; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI03G41160 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI03G41160
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionAnkyrin repeat-containing protein
Genome locationChr3:35221922..35222770
RNA-Seq ExpressionCSPI03G41160
SyntenyCSPI03G41160
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR026961 - PGG domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058460.1 ankyrin repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-7977.36Show/hide
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KAG6581828.1 hypothetical protein SDJN03_21830, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-5448.94Show/hide
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        MV YLLS  EVKT+ +  TN+  S+ T  SL  Q  ++T+  R   S K G       RW+ WR  LKYKGDW QEVQGTMMLVATVIATVTFQAG+NP 
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        GGVWQQDTP+NS++Y   + YY   +S++           +  G I PAGTAIM Y +P +Y  Y   N +SF+AS+ VILLI+ R PLKN++CSWLL L
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        AMC AVV L   +  G  MVN    ND  +A    Y+LA+  L GLV + G+ H++ F +W+V +L   F SK K +  K   P
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XP_004141216.1 uncharacterized protein LOC101203970 [Cucumis sativus]6.8e-15398.94Show/hide
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XP_008447612.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490026 [Cucumis melo]4.2e-5448.76Show/hide
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        MVGYLL   E KT T        +D   + LE QK++ TRN + ++     L    +   RW+ WR  LKY+GDW QEVQGTMMLVATVIATVTFQ G+N
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        PPGGVWQQDTPF  SS  N        +Y+ F     +SY      R     +FPAGT +M + +P   S Y+ VNT+SFLAS+SVIL+IV RFPLKN+I
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        CSWLL L MC+AVV+L  GY  GV MVN     +     NS ++ L + C  G+V +  +W I S  +W+VKTL  +F SK+K
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XP_008464012.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501999 isoform X1 [Cucumis melo]1.1e-10776.49Show/hide
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        GGVWQ DTPFNSS YFNNDP  R FNSSSYF Y PYY P I L     AGTAIMMY +P +Y+ Y  +NTISFLASISVILL+VGRFPLKNKICSWLLAL
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        AM VAV  LG GYF GV MVN YS  NDS S +F  LY L ISCLGLVRV GVWHILSFKLWIVKTLF TF +++KFYC KRTTP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFQ3 ANK_REP_REGION domain-containing protein3.3e-15398.94Show/hide
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A0A1S3BIS1 uncharacterized protein LOC1034900262.0e-5448.76Show/hide
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        MVGYLL   E KT T        +D   + LE QK++ TRN + ++     L    +   RW+ WR  LKY+GDW QEVQGTMMLVATVIATVTFQ G+N
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        PPGGVWQQDTPF  SS  N        +Y+ F     +SY      R     +FPAGT +M + +P   S Y+ VNT+SFLAS+SVIL+IV RFPLKN+I
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        CSWLL L MC+AVV+L  GY  GV MVN     +     NS ++ L + C  G+V +  +W I S  +W+VKTL  +F SK+K
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A0A1S3CM14 uncharacterized protein LOC103501999 isoform X15.5e-10876.49Show/hide
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        GGVWQ DTPFNSS YFNNDP  R FNSSSYF Y PYY P I L     AGTAIMMY +P +Y+ Y  +NTISFLASISVILL+VGRFPLKNKICSWLLAL
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        AM VAV  LG GYF GV MVN YS  NDS S +F  LY L ISCLGLVRV GVWHILSFKLWIVKTLF TF +++KFYC KRTTP
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A0A5D3CAD4 Ankyrin repeat-containing protein1.4e-7977.36Show/hide
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        MVGYLLSALEVKT+TSIITN E SD T+ESLELQ++S TRNP+ +KS KHG K T+K RWRAWR NLKYKG WFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAG+NPP
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        GGVWQ DTPFNSS YFNNDP  R FNSSSYF Y PYY P I L     AGTAIMMY +P +Y+ Y  +NTISFLASISVILL+VGRFPLKNKICSWLLAL
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        AM VAV  LG G
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A0A6J1GV64 uncharacterized protein LOC111457477 isoform X12.5e-5246.48Show/hide
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        M+GYLLS  EVKT+ S  TN+ AS+    SL           R  K ++    +    RW+ WR  LKYKGDW QEV+GTMMLVATVIATVTFQAG+NP 
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        GGVWQQDTP+NS++Y   + YY   +S++           +  G I PAG+AIM Y +P +Y  Y   N +SF+AS+ VILLI+ R PLKN++CSW+L L
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        AMC AVV L   +  G  MVN    ND  +A    Y+LA+  L GLV + G+ H++ F +W+V  L   F S  K +  K   P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24600.3 Ankyrin repeat family protein1.9e-0431.58Show/hide
Query:  LELQKLSNTRNPRGKKSRKHGLKNTSKLRWRAWRMNLKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPF
        L+L ++S +     KKS+KH +K   K       +  +   +  Q  + T+ +VA +IA+V++  G+NPPGGV+ QD P+   S   N   ++ F
Subjt:  LELQKLSNTRNPRGKKSRKHGLKNTSKLRWRAWRMNLKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPF

AT2G24600.4 Ankyrin repeat family protein1.9e-0431.58Show/hide
Query:  LELQKLSNTRNPRGKKSRKHGLKNTSKLRWRAWRMNLKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPF
        L+L ++S +     KKS+KH +K   K       +  +   +  Q  + T+ +VA +IA+V++  G+NPPGGV+ QD P+   S   N   ++ F
Subjt:  LELQKLSNTRNPRGKKSRKHGLKNTSKLRWRAWRMNLKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPF

AT3G13950.1 unknown protein1.2e-1432.69Show/hide
Query:  LKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPYRYSYYM
        LK +GDW ++ +G +M+ ATVIA ++FQ  +NPPGGVWQ D     +  F N     PF                       AGTA++ Y    R +Y  
Subjt:  LKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPYRYSYYM

Query:  QV--NTISFLASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLALAMCVAVVTLGNGYFSGVAMV
         +  +T+SF  S+S+ILL++    L+N++   +L   M VAV+ +   +F  + +V
Subjt:  QV--NTISFLASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLALAMCVAVVTLGNGYFSGVAMV

AT4G13266.1 unknown protein4.0e-1024.51Show/hide
Query:  AWRMN-LKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPY
        AW +  L ++GDW ++ +G +++ ATVIA ++F   +NPPGGVWQ +   +                         ++ R   G +   GT+I+ +    
Subjt:  AWRMN-LKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPY

Query:  RYSYYMQV--NTISFLASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLALAMCVAVVTLGNGYFSGVAMVNYSGKNDSLSAFNSLY-----FLAISCLGLVRVTGVWH
        R  Y   V  N +SF AS+ +I L++  F  +N++   ++ + M VAV+ +   +F    +V +  ++D +     +Y      L +  + +  V  +W 
Subjt:  RYSYYMQV--NTISFLASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLALAMCVAVVTLGNGYFSGVAMVNYSGKNDSLSAFNSLY-----FLAISCLGLVRVTGVWH

Query:  ILSF
        ++ F
Subjt:  ILSF

AT5G51160.1 Ankyrin repeat family protein1.7e-0527.78Show/hide
Query:  EVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDT-PFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPYRYSYYMQVNTISFL
        E +  +++VA+++AT TFQA L PPGG WQ  + P  S +  N        N+++  ++               AG +IM  F    ++ ++  NTI F 
Subjt:  EVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDT-PFNSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPYRYSYYMQVNTISFL

Query:  ASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLAL
         S+S++ ++   FPL+ ++   ++A+
Subjt:  ASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGGATATTTACTTTCGGCTCTAGAAGTAAAAACTGAAACAAGCATCATTACAAACTTGGAAGCATCTGATGACACACATGAAAGTTTAGAACTCCAAAAGCTATC
AAACACAAGAAATCCCAGAGGAAAAAAATCACGAAAACATGGATTGAAAAATACGTCTAAGCTGCGATGGAGGGCATGGAGAATGAATTTGAAGTATAAAGGGGATTGGT
TTCAAGAAGTGCAAGGCACAATGATGCTTGTGGCTACGGTCATTGCGACCGTCACTTTTCAAGCCGGACTGAACCCTCCTGGTGGCGTTTGGCAACAAGACACACCATTT
AACTCTTCCAGCTACTTCAATAATGATCCATATTATAGACCATTTAATTCTTCCAGCTACTTCAGTTATTATCCATATTATAGACCGAGAATACCATTAGGTAATATTTT
TCCAGCTGGAACTGCAATCATGATGTATTTCAAACCCTACAGATATTCGTATTACATGCAGGTGAACACAATCTCGTTTTTGGCATCCATAAGTGTGATTTTATTGATCG
TTGGCCGGTTTCCTTTGAAAAATAAGATCTGTAGCTGGTTGTTGGCATTGGCCATGTGTGTTGCAGTGGTGACCTTAGGAAATGGGTATTTTTCTGGAGTTGCAATGGTT
AACTACAGTGGCAAGAATGATTCTTTAAGTGCATTCAATTCACTTTATTTTCTAGCTATCTCCTGCCTTGGGTTAGTTAGAGTGACTGGCGTATGGCACATCCTTTCCTT
TAAGTTATGGATTGTCAAGACCTTATTCAGCACTTTCATCTCTAAGCTTAAATTCTACTGCTCCAAACGCACCACACCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGGGATATTTACTTTCGGCTCTAGAAGTAAAAACTGAAACAAGCATCATTACAAACTTGGAAGCATCTGATGACACACATGAAAGTTTAGAACTCCAAAAGCTATC
AAACACAAGAAATCCCAGAGGAAAAAAATCACGAAAACATGGATTGAAAAATACGTCTAAGCTGCGATGGAGGGCATGGAGAATGAATTTGAAGTATAAAGGGGATTGGT
TTCAAGAAGTGCAAGGCACAATGATGCTTGTGGCTACGGTCATTGCGACCGTCACTTTTCAAGCCGGACTGAACCCTCCTGGTGGCGTTTGGCAACAAGACACACCATTT
AACTCTTCCAGCTACTTCAATAATGATCCATATTATAGACCATTTAATTCTTCCAGCTACTTCAGTTATTATCCATATTATAGACCGAGAATACCATTAGGTAATATTTT
TCCAGCTGGAACTGCAATCATGATGTATTTCAAACCCTACAGATATTCGTATTACATGCAGGTGAACACAATCTCGTTTTTGGCATCCATAAGTGTGATTTTATTGATCG
TTGGCCGGTTTCCTTTGAAAAATAAGATCTGTAGCTGGTTGTTGGCATTGGCCATGTGTGTTGCAGTGGTGACCTTAGGAAATGGGTATTTTTCTGGAGTTGCAATGGTT
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TAAGTTATGGATTGTCAAGACCTTATTCAGCACTTTCATCTCTAAGCTTAAATTCTACTGCTCCAAACGCACCACACCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVGYLLSALEVKTETSIITNLEASDDTHESLELQKLSNTRNPRGKKSRKHGLKNTSKLRWRAWRMNLKYKGDWFQEVQGTMMLVATVIATVTFQAGLNPPGGVWQQDTPF
NSSSYFNNDPYYRPFNSSSYFSYYPYYRPRIPLGNIFPAGTAIMMYFKPYRYSYYMQVNTISFLASISVILLIVGRFPