| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| KAE8651124.1 hypothetical protein Csa_000954 [Cucumis sativus] | 5.5e-107 | 97.63 | Show/hide |
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| XP_011652066.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.2e-108 | 98.1 | Show/hide |
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| XP_011652068.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.2e-108 | 98.1 | Show/hide |
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| XP_031739396.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucumis sativus] | 5.5e-107 | 97.63 | Show/hide |
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| XP_031739397.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucumis sativus] | 5.5e-107 | 97.63 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0LGW4 RRM domain-containing protein | 1.1e-108 | 98.1 | Show/hide |
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| A0A1S3B7U0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.7e-106 | 97.14 | Show/hide |
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| A0A6J1DCY5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 9.7e-94 | 89.15 | Show/hide |
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QVLLG ELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSY+Y R SPLRYSRSPH DRKYSR PEYYSPA+S RYSR SPR RRYRE+SY RSP D RGRSYSR
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SRSRSYSRSY R
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| A0A6J1KYI3 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X3 | 2.6e-86 | 83.96 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPRG GGR RD PTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
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QVLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP RKYSR PEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SYSRSP + R R YSR
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SRSRS SRSYSR
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| A0A6J1L0E4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 | 2.6e-86 | 83.96 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPRG GGR RD PTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
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QVLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP RKYSR PEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SYSRSP + R R YSR
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SRSRS SRSYSR
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 1.0e-23 | 39.15 | Show/hide |
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TSL VRN+ D R EDLR FGR+GP+ D+Y+P D+Y+ PRGF +VQF D DA DA + LD + + G ++ + FA+ +RK P +M+A++ S S
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+ R SRS +R+ SR + YSP SR R R R ++R +S+SRS S+ R RS S+ + ++S SR
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| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.2e-32 | 48.95 | Show/hide |
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R RS SYSP P R RSP PR R G R R+RP+S LL+RNL D RP DLR F RFGPLKDIYLPR+YY+GEPRGFGFV++
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A DAA+A ++ +V+ G E+ +VFAEENRK P+EMR + + GR Y SHR RY SRS P + ++S+ E YSP RSR SRSP
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R RE RSP + R R SRSRSRS SR
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|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 3.2e-33 | 46.85 | Show/hide |
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MR S Y P R YG R RSP P G GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
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A +A+ ++ + G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S S S R SRS R SR P S +RS RYR +SYS +P
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PRG RSYS Y
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|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.3e-55 | 62.27 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR G R D PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
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DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + R SP RYSRSP R SR Y SP R SR SP+ RRY +E+SYSRSP +
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Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
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|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 4.6e-56 | 63.51 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RD PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
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G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + R P YSRS P R SR +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP+
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RGRS + R +SRS S S R
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|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 3.2e-57 | 63.51 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RD PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
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G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + R P YSRS P R SR +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP+
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RGRS + R +SRS S S R
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|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 3.2e-57 | 63.13 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RD PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
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Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRS----PHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPSDPR
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + R P YSRS P R SR +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP+
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRS----PHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPSDPR
Query: GRSYSRSRSRSYSRSYS
R S + R SRS S
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|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 4.0e-55 | 59.83 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRGR-GGRRRDRPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR GGR RD PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G +PRGFGFVQF+D
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Query: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRS----PHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
ADAADAK+ +DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ G + R P YSRS P R SR +YYSP R + R SPR RY
Subjt: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRS----PHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
Query: EQSYSRSPSD--PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
+SYSRSP+ RGRS + R +SRS S S R
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|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.6e-56 | 62.27 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPRGR G R D PTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
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Query: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRSP---HCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--SD
DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + R SP RYSRSP R SR Y SP R SR SP+ RRY +E+SYSRSP +
Subjt: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRSP---HCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--SD
Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
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|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 2.3e-34 | 46.85 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RGRGGRRRDRPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
MR S Y P R YG R RSP P G GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
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Query: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRSPHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSP--
A +A+ ++ + G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S S S R SRS R SR P S +RS RYR +SYS +P
Subjt: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSHRHSPLRYSRSPHCDRKYSRCPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSP--
Query: --SDPRGRSYSRSRSRSYSRSY
PRG RSYS Y
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|
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