAGG
TGCAACACACACTCCATTACAATAAATATAATACATGGAGATGAATCATACAGGATTTTACCAGCCAAAATGGTAGTCGAGACATCTACTTTTAAAGTTGGAGAGGTTCA
AACTTTTATACGTAACATTTGTTGTACTTAAAACGAGGATGTTACACTATCATGATAATGGTTATTAACATCATTCCAGCAAAGAAGTAGAATGTTTATCAAGTTGTATT
TGAAGTCTGTATATAAAATATATATTTGGTAAGAAATGGATATGAAGACAAGAGAATCTGGAATTGTTTGCGCATAGGATATAGTCTTATCCTTATCTTCATATACTCAT
CCCATCTTTTCTTATACTTTAATGACCCTATCCAATGTATAATTCTCAGATGTTTCTTCTATTGGTGTAAGTGTGCATAAATGTGTTTGTGGTAATTTACCCACTTCAGC
ATATACATTCTTTTAAAGTAAAAGAGGTTGCGTTTTGAAACTCTACCTCCAATTAAAAATTAATGCCACATGTTAAAAGACATCTTTATGTGAACTGCCCTGATGTGGGT
TGTGTTACATGATAAAGTTGAATAAGAGGTCAATTCGTCTCTTATGTCAATGTTAGATCGATAAGAATGTGAACATATCGATGTCGATTGATGGAAATGTAAAGGTAAAA
GATGGAAATGTGAAGGTAAAAGATGGAAATGCGGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NPATGFNSPLKRDHGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY