; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G40420 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G40420
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUBA domain-containing protein
Genome locationChr3:34625013..34633104
RNA-Seq ExpressionCSPI03G40420
SyntenyCSPI03G40420
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.7e-14693.13Show/hide
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XP_038904170.1 rhomboid-like protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]2.1e-14996.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein3.3e-156100Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 203.7e-15297.59Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 203.7e-15297.59Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 206.2e-14793.84Show/hide
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A0A6J1EXA3 rhomboid-like protein 205.2e-14692.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.8e-1825.95Show/hide
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        F+ L +  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FFS    P  S+  P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P+ P
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           E SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 25.6e-2026.1Show/hide
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        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   ++W+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L + T S L
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        F++L +   +       N + SG  G +FA FVPF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  + G+++G  Y  ++  + +   
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Query:  FPEFISSFFSRLSLPSAGNPPAAPNRDVRGNMPS-----------FMSRQV------------------------------------ERNYPS---VPTA
         P +++  FS    P   +  A P  ++R  M +            + RQ+                                    + ++PS    P  
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        TE SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 24.4e-1726.24Show/hide
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        G SG   AP++++ ++  +  ++   +     +    Y    VK   ++W+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S   S L
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Query:  FEVLAISLLK----DPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSS---WRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIR
        F+ L I  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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Query:  KAK-FPEFISSFFSRLSLP--SAGNPPAAP---------------------------------NRDVRGNM-------PSFMSRQ------VERNYPSVP
        +    P +++ FFS    P  S+  P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P+ P
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           E SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 185.4e-10869.86Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R+WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
Subjt:  LFEVLAISLLKDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEF

Query:  ISSFFSRLSLPSAGNPPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQLH
        ++S FSR SLPS  +    P R      P+ + RQ  R Y + +P+ TEPSE+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+  H
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 201.2e-12376.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R+WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS T SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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Query:  ISSFFSRLSLPSAGN-PPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQLH
        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R+ ER+ P+ +P++ EPSE+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+Q H
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein3.9e-10969.86Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R+WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSR SLPS  +    P R      P+ + RQ  R Y + +P+ TEPSE+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+  H
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein8.6e-12576.45Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R+WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS T SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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Query:  ISSFFSRLSLPSAGN-PPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQLH
        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R+ ER+ P+ +P++ EPSE+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+Q H
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCCTCCGGTTTTAACAATGCCCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACTATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCT
TGGTTTGTCCTATCAGGATGTAATTGTGAAGCTCCGATTGTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTAT
ATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTGTTCTCTATAACATCCTCCTTACTTTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTT
AAAGATCCTGCAGCAAATCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTTCGTGGAGAAGATCTATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGATTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCATTTTTTTCAAGACTTTCTTTGCCATCTGCGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCA
AATAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATCCTTCTGTGCCAACTGCCACAGAACCATCGGAAGACGCCATTGCTACACT
TGTTTCAATGGGGTTCGACAGAAACTCGGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAGGCCAGAAACGACGTTAACATTGCGACAAACATACTTCTTGAATCACAATTGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAAATAGTAGTTTCCAACCGTAGGGAGGAGGTGGGGGGAAGAGGAAGAGAAAGAGATATCGAATTTCCACTCCAAAATTCCAAACAGACGAAGACGACAAATCAAAATC
AAATAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGCGAAGAAGGCTGTGACCGTCTGAGAGGATCGTTGCTTCCTCTCTGAGACGATGAACGGCGGCCCCTC
CGGTTTTAACAATGCCCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACTATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCTTGGTTTGTCCTATCAGG
ATGTAATTGTGAAGCTCCGATTGTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTATATTACTTCAGAGTATTT
GAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTGTTCTCTATAACATCCTCCTTACTTTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTTAAAGATCCTGCAGCAAA
TCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGGAGTTCGTTTCTCTGACA
AGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTTCGTGGAGAAGATCTATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCTTATATCGATTGAATGTA
TTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCATTTTTTTCAAGACTTTCTTTGCCATCTGCGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCAAATAGAGATGTTAGAGG
AAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATCCTTCTGTGCCAACTGCCACAGAACCATCGGAAGACGCCATTGCTACACTTGTTTCAATGGGGTTCG
ACAGAAACTCGGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAGGCCAGAAACGACGTTAACATTGCGACAAACATACTTCTTGAATCACAATTGCACTAATTTGAAGAATTTTGTGGGGTC
ATATGAAAACTTTTGATGTCCCAAGTGGTCCGAGAAACAACCAAATTTGAGTATCGAGGGTTTTGATGAATTTGCTGACAACCGAGTTTTAATGGTTGGAGGAACTCACC
GAGCTGTTTTTTTCTAAACTCTTTTGGGTTTCCGTTTTGTGTTCCTCTACCGTAGCTCTCAAATTTTATTGATAATTAATGTCTGATTACACAGATTGCTTATAGTTTGT
AAGTCTTACTTCTAAGATCAAAACATCAAGTAGAAATGTTCATGGAACCATAATGTGCAGAATTCTTTTGTTATGTTATAATCTAAATTTTCAGATTCTTACACCATTTT
TATTGGCTCCTAATCTTTGATTATTTAGAAAGCAAACAAATGCAATTTCTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPVTRTFIIASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRLWKLVMSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSITSSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFISSFFSRLSLPSAGNPPAAP
NRDVRGNMPSFMSRQVERNYPSVPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQLH