; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G33110 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G33110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionsyntaxin-71
Genome locationChr3:29306383..29310707
RNA-Seq ExpressionCSPI03G33110
SyntenyCSPI03G33110
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044019.1 syntaxin-71 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-13498.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY +
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV

XP_004144411.1 syntaxin-71 [Cucumis sativus]2.1e-13598.11Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008442667.1 PREDICTED: syntaxin-71 [Cucumis melo]2.9e-13799.62Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_008461731.1 PREDICTED: syntaxin-71-like [Cucumis melo]4.1e-13698.11Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_038904060.1 syntaxin-71 [Benincasa hispida]3.5e-13597.36Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYA+VEADIEAALQKAEDASKEKNRAS+VALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVT+TKNNGGWTSSASR EIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LE82 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein9.9e-13698.11Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT+SASRTEIKFDS GRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A0A0LFR8 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein9.9e-13698.87Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADI+AALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQV LMDEIDTKVDKAASDLKNTN RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3B689 syntaxin-711.4e-13799.62Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3CFA3 syntaxin-71-like2.0e-13698.11Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE+VPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A5A7TS26 Syntaxin-718.4e-13598.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY +
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B7.9e-0523.61Show/hide
Query:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT
        D   +L  ++ ADI+      E + +++N   +V  N  A++R     +  E+ +LQ  L     + +  ++L  R + V   +++ +++ +  D  +  
Subjt:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTVTT

Query:  TKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
        T        + +   I + S+ +F     + TE + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D  + 
Subjt:  TKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS

Query:  DLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL
         L+N N R+ +T+ Q   S    + I++L I++
Subjt:  DLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-732.1e-9066.67Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T +S QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TN+RLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Q94KK6 Syntaxin-724.8e-8764.66Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYDI+K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E+V KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W  +SA    IKFD S+   DD +FQ +E+SSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTN+RLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

Q9SF29 Syntaxin-711.4e-11078.2Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYD++KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EEVPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT  S+ SR +IKFDSDGRFDD+YFQ + +SSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09740.1 syntaxin of plants 719.9e-11278.2Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYD++KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EEVPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K+   WT  S+ SR +IKFDSDGRFDD+YFQ + +SSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWT--SSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTN+RLKDTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G45280.1 syntaxin of plants 723.4e-8864.66Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYDI+K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E+V KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K  N  W  +SA    IKFD S+   DD +FQ +E+SSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKN-NGGW-TSSASRTEIKFD-SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTN+RLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

AT3G61450.1 syntaxin of plants 731.5e-9166.67Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T +S QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TN+RLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G61450.2 syntaxin of plants 733.8e-9567.79Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYDI +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S + I+FD   SD R   EYFQ T +S QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFD---SDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TN+RLKDTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGACATAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGACGATGCCTTCGC
TCGTCTCTACGCCACCGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGAAAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGAAGTTCCCAAGTTGCAAAGGTTGGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACCACTCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGAATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGACTACCACGAAGAATAATGGGGGCTGGACATCCTCAGCTTCACGGACTGAAATCAAATTTGACTC
AGATGGGCGGTTTGATGATGAGTACTTCCAACACACCGAGCAGTCCAGTCAGTTCAGGCAGGAGTATGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACATGATAT
CAGAAGGGTTAGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTCCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACATTAGATTAAAGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATTGCTGC
CTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTCTTCATACCAGCCCATAGTTCAATTCTCGCCTTTCTGCACGCAGTCGCCCCATCTTCTTCAATCTTCTGTTCAGTTTCCACGCTCGCCTTTCAAGCCGGTCACCCTC
TCTCTGCCGGTGTTCAGTTGCTCGCACTTCTTCAACCCAGCCACCCCCACCCCAACACTCTCCACTTGCCCTTGAAACGGACGCCCTCCTTGTCGTCCGCCTTCCCGCCA
CGCTTTGGATTTGGTGTTGAACTTGTTTTCTGCTTATATTTTGAGATTGTCGGAACCACTTTCACCGCCGTTAGTCACCGGAAACCTACCGGAGCGCGGAAGCTAAGGAT
CGAAGATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGACATAGAAAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCCGGCGACGATGCC
TTCGCTCGTCTCTACGCCACCGTTGAAGCTGACATTGAAGCCGCTCTACAGAAAGCGGAGGATGCTTCTAAAGAGAAGAATAGGGCATCCGTGGTGGCGTTGAATGCGGA
GATTCGTCGTACGAAGGCTCGATTACTGGAGGAAGTTCCCAAGTTGCAAAGGTTGGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACCACTCGAAATGATT
TGGTGCTTGCATTGCCGGATAGAATTCAAGCTATACCAGATGGAACTGTGACTACCACGAAGAATAATGGGGGCTGGACATCCTCAGCTTCACGGACTGAAATCAAATTT
GACTCAGATGGGCGGTTTGATGATGAGTACTTCCAACACACCGAGCAGTCCAGTCAGTTCAGGCAGGAGTATGAAATGAGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTGGACAT
GATATCAGAAGGGTTAGATACTCTGAAGAATATGGCACATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTCCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTG
CATCTGACCTTAAGAACACCAACATTAGATTAAAGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGGATT
GCTGCCTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGAGCTAACAAAGGAAAGAAATCTTCATGTTCTCGTGGAATATTTGTGTCAAGTTTGCTAAGAAGAATATCTGTATCCAG
TACATTATCTGATCGTGTTTGTGTTGTTTATAATATTTGTATGTCATATTCTTTTACACCGGACTCGCTGTGTACTATCAATTCTTGGTTATGTTGCTTGATTCTTTAAT
GTTGCACTTGTATAACCTGTCCTTGCTTTTGGCTTCAAATTTGAATACTGATAGCCCATGCTTGACATTTTAGATCAGATGTAGAAATCAAGACAACATGTATTGAAATG
TTTTGTGATAACAGCCATCTGATCGATGAATGTCGTTGCCATGTAAGCTCATCCTTCCCTAATGGATTGTATACAACCACTGCTTTTGTTTATGATATCAATTTGGACAT
GCATCTCAAAGTGGATCATGATCAAAACTTTGATCAACAAATCGATTAAGATGGGTAGTCCTTTTGGCTTCTCTCTACTACCCATTATAGCCCAGGAGAAAATGGAGACG
ACGAACGAGAATTGAGACCCCTTGTTTTACTAGAACTATGTAGGTTGTAGCGTTGTAAATTTGAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDIEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV
LALPDRIQAIPDGTVTTTKNNGGWTSSASRTEIKFDSDGRFDDEYFQHTEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNIRLKDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK