; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G40230 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G40230
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationChr3:34464274..34467192
RNA-Seq ExpressionCSPI03G40230
SyntenyCSPI03G40230
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]2.6e-9599.44Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]1.2e-95100Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]3.8e-9493.43Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.9e-10196.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein9.3e-107100Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.3e-9599.44Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.3e-9599.44Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like1.8e-9493.43Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like3.9e-8993.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 65.6e-4063.64Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 23.3e-4052Show/hide
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        L    ++L +Y    I A +  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.4e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 65.6e-4063.64Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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          +L +Y  +   A + S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.2e-5078.23Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.0e-5284.68Show/hide
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        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.5e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.5e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.5e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.5e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAGAAAGGGGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCTAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCG
AAAATGCCTACCAGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCGCCCGAAGAGCCTCAAAAGTTTGCTAATGTTCACAAGATCTTTGGTGCCAGTAATGTCAGCAAACTGTTGA
ATGAAGTCCAGCCGCATCAGCGGGAGGATGCTGTGAACTCGCTCGCTTACGAGGCCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTGTATGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTC
CAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATCCCAGCCCCATCTCCGTCTTCATCGTCGCAATA
TGCTCGAAGGTCGTCATCAACAAGCCACGAGGGAAGCTCGTCTACCTCTAGCTATGGTCATTACTATACTGGCCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATAATGGCC
CTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCACCCATTAGGGTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCACATGTAAACATTATTTAGGGATATCCCATAAATAAAGTTTGTTCCTTTTTTTTTTCTTTCTCTCTCCCTCTCTT
TTTCTATGGCTTCAACTTCATTTTGCTTAAGGTTTCCATACAAGAGATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAGAAAGGGGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTT
CCACCTACTCTAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCAGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCGCCCGAAGAGCCTCAAAAGTTTGCT
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GATGAAAGACCCTGTGTATGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTCATTCGCTATG
CCTGCAGTGAAATCCCAGCCCCATCTCCGTCTTCATCGTCGCAATATGCTCGAAGGTCGTCATCAACAAGCCACGAGGGAAGCTCGTCTACCTCTAGCTATGGTCATTAC
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CTTTATAATTTGAATCATCACAAGGAGGGATAATATCATATGCTGATATGGGTGTGAAAATTCTATGATATTTTGATCATAAATACAATCGATAATTACAAATCATATCT
ATTGTATTCGTCTAGTTTGTGAGCTATATCTCTACAATTTGAAAAATGATTTCAAACATTCTTGTAATATGCAGAATCTATAAATCAGAAATACCCTTTTATTGAATATC
ATGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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