; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G35860 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G35860
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionFra a 1-associated protein
Genome locationChr3:31251203..31254110
RNA-Seq ExpressionCSPI03G35860
SyntenyCSPI03G35860
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]7.1e-109100Show/hide
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XP_008442953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486704 [Cucumis melo]2.3e-9189.34Show/hide
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XP_022151462.1 uncharacterized protein LOC111019393 [Momordica charantia]1.4e-6771.57Show/hide
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          S H+P  FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  + SSS SMRRGIPI EDH+   F  P EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-6268.18Show/hide
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        S  SE++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLFNR+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]2.6e-8785.79Show/hide
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          SEHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNR+SSSS SMRRGIPI EDH+P FF N KEPDSGHVDLSGLARDV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein3.5e-109100Show/hide
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867041.1e-9189.34Show/hide
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193936.6e-6871.57Show/hide
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          S H+P  FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  + SSS SMRRGIPI EDH+   F  P EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458453.2e-6267.68Show/hide
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        S  SE++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLF+R+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986062.4e-6267.68Show/hide
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        S  SE++P +FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPP+FNR+ SSS SMR+                 EPDSGHVDLSGLARDV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein5.6e-4852.76Show/hide
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        MGWVW+DD +        A       SP    D CSTR VVR+ CKTEEVEPGKF+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV++SNKE TE+DVTDQ++  S S G
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        S  +++   +FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S  S RR IPI+       F       SG VDLSGLARDV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein3.3e-4349.5Show/hide
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        MGW+W DD+  S + A   DK     S ++++ CST  VVRS CKTEEVEPGKFVRKC++TEEILR C G+P+EV++SN E TEEDVTDQMV RS +L +
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           +  PL+FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D           ++ R GIPIE     E+H        +   SG +DLSGLA+
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Query:  DV
        DV
Subjt:  DV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGACGATTCGGATTCATTCGCTGCCGATGCCGATAAGTTCAATAATTCCACCTCTCCGTCATCCAGCGATTGGTGTTCGACAAG
AAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGTGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGAGACTGCATTGGAAGGCCAACCG
AAGTGATAAAGTCCAACAAGGAAATTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCTCGTTGGGATCGTCACCATCAGAACATCGACCCCTTGATTTC
CCTGGGCTCCGTAGTGATATTGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAAGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAATGGTTTCTTTGGTTCTTTAAG
AGATCCACCCCTATTCAACAGAGATTCATCATCCTCCGCATCGATGAGACGTGGTATACCCATTGAAGAAGATCATGATCCAGTGTTCTTCTACAACCCAAAAGAGCCCG
ATTCTGGTCACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGATGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTCAAGAAAAACTCCACTGTAAGAGAGAATCTTGTGGCGTTGAGGAAGGTTCGCGATATCCGAGCTTCGAAAATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGACGATTCGG
ATTCATTCGCTGCCGATGCCGATAAGTTCAATAATTCCACCTCTCCGTCATCCAGCGATTGGTGTTCGACAAGAAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTT
GAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGTGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGAGACTGCATTGGAAGGCCAACCGAAGTGATAAAGTCCAACAAGGAAATTACGGAAGAGGA
TGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCTCGTTGGGATCGTCACCATCAGAACATCGACCCCTTGATTTCCCTGGGCTCCGTAGTGATATTGATGCCATTGAACAGA
GTCTCTTTGGTAGCATGAAAGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAATGGTTTCTTTGGTTCTTTAAGAGATCCACCCCTATTCAACAGAGATTCATCATCCTCC
GCATCGATGAGACGTGGTATACCCATTGAAGAAGATCATGATCCAGTGTTCTTCTACAACCCAAAAGAGCCCGATTCTGGTCACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGA
TGTCTAAATGCCCTAAATGAACCTGATCGCCCCTTTCTTTTTCTGATGTTAGATACTACGGGTACACAGTATATTGTCTTTAATTTTGGTGGCTGTACATTTGGTAATCA
ATAAAATACTCTTTAGTTTTTCCTTCAGCTAGTTTTGTTTTTCCCTGGAAGAGATCAAGTCTTAAGCAATTATTGTTATATATTCAACGTTTGCTTATAAATATTGACAT
ATTGATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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