; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G38130 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G38130
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionCold and drought regulatory protein
Genome locationChr3:32990094..32991351
RNA-Seq ExpressionCSPI03G38130
SyntenyCSPI03G38130
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7028450.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-2273.79Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG-DSSSDS
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGEHH+  K EH+ EH  +H +  EHHGEG HKEG+M+KIKDKIH GDHH+EKGE KKKKEKKKKGEH   HEGG  SSSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG-DSSSDS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD

XP_008443295.1 PREDICTED: protein SRC1 [Cucumis melo]6.6e-3486.67Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEGI++KIKDKIHGGD HH+EKGEKKKKEKKKKGEHGH+H GGDSSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

XP_011652200.1 protein SRC1 [Cucumis sativus]4.9e-45100Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSSDSDS
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSSDSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSSDSDS

Query:  D
        D
Subjt:  D

XP_023538905.1 protein SRC1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-2271.82Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGD----HKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG
        MSG +EKIGEKLHIGGD    HKGEHH+  K EH+ + H+  KKH    EHHGEG HKEG+M+KIKDKIHGGDHH+EKGE KKKKEKKKKGEH   HEGG
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGD----HKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG

Query:  -DSSSDSDSD
          SSSDSDSD
Subjt:  -DSSSDSDSD

XP_038903205.1 protein SRC1 [Benincasa hispida]5.6e-2577.78Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDH-KGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKK---KKEKKKKGEHGHKHEGGD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDH KGEHHD     HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEG+++KIKDKIHG   H+EKGEKK   KKEKKKKGEH H H+GG 
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDH-KGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKK---KKEKKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSDSD
        SSSDSDSD
Subjt:  SSSDSDSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0B2SHK1 Uncharacterized protein6.9e-2167.92Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD
        MSG I KI E LH+GG    +HKGEHH  HKGEHKGEHH EHK   K E+HHGE  HKEG++DKIKDKIHG  H  +KGEKKKK+ KKK EHGH H G  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSD
        SSSDSD
Subjt:  SSSDSD

A0A0R0FQD3 Uncharacterized protein6.9e-2167.92Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD
        MSG I KI E LH+GG    +HKGEHH  HKGEHKGEHH EHK   K E+HHGE  HKEG++DKIKDKIHG  H  +KGEKKKK+ KKK EHGH H G  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSD
        SSSDSD
Subjt:  SSSDSD

A0A1S3B8E4 protein SRC13.2e-3486.67Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEGI++KIKDKIHGGD HH+EKGEKKKKEKKKKGEHGH+H GGDSSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP63.2e-3486.67Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDA    HKGEHHDEHKKH   EEHHGEG HKEGI++KIKDKIHGGD HH+EKGEKKKKEKKKKGEHGH+H GGDSSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKH---EEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGD-HHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

A0A6J1FQD3 protein SRC1-like1.5e-2071.84Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG-DSSSDS
        M+G +EKIGEKLHIGGDHKGEH   H  + K EH  +H +  EHHGEG HKEG+M+KIKDKIH GDHH+EKGE KKKKEKKKKGEH   HEGG  SSSDS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE-KKKKEKKKKGEHGHKHEGG-DSSSDS

Query:  DSD
        DSD
Subjt:  DSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC11.9e-2367.92Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD
        MSG I KI E LH+GG    +HKGEHH  HKGEHKGEHH EHK   K E+HHGE  HKEG++DKIKDKIHG  H  +KGEKKKK+ KKK EHGH H G  
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGG----DHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHK---KHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGD

Query:  SSSDSD
        SSSDSD
Subjt:  SSSDSD

Q9SLJ2 Dehydrin HIRD112.5e-1253.21Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE--------KKKKEKKKKGEHGHKHEGG
        M+G I KIG+ LHIGG +K       +GEHK E  +EHKKH + H  G HKEGI+DKIKDKIHGG+     GE        KKKK+KK+K  H   H   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE--------KKKKEKKKKGEHGHKHEGG

Query:  DSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  DSSSDSDSD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein1.8e-1353.21Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE--------KKKKEKKKKGEHGHKHEGG
        M+G I KIG+ LHIGG +K       +GEHK E  +EHKKH + H  G HKEGI+DKIKDKIHGG+     GE        KKKK+KK+K  H   H   
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGE--------KKKKEKKKKGEHGHKHEGG

Query:  DSSSDSDSD
         SSSDSDSD
Subjt:  DSSSDSDSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGATTCATTGAGAAAATCGGCGAGAAGCTCCACATTGGAGGCGATCACAAGGGAGAGCACCACGACGCTCACAAGGGCGAGCACAAGGGTGAGCATCACGATGA
ACACAAGAAGCACGAGGAGCACCATGGAGAAGGGGCGCACAAGGAAGGGATAATGGACAAGATCAAGGATAAGATCCATGGGGGTGATCATCATGAGGAGAAAGGGGAGA
AGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCCACAAACACGAAGGTGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATTAAAGCAATAAGATAGCGTCAATCAAAATCAACGGATACATTGTGGATAAACTGAATTTATTCGTTTCAATTCGTCTTTCCTCCTCCCTCGCCATCTATAAATTCCC
CTTCTTTCCTTCCCCATTTTCCACAAACACGCATCCTCTTCAAAACCTCATTCCAAATTCATCATCAAAACATGTCTGGATTCATTGAGAAAATCGGCGAGAAGCTCCAC
ATTGGAGGCGATCACAAGGGAGAGCACCACGACGCTCACAAGGGCGAGCACAAGGGTGAGCATCACGATGAACACAAGAAGCACGAGGAGCACCATGGAGAAGGGGCGCA
CAAGGAAGGGATAATGGACAAGATCAAGGATAAGATCCATGGGGGTGATCATCATGAGGAGAAAGGGGAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGGGTGAGCACGGCC
ACAAACACGAAGGTGGAGATAGCAGCAGCGATAGCGATAGCGATTGATGGGTCAGATCTCGGAATCATTATTAAGAGGTAGATTGTGTTCCGATCGCGTGCTGGTGTGTT
CAAGAATAATCTCACTCCCTTTTGGTTTAATTAATCATCCCTCTGTTTCCGATCTCTGTTTCTCTATCTTTGTTTCTTTTTGTTTTTAATCTAAGACTACGTTATGTACT
GTATGTGTGATGTATAATAAAGATTAAGAGATTTTATATGATCTTTACTAATGTTCATAACATCTCTATGGTGGTTTTTTTTAATTATTATTATTCGGACTGGAAATCCA
ACATTTTACTCTTAATTAGGGAAGAAGATCGGAGACATCAATTACGGGAAACTCACTTTAGTTGGAGAAACAACAGAAATGCATAAAAATTGCTTCCAAGTACTAATAGG
TCATTTGTTGGGACTCTAAAAAAAGGATATCAAAATTCAAAACAGTTTCACCATGAAAATTCTGAATGTTGATATAAAATCTGGAGTGAGTTTGTAGATTCCCAACGATC
CATTGTGACATGGGTTGGTTCAATACTGGGTACCAAAAGAAGTAAACAACCTTAGATTTAGTTTTATTTGGAAGCTTTAAATTTTGAAATATCTGCCATATATGAAACAG
CTGTCTCCTAAACATATTGAAAATGAAGGTTAGAGGACCAAAGAAAAATCACTCTTGTGTTCTATTTATTATGTGAAATGCTTGGGTACCAAAAGAAATTTGCTATTATG
TTTGTTGAATACTAAAAGGGATGGGGAAATGATTATAGATAGCAAACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFIEKIGEKLHIGGDHKGEHHDAHKGEHKGEHHDEHKKHEEHHGEGAHKEGIMDKIKDKIHGGDHHEEKGEKKKKEKKKKGEHGHKHEGGDSSSDSDSD