CuGenDBv2

Gene ID	CSPI03G36050
Organism	Cucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Description	Spindle and kinetochore-associated protein 3
Genome location	Chr3:31388092..31391438
RNA-Seq Expression	CSPI03G36050
Synteny	CSPI03G36050
Gene Ontology terms	GO:0007049 - cell cycle (biological process) GO:0007059 - chromosome segregation (biological process) GO:0000940 - condensed chromosome outer kinetochore (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005819 - spindle (cellular component)
InterPro domains	IPR033341 - Spindle and kinetochore-associated protein 3

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0043769.1 putative UPF0184 protein [Cucumis melo var. makuwa]

2.1e-150

83.58

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL                                                SASSTFIQSLNRRVS
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS

Query:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS
        AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHS
Subjt:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS

Query:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM
        FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYM
Subjt:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM

Query:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG
        KGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLG
Subjt:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG

TYK25364.1 putative UPF0184 protein [Cucumis melo var. makuwa]

1.0e-149

83.28

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL                                                SASSTFIQSLNRRVS
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS

Query:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS
        AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVS PGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHS
Subjt:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS

Query:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM
        FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYM
Subjt:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM

Query:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG
        KGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLG
Subjt:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG

XP_004136543.3 uncharacterized protein LOC101214784 [Cucumis sativus]

4.1e-178

100

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
        GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
Subjt:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF

Query:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
        LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
Subjt:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF

Query:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
Subjt:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

XP_008442990.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486722 [Cucumis melo]

2.3e-173

96.91

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
        GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKF
Subjt:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF

Query:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
        LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLGPKARSF
Subjt:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF

Query:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        LLLLVRMKR++VETIEGQISYRVL
Subjt:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

XP_038905415.1 uncharacterized protein LOC120091453 [Benincasa hispida]

1.2e-161

90.43

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        MEELISNF+KTLAPFCNHLQN+ DALK SMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVS  NVDLN LESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNE+DLLELQKQLKGV
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
        GY+PEFE+DEDDEILN+VSTPGL++EL+SSMDGLNVPSSY KSVSTTGLAKHSFE+DILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTF DPY DLHTPKK 
Subjt:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF

Query:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
        LEKPLGSNFP QS  QTVG+PEGEGED+LTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVA EKINSCL  KGKGKNYILQDEIST+DLGPKARSF
Subjt:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF

Query:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        LLLLVRMKR+VVET+EGQISYRVL
Subjt:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LB63 Spindle and kinetochore-associated protein 3

1.4e-176

98.48

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLN-----RRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQK
        MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLN     RRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQK
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLN-----RRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQK

Query:  QLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLH
        QLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLH
Subjt:  QLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLH

Query:  TPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGP
        TPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGP
Subjt:  TPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGP

Query:  KARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        KARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
Subjt:  KARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

A0A1S3B6I8 Spindle and kinetochore-associated protein 3

1.1e-173

96.91

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
        GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKF
Subjt:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF

Query:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
        LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLGPKARSF
Subjt:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF

Query:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        LLLLVRMKR++VETIEGQISYRVL
Subjt:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

A0A5A7TRE6 Spindle and kinetochore-associated protein 3

1.0e-150

83.58

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL                                                SASSTFIQSLNRRVS
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS

Query:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS
        AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHS
Subjt:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS

Query:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM
        FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYM
Subjt:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM

Query:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG
        KGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLG
Subjt:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG

A0A5D3DP38 Spindle and kinetochore-associated protein 3

5.1e-150

83.28

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS
        ME+LISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL                                                SASSTFIQSLNRRVS
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPL-----------------------------------------------DSASSTFIQSLNRRVS

Query:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS
        AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVS PGLHFELSSSMDGLNV SSYQKSVSTTGLAKHS
Subjt:  AVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS

Query:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM
        FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTFSDPY+DLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTF+E ISPLITLSKDDFESLPSYM
Subjt:  FEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYM

Query:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG
        KGLASWEDLIVAAEKINSCLG+KGKGKNYILQDEIS+LDLG
Subjt:  KGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLG

A0A6J1DAY1 Spindle and kinetochore-associated protein 3

4.0e-147

83.33

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        MEELISNFSKTLAPFCNHLQNT DALK S+DRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVS V VDLN LESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNE+DLLELQK +KGV
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF
        GYVPEFE+DEDDEI N+VST GL+F++SS  DGL+VPSSYQ+SVSTTGLA HSF +DILLDD LSLQNAGLSDVCLATLA+EGNSTF DPY DLHTPK+F
Subjt:  GYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKF

Query:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF
        LEKPL S FPCQ   Q VG  EGEGED+LT +EAISPLI LSKDDFESLPSYMK L SWEDLIVA EKINSCL +K KGKNYILQDEIS++DLGPKARSF
Subjt:  LEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSF

Query:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL
        LL+ VRMKR+ VET++GQISYRVL
Subjt:  LLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G05760.1 syntaxin of plants 31

3.7e-04

28.3

Show/hide

Query:  VSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS--FED--------DILLDDSLSLQN
        +   ++    +L  L + LK +G +P    DEDD   +  S+PG  F   +S  GL +  + QK      LAK S  F D         +L+ + ++  N
Subjt:  VSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDEDDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHS--FED--------DILLDDSLSLQN

Query:  AGLSDV
          LSD+
Subjt:  AGLSDV

AT5G06590.1 unknown protein

8.8e-70

48.48

Show/hide

Query:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV
        MEE + + SK+L  FCNHLQ++ DA  HS+ RRPIPLDSASSTFI+ LNRR+S    +L+FLESMS  TVSFEELLGH S++YK N+ DLL LQ +L   
Subjt:  MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGV

Query:  GYVPEFEVDE--DDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPK
        GYVPE E+DE  D+E +          E S   D      S Q S+      K   ++D LLD+SL+L+N GLSD CLA LAT  N    DP   L    
Subjt:  GYVPEFEVDE--DDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPK

Query:  KFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDH---LTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGK--GKNYILQDEISTLDL
           E   G +F  + A     A E   ED    L  ++   P +TL K++++SLPS+MK LASWEDL+ A +K NS L  K +  G  Y   DEI TL L
Subjt:  KFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGAPEGEGEDH---LTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGK--GKNYILQDEISTLDL

