; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G35210 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G35210
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTF-B3 domain-containing protein
Genome locationChr3:30780400..30784077
RNA-Seq ExpressionCSPI03G35210
SyntenyCSPI03G35210
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038905859.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.2e-14186.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBH2 TF-B3 domain-containing protein3.3e-16498.66Show/hide
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A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X19.1e-15493.69Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X23.8e-14493.36Show/hide
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A0A6J1F8D4 B3 domain-containing protein At2g36080-like4.1e-11475.5Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like1.4e-11476.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560007.4e-4450.86Show/hide
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        S + S G+  S+ LRLFGV+L+C      PEP
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Q7F9W2 B3 domain-containing protein Os04g05814001.0e-3758Show/hide
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        V F R   +   DRLFI WK+R+           P P  S      GG G
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360805.3e-5848.33Show/hide
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        DE GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R                             ++S  +S+RH+
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         S    S    PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115801.1e-4747.51Show/hide
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        K LDAGDVV F RHR D  RLFIGW++R   S + + +V +    V     W+G+        ++ +YPN H+      Y +  D  HA+S      V  
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        G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP P P + N             +H +Y  YS+P P ++ F
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Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062501.3e-5145.39Show/hide
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        MS+N++S D H   L+   Q     ++  + + A   H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+          ++AAA   S++KG+L
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Query:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN
        LSFEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G            + +
Subjt:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN

Query:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
        +Y N   H     Y ++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
Subjt:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein3.8e-5948.33Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFE
        MSIN +S DFH   L    Q     +    +    A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL             AAAA D+ +KGLLL FE
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFE

Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSANSYPNSHRHL
        DE GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R                             ++S  +S+RH+
Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSANSYPNSHRHL

Query:  PSPPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT
         S    S    PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
Subjt:  PSPPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein3.0e-4860.36Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFE
        MSIN +S DFH   L    Q     +    +    A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL             AAAA D+ +KGLLL FE
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFE

Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-SAPSPTDS
        DE GK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW++R  + S +DS
Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-SAPSPTDS

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein7.8e-4947.51Show/hide
Query:  VAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKE
        VA A    +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +     +    A     + +KG+LLSFEDESGK W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+
Subjt:  VAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKE

Query:  KRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDS-AVATGSGGVGGGGGWTGMFC------SANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSI
        K LDAGDVV F RHR D  RLFIGW++R   S + + +V +    V     W+G+        ++ +YPN H+      Y +  D  HA+S      V  
Subjt:  KRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDS-AVATGSGGVGGGGGWTGMFC------SANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSI

Query:  GNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF
        G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP P P + N             +H +Y  YS+P P ++ F
Subjt:  GNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein2.9e-5145.39Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLL
        MS+N++S D H   L+   Q     ++  + + A   H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+          ++AAA   S++KG+L
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLL

Query:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN
        LSFEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G             A 
Subjt:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN

Query:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
        SY   H        +++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
Subjt:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein9.0e-5345.39Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLL
        MS+N++S D H   L+   Q     ++  + + A   H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+          ++AAA   S++KG+L
Subjt:  MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLL

Query:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN
        LSFEDESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F RHR D  RLFIGW++R     S+ + T+SAV T S G            + +
Subjt:  LSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKR-----SAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSAN

Query:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM
        +Y N   H     Y ++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++ +     ++  + T+   D       Y +YS   PH+M
Subjt:  SYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDP-TRHTFYPHYSSPLPHHM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATAAACAACTTCTCTCCTGACTTCCATCAACCACCTCTTTTCTCTACTTCCCAACTTCCCATCATGCTCAACTCCAAATCCTCTCTCTCCGTCGCCCCCGCCGA
CCACCTTCCCATGTTCGAGAAACCCTTGACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCAGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCG
CCGCAGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCGGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGT
TACTCTTATTGGAATAGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGAGGCTCGATGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGACCGCCACCG
CCGTGACGGTGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAAAAGAGGTCGGCACCGTCTCCAACGGACAGTGCGGTGGCTACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGA
CTGGAATGTTCTGTTCTGCAAATTCATATCCTAATTCTCATCGTCATCTTCCTTCACCGCCATACCAGTCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGT
CAAACAGTGTCGATTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCTGAACCACCGTCGTTGCTCAATATCGGGTC
AAGTTTAACTTTATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGA
CGAAATATCAAGGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAATTAGATGCACAAAATAGATATTACTTGAAATTAAATATGAAAACATATGTTAGATGACAACTCGCAAATAGAATGGAAATGGGTGGAACCGATGCAAATAAGTACT
TTTGAATGGACTGTGGAGTATGGGTGTGTAGATAAAATCCTCACTCATTTCTTCTGTGTCTTCTAAACAAAAAGAAAAATAAAATGTCCATAAACAACTTCTCTCCTGAC
TTCCATCAACCACCTCTTTTCTCTACTTCCCAACTTCCCATCATGCTCAACTCCAAATCCTCTCTCTCCGTCGCCCCCGCCGACCACCTTCCCATGTTCGAGAAACCCTT
GACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCAGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCGCCGCAGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCG
CTGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCGGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGGAATAGTAGTCAGAGC
TATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGAGGCTCGATGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGACCGCCACCGCCGTGACGGTGATAGGTTGTTCATTGG
GTGGAAAAAGAGGTCGGCACCGTCTCCAACGGACAGTGCGGTGGCTACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTGGAATGTTCTGTTCTGCAAATTCAT
ATCCTAATTCTCATCGTCATCTTCCTTCACCGCCATACCAGTCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGATTGGGAATTCAAAG
ATACTGCGGCTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCTGAACCACCGTCGTTGCTCAATATCGGGTCAAGTTTAACTTTATCGGGTCGAGATCC
AACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAATATCAAGGATAGAGATGGGTGG
ATGTGACGTCCCTGTACTGCGAAAAACCCCACTTTTTATTTATTTGTTTAATTAAATTCCCCCACCACTTCACTTGACAAAAGTCACCCCATTAAAAAGAAGGGGAAAAT
ACATAACAAAAAAAAAGGGAAATCCCAGATTTTCTGGCCGACTTCCCAAGGTTATGGATGGAGGGTGTAAACAGAGATGACGGATAAGGATTAACACGAGTGGGGTCCAA
GAAGAAAGCAAATGGGAAACTAGGGCCGTTGAAGGTCAGGAATGAGGAATCTATTTTGAGTACTGTTGAGATTCTGGGTGGAGATTTTTGAGAGATTAGGCTCAAAAATA
TGAGTAATGGAAAAAGGGGAGGGAGAGGGTATGGGGCTGTGTGTTAGTGCTTTTTATTTTGGGTGGGTGAGGATTAGATGGATCGTTGACACTCCCGCCTTCTACTCCTA
TTACTATTTTATAAGTTTTCGCAAAATCTAACCTTTCTTTCTCACCTCATTTATATAAAGATCTTCTTCTCACTTGTCGTGTCCTCATCTGCTCTGCTTCACTAGAGGTA
GATGTTCAATTTTTTCATGCTTTGTCTGCCCCTGCATTCAATATCAAGATGGAAATTTAGATTCATTTTGAATGAAATGAAATGACATCTAAAAGAAAATCCAGCTTTGT
GATGAACATACAATTAATCAAGCATTTACTACAGTGATTGTTTTCACAAAAACTGTGGTGACCATTTATCAGTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSINNFSPDFHQPPLFSTSQLPIMLNSKSSLSVAPADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFR
YSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFDRHRRDGDRLFIGWKKRSAPSPTDSAVATGSGGVGGGGGWTGMFCSANSYPNSHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQS
QTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNIGSSLTLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDFTFSQDVNQTKYQG