; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G35480 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G35480
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionNDR1/HIN1-like protein 10
Genome locationChr3:30971097..30971678
RNA-Seq ExpressionCSPI03G35480
SyntenyCSPI03G35480
Gene Ontology termsGO:0098542 - defense response to other organism (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR004864 - Late embryogenesis abundant protein, LEA_2 subgroup
IPR044839 - Protein NDR1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651105.1 hypothetical protein Csa_001204 [Cucumis sativus]2.8e-8998.81Show/hide
Query:  VLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEGQRAVVIS
        VLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL+YNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEGQRAVVI 
Subjt:  VLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEGQRAVVIS

Query:  NNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCH
        NNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCH
Subjt:  NNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCH

XP_004136708.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Cucumis sativus]5.7e-10398.96Show/hide
Query:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
        MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL+YNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
Subjt:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY

Query:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVI NNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
Subjt:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

XP_008443591.1 PREDICTED: protein YLS9-like [Cucumis melo]8.6e-9994.82Show/hide
Query:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
        MASLWCLLISVIVAFG SFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL+YNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
Subjt:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY

Query:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVI NNKVSEL SEKLAGVYS+DVKFRLSLRLKFGIYKI+RVRPKVEC FQVPLN +GTSSFPWFQ+AIGCHVDY
Subjt:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

XP_008443592.1 PREDICTED: protein YLS9-like [Cucumis melo]2.9e-7878.53Show/hide
Query:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT
        SLWC LIS+IV   +SFG ++LILWL+FIT+KIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL YNLG++FTIRNPN++VGIYYDTI+ATAMYK QNFDTRLLTPFYQ 
Subjt:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT

Query:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
          TTSLL+GRFEGQ+ VVI NN VSEL SEKL+GVYSIDV+FRLSLRLKFG++K IRVRPKV CGFQVPLN +G SS   FQ+AIGC VDY
Subjt:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

XP_038904447.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Benincasa hispida]1.2e-9288.08Show/hide
Query:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
        MASLWCLL+ VI+ FGVSFGF+VLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL YNLG+YFTIRNPNE+VGIYYDTIEAT  YKDQNF TRLLTPFY
Subjt:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY

Query:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        QTPKTTSLL+GRFEGQ+ VVI+NNKVSE N+EKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFG+YKIIRVRPKV CGFQ+PLN +GTSSFPWFQ AIGCHVDY
Subjt:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEQ7 LEA_2 domain-containing protein5.3e-7878.01Show/hide
Query:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT
        S+WCLLISVI+AF +SFG ++LILWL+FIT+KIKF+VTDA LTQFNFTNNDTQL YNLG++FTIRNPN+++GIYYDTIEATAMYK QNFDTRLLTPFYQ 
Subjt:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT

Query:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
         +TTSLL+GRF+GQR VVI NN VSEL SEKL+GVYSI+VKFRLS RLK G+YK IRVRPKV CGFQVPL  +GTSS   FQ+AIGC VDY
Subjt:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

A0A0A0LGS2 LEA_2 domain-containing protein2.8e-10398.96Show/hide
Query:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
        MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL+YNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
Subjt:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY

Query:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVI NNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
Subjt:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

A0A1S3B955 protein YLS9-like4.2e-9994.82Show/hide
Query:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
        MASLWCLLISVIVAFG SFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL+YNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY
Subjt:  MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFY

Query:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVI NNKVSEL SEKLAGVYS+DVKFRLSLRLKFGIYKI+RVRPKVEC FQVPLN +GTSSFPWFQ+AIGCHVDY
Subjt:  QTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

A0A1S3B970 protein YLS9-like1.4e-7878.53Show/hide
Query:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT
        SLWC LIS+IV   +SFG ++LILWL+FIT+KIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL YNLG++FTIRNPN++VGIYYDTI+ATAMYK QNFDTRLLTPFYQ 
Subjt:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT

Query:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
          TTSLL+GRFEGQ+ VVI NN VSEL SEKL+GVYSIDV+FRLSLRLKFG++K IRVRPKV CGFQVPLN +G SS   FQ+AIGC VDY
Subjt:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

A0A5A7TR00 Protein YLS9-like1.4e-7878.53Show/hide
Query:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT
        SLWC LIS+IV   +SFG ++LILWL+FIT+KIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQL YNLG++FTIRNPN++VGIYYDTI+ATAMYK QNFDTRLLTPFYQ 
Subjt:  SLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQT

Query:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
          TTSLL+GRFEGQ+ VVI NN VSEL SEKL+GVYSIDV+FRLSLRLKFG++K IRVRPKV CGFQVPLN +G SS   FQ+AIGC VDY
Subjt:  PKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LD98 NDR1/HIN1-like protein 65.9e-1029.88Show/hide
Query:  WCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYY-DTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP
        +C L+ ++VA G S G    IL+LVF      +++    LT+F   N D+ L     +  T +NPNE++GIYY D  + T  Y +       L  FYQ  
Subjt:  WCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYY-DTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP

Query:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECG
        + T+++     GQ     S  + +    ++  G   + ++    +R+KFG  K+  VR  V CG
Subjt:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECG

Q9C615 Putative syntaxin-241.6e-1834.46Show/hide
Query:  THKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNS
        ++ +KF V DA LT F+  +N+  L+Y+L +  +IRN    +GI+YD  EAT  Y +Q      +  FY   K T LLR  FEGQ  V++  N+  +   
Subjt:  THKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNS

Query:  EKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSS
        ++  GVY IDVK  ++ R+         ++P V C  ++PL    ++S
Subjt:  EKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSS

Q9FNH6 NDR1/HIN1-like protein 32.9e-3340.53Show/hide
Query:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNF--TNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTP
        ++ ++++   V  G   LI+WL+F  + IKF+VTDA LT+F    TNN   LRYNL + FTIRNPN R+G+YYD IE    Y DQ F  +  ++ FYQ  
Subjt:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNF--TNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTP

Query:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        K T+++  +  GQ+ V++   +  +LN +  + +Y ID K RL +R KFG+ K  R +PK++C  +VPL    TS F +      C VD+
Subjt:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

Q9SJ52 NDR1/HIN1-like protein 101.7e-3642.41Show/hide
Query:  LWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP
        L  L + VI++  V  G   LI WL+     IKF+VTDA+LT+F+ T+ D  LRYNL +   +RNPN+R+G+YYD IEA A Y+ + F T  LTPFYQ  
Subjt:  LWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP

Query:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        K T++L   F+GQ  V+ +  +   LN+E+++GVY+I++KFRL +R K G  K  R++PKV+C   ++PL+ +  ++       I C  D+
Subjt:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

Q9SRN1 NDR1/HIN1-like protein 28.8e-3039.33Show/hide
Query:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT
        L+ ++++A  V  G   LILWL+F  + +KF V DA L +F+F  N+  L Y+L + FTIRNPN+RVG+YYD    +  Y DQ F +  ++ FYQ  K T
Subjt:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT

Query:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPL---NFTGTSSF
        +++  + EGQ  VV+ +   ++L  ++ +G+Y I+ K RLS+R KF   K  +++PK++C   ++PL   N TG   F
Subjt:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPL---NFTGTSSF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35460.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family4.3e-3237.63Show/hide
Query:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT
        ++ ++++   V  G   LILW +   + +KF VT+A LT+F F      L YN+ + F+IRNPN+R+GI+YD +E    Y DQ F    +T FYQ  K T
Subjt:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT

Query:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVD
        +++     GQ+ V++      +   ++ +GVY IDVK R  LR KFG      VRPK++C  +VPL+ T +S   +      CHVD
Subjt:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVD

AT2G35980.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family1.2e-3742.41Show/hide
Query:  LWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP
        L  L + VI++  V  G   LI WL+     IKF+VTDA+LT+F+ T+ D  LRYNL +   +RNPN+R+G+YYD IEA A Y+ + F T  LTPFYQ  
Subjt:  LWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTP

Query:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        K T++L   F+GQ  V+ +  +   LN+E+++GVY+I++KFRL +R K G  K  R++PKV+C   ++PL+ +  ++       I C  D+
Subjt:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

AT3G11650.1 NDR1/HIN1-like 26.2e-3139.33Show/hide
Query:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT
        L+ ++++A  V  G   LILWL+F  + +KF V DA L +F+F  N+  L Y+L + FTIRNPN+RVG+YYD    +  Y DQ F +  ++ FYQ  K T
Subjt:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTT

Query:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPL---NFTGTSSF
        +++  + EGQ  VV+ +   ++L  ++ +G+Y I+ K RLS+R KF   K  +++PK++C   ++PL   N TG   F
Subjt:  SLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVEC-GFQVPL---NFTGTSSF

AT5G06320.1 NDR1/HIN1-like 32.1e-3440.53Show/hide
Query:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNF--TNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTP
        ++ ++++   V  G   LI+WL+F  + IKF+VTDA LT+F    TNN   LRYNL + FTIRNPN R+G+YYD IE    Y DQ F  +  ++ FYQ  
Subjt:  LLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNF--TNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTP

Query:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY
        K T+++  +  GQ+ V++   +  +LN +  + +Y ID K RL +R KFG+ K  R +PK++C  +VPL    TS F +      C VD+
Subjt:  KTTSLLRGRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY

AT5G22200.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family2.7e-1028.49Show/hide
Query:  VSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEG
        V+  F V ++W +   H  +F + D T+  FN  +    L  NL +  + RNPN+++GI+YD ++    Y++Q     RLL   YQ     ++      G
Subjt:  VSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFD-TRLLTPFYQTPKTTSLLRGRFEG

Query:  QRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECG--FQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVD
          AV ++    S LN +  AG+  +++K    +R K G +     R  V C     V    TGT     +Q    C VD
Subjt:  QRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECG--FQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAGTTTATGGTGTCTTTTAATATCTGTTATTGTTGCTTTTGGTGTATCTTTTGGGTTCACAGTATTGATCTTATGGCTTGTTTTCATAACCCACAAGATCAAATT
CAATGTAACAGATGCAACTCTAACCCAATTCAACTTCACCAACAATGACACACAGCTCCGATACAATCTTGGCATTTACTTCACCATTAGAAACCCTAATGAGCGTGTTG
GAATATATTATGACACCATTGAAGCAACTGCAATGTATAAAGATCAAAACTTCGACACAAGATTGCTAACTCCATTTTACCAAACCCCAAAGACAACAAGCTTACTTAGA
GGACGATTTGAAGGGCAACGGGCTGTGGTAATTAGCAACAACAAAGTTTCTGAATTGAATTCTGAGAAACTTGCTGGAGTTTATTCAATTGATGTCAAATTTCGTCTTTC
GTTGAGGTTGAAATTCGGGATTTATAAAATTATTAGAGTTAGGCCTAAAGTGGAATGTGGATTCCAAGTTCCATTGAATTTTACTGGAACTTCTTCTTTTCCTTGGTTTC
AAGATGCTATTGGTTGTCATGTCGATTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAAGTTTATGGTGTCTTTTAATATCTGTTATTGTTGCTTTTGGTGTATCTTTTGGGTTCACAGTATTGATCTTATGGCTTGTTTTCATAACCCACAAGATCAAATT
CAATGTAACAGATGCAACTCTAACCCAATTCAACTTCACCAACAATGACACACAGCTCCGATACAATCTTGGCATTTACTTCACCATTAGAAACCCTAATGAGCGTGTTG
GAATATATTATGACACCATTGAAGCAACTGCAATGTATAAAGATCAAAACTTCGACACAAGATTGCTAACTCCATTTTACCAAACCCCAAAGACAACAAGCTTACTTAGA
GGACGATTTGAAGGGCAACGGGCTGTGGTAATTAGCAACAACAAAGTTTCTGAATTGAATTCTGAGAAACTTGCTGGAGTTTATTCAATTGATGTCAAATTTCGTCTTTC
GTTGAGGTTGAAATTCGGGATTTATAAAATTATTAGAGTTAGGCCTAAAGTGGAATGTGGATTCCAAGTTCCATTGAATTTTACTGGAACTTCTTCTTTTCCTTGGTTTC
AAGATGCTATTGGTTGTCATGTCGATTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASLWCLLISVIVAFGVSFGFTVLILWLVFITHKIKFNVTDATLTQFNFTNNDTQLRYNLGIYFTIRNPNERVGIYYDTIEATAMYKDQNFDTRLLTPFYQTPKTTSLLR
GRFEGQRAVVISNNKVSELNSEKLAGVYSIDVKFRLSLRLKFGIYKIIRVRPKVECGFQVPLNFTGTSSFPWFQDAIGCHVDY