Query:  GPKARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRV
        G K +++ LLL RMKR+VVET +G ISYRV
Subjt:  GPKARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTGATCTCGAACTTCAGCAAAACTCTAGCGCCCTTTTGCAATCATCTCCAAAACACCAGCGATGCCCTCAAGCATTCCATGGATCGCCGCCCCATTCCTCT
CGATTCGGCATCATCGACCTTTATACAATCTCTCAACCGCCGTGTGTCGGCTGTTAACGTTGATCTCAACTTTCTTGAATCAATGTCCTTAGAAACTGTATCCTTCGAGG
AGCTTTTAGGTCATGTTAGTGAAGTTTATAAGAAGAACGAAACTGATCTTTTGGAGCTACAGAAGCAGCTCAAGGGTGTTGGATATGTACCAGAGTTTGAGGTTGATGAA
GATGACGAAATTCTTAACAATGTATCAACGCCTGGGTTGCATTTTGAGCTTTCAAGTTCCATGGATGGATTGAACGTACCGTCTTCTTACCAGAAATCAGTCTCCACGAC
AGGACTTGCCAAGCATAGCTTCGAAGATGATATACTACTCGACGACTCTTTAAGCTTACAAAATGCTGGGCTTTCCGATGTTTGTCTTGCCACTCTAGCAACCGAAGGCA
ACTCTACGTTCAGTGACCCATACCAGGATTTGCATACACCAAAAAAATTCTTAGAGAAACCACTTGGCTCAAATTTTCCATGCCAATCTGCAGCACAAACTGTGGGAGCC
CCTGAAGGGGAAGGTGAAGATCACTTGACATTTGAAGAAGCCATTTCACCTCTAATTACGCTATCAAAGGACGATTTTGAAAGCCTCCCATCATATATGAAGGGCCTAGC
ATCATGGGAGGACCTCATCGTGGCTGCTGAGAAAATCAATTCATGCTTGGGGATAAAAGGCAAGGGAAAAAACTATATCCTTCAAGACGAAATTTCAACTTTGGACCTTG
GTCCCAAAGCAAGGTCTTTTCTGCTTCTACTTGTGCGAATGAAGCGAATGGTTGTTGAAACGATTGAGGGTCAAATATCTTATAGAGTTCTATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGATATTCCCGCCTTCGTGTTTCCATCTTCTTTCACAAAAGTAAGAAATACCGATCGATTGTTTCAAGCTTAAATTCAATTTGAGCATTTGGAAGTGAAGAAAAGAAGA
AGATCAATGGAGGAATTGATCTCGAACTTCAGCAAAACTCTAGCGCCCTTTTGCAATCATCTCCAAAACACCAGCGATGCCCTCAAGCATTCCATGGATCGCCGCCCCAT
TCCTCTCGATTCGGCATCATCGACCTTTATACAATCTCTCAACCGCCGTGTGTCGGCTGTTAACGTTGATCTCAACTTTCTTGAATCAATGTCCTTAGAAACTGTATCCT
TCGAGGAGCTTTTAGGTCATGTTAGTGAAGTTTATAAGAAGAACGAAACTGATCTTTTGGAGCTACAGAAGCAGCTCAAGGGTGTTGGATATGTACCAGAGTTTGAGGTT
GATGAAGATGACGAAATTCTTAACAATGTATCAACGCCTGGGTTGCATTTTGAGCTTTCAAGTTCCATGGATGGATTGAACGTACCGTCTTCTTACCAGAAATCAGTCTC
CACGACAGGACTTGCCAAGCATAGCTTCGAAGATGATATACTACTCGACGACTCTTTAAGCTTACAAAATGCTGGGCTTTCCGATGTTTGTCTTGCCACTCTAGCAACCG
AAGGCAACTCTACGTTCAGTGACCCATACCAGGATTTGCATACACCAAAAAAATTCTTAGAGAAACCACTTGGCTCAAATTTTCCATGCCAATCTGCAGCACAAACTGTG
GGAGCCCCTGAAGGGGAAGGTGAAGATCACTTGACATTTGAAGAAGCCATTTCACCTCTAATTACGCTATCAAAGGACGATTTTGAAAGCCTCCCATCATATATGAAGGG
CCTAGCATCATGGGAGGACCTCATCGTGGCTGCTGAGAAAATCAATTCATGCTTGGGGATAAAAGGCAAGGGAAAAAACTATATCCTTCAAGACGAAATTTCAACTTTGG
ACCTTGGTCCCAAAGCAAGGTCTTTTCTGCTTCTACTTGTGCGAATGAAGCGAATGGTTGTTGAAACGATTGAGGGTCAAATATCTTATAGAGTTCTATAGAGTGAATGA
ATTTGTCCTTCAATTTGATGAGATTGGATATCCTACACAGGTTCGCTCCTTGCATATATATCAATATCAGTACTTGAAATAAATTTTATTCTATGAATATGAATATGTTC
CTTTTGCATATAACATTCCACCTCTAGAATAATAAAAAGTCACATCAATTAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEELISNFSKTLAPFCNHLQNTSDALKHSMDRRPIPLDSASSTFIQSLNRRVSAVNVDLNFLESMSLETVSFEELLGHVSEVYKKNETDLLELQKQLKGVGYVPEFEVDE
DDEILNNVSTPGLHFELSSSMDGLNVPSSYQKSVSTTGLAKHSFEDDILLDDSLSLQNAGLSDVCLATLATEGNSTFSDPYQDLHTPKKFLEKPLGSNFPCQSAAQTVGA
PEGEGEDHLTFEEAISPLITLSKDDFESLPSYMKGLASWEDLIVAAEKINSCLGIKGKGKNYILQDEISTLDLGPKARSFLLLLVRMKRMVVETIEGQISYRVL

CSPI03G36050 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome