; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G40780 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G40780
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationChr3:34893287..34898438
RNA-Seq ExpressionCSPI03G40780
SyntenyCSPI03G40780
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]2.6e-16699.36Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.5e-16498.08Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_016903364.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Cucumis melo]4.4e-16197.12Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDT   GLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]1.6e-15088.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISV QSKRFAP+AAL A P  GLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]5.7e-15391.35Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        M IAFKSS   PLNKIP++ IFSPRPCKISV +SKRFAPMA LAA PVVGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN ILKRG+ENF+MIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK+I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase1.3e-16699.36Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase7.0e-16598.08Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase2.1e-16197.12Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDT   GLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase7.0e-16598.08Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFK SRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQ+KRFAPMAALAAYPVVGLSETFK LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKERMK IVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase7.5e-15188.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISV QSKRFAP+AAL A P  GLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain1.1e-7957.2Show/hide
Query:  VVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFT
        +  +S+ F++LR++ + ALIP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R      ++ ++K V PE+  PI LFT
Subjt:  VVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFT

Query:  YYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVK
        YYNPI  RGVE F+  +K  GV+GLVVPD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P ER++ I   S+GF+YLVS  GVTG R+ V+SRV+ LL  ++
Subjt:  YYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVK

Query:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
          T+KP+ VGFGISKPEH  QV  WGAD +I+GSAMVK L E  +PEEGLK +  F + LK AL
Subjt:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain2.5e-11981.37Show/hide
Query:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        VGLSETF  L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL  CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+LFTY
Subjt:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKE
        YNPIL+RGVEN+M +IK+ GV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPKERM  IVEASEGF+YLVSS+GVTGTR SV+ +VQ+LL+++KE
Subjt:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKE

Query:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
         T KPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic3.1e-8556.06Show/hide
Query:  SPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARE
        +P P  +   Q+   A  A   + PV   S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA  
Subjt:  SPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARE

Query:  TNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYL
        T  +A++ ML+ V PELSCP+ L +YY PI+ R +      +K+ GV GL+VPD+P      L  EA  +N+ELVLLTTP  P++RMK I +ASEGFVYL
Subjt:  TNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYL

Query:  VSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        VS  GVTG R +V+ RV++L++EVK+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A+WGADG+IIGSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  VSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain7.9e-8157.14Show/hide
Query:  VVGLSETFKNLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLF
        ++ +S+ F++LR    + ALIP+ITAGDPDL TTA+AL+VL + G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL R T   +++ +++ V P+L  PI LF
Subjt:  VVGLSETFKNLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLF

Query:  TYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEV
        TYYNPIL RGVENF+  I D G RGLVVPD+PLEE ++L + A    IEL LL  PT+PKER+K I   S+GF+YLVS  GVTG R  + +RV+ LL ++
Subjt:  TYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEV

Query:  KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        +EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV +WG+D +I+GSA+VK L E  SP+EGLK +  F ++LK+A++
Subjt:  KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic4.0e-11770.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF PMA+L+ + P +GL++TF  L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP ERMK IV+ASEGF+YLVSSIGVTG R+SVS +VQ+LL+++KE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain2.9e-11870.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF PMA+L+ + P +GL++TF  L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALA-AYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP ERMK IV+ASEGF+YLVSSIGVTG R+SVS +VQ+LL+++KE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.8e-12081.37Show/hide
Query:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        VGLSETF  L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL  CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+LFTY
Subjt:  VGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKE
        YNPIL+RGVEN+M +IK+ GV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPKERM  IVEASEGF+YLVSS+GVTGTR SV+ +VQ+LL+++KE
Subjt:  YNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFVYLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKE

Query:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
         T KPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAAATCTTCGAGGATTCTTCCCCTTAACAAGATACCCAATACCCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTTTCCCAGTCCAAGCGGTT
CGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCCTACCCTGTTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAAAAACTTGAGAGAACAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATCACGGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAGGCATTGAAAGTGCTTTCCAAATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGAGAGACAAACTTCAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTACAACCCAATTCTTAAACGTGGCGTCGAGAACTTCATGATGATAATAAAAGATACAGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAG
TTTTGAGAAAAGAAGCAGTAAAGCACAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGAGAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTACCGGTACTCGGACATCCGTTAGTAGCAGAGTTCAAACTCTTCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTGAAGCAGGTGGCTGAGTGGGGAGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTAGGTGAAGCCCAATCCCCTG
AGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTTTTCTGTAATCCTTCAACCTTTTCAAGTAACCACAATTGCAATCAGCAGATTCAAACAATCTCATTCTTAACTCCAGTTTCTGGTGGATTTTGATATTTTTATACCC
TTCTTCTCCGCATAAATGCTACAATAAGCAACATTTGTTCTGTATATCAAACCAAACAAAAACTGAACCAACAAAATTCTGCCCATCGAAATCATTAAGCCGCCATTTTT
TCGTTTATTGTTCTTGAAAACTTCATACAACAACCCCAACAGGGCTTGTTCTTTTTGGCAACTGTGGCCGTTGTAAACCAAAATAAAACACAGCTCCTAACACTTTTGAA
TTTGAAGAGTTTTTGAATCAGGTTGATTGGGGAGAAGAAACCCTTTTCATCAATCTAAATTTCCAGCAAAACTCTCTTTACCAAATGGACATTGCTTTCAAATCTTCGAG
GATTCTTCCCCTTAACAAGATACCCAATACCCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTTTCCCAGTCCAAGCGGTTCGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCCT
ACCCTGTTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAAAAACTTGAGAGAACAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATCACGGCTGGTGATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAG
GCATTGAAAGTGCTTTCCAAATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTTATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTT
GGCTAGAGAGACAAACTTCAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTACATATTACAACCCAATTCTTAAACGTG
GCGTCGAGAACTTCATGATGATAATAAAAGATACAGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAGTTTTGAGAAAAGAAGCAGTAAAGCAC
AATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGAGAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTTTATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTAC
CGGTACTCGGACATCCGTTAGTAGCAGAGTTCAAACTCTTCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACG
TGAAGCAGGTGGCTGAGTGGGGAGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTAGGTGAAGCCCAATCCCCTGAGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAAC
TTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCTTGATGACATAAACCAAGCTGTGTCTTTAATCTGTAAACAAGTGCTCAAAATGCACTTTCATTCTAAAATTACTCCTCAAA
GATTTTCATTTGCTTTTCTTTTCTTCTTTTCTGAAACAGTGAGTTTACCTTTTATTTTGACAGTGAATAAAGCTATCAGCTCATATTTTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRILPLNKIPNTLIFSPRPCKISVSQSKRFAPMAALAAYPVVGLSETFKNLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSKCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMMIIKDTGVRGLVVPDVPLEETEVLRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKERMKNIVEASEGFV
YLVSSIGVTGTRTSVSSRVQTLLEEVKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAEWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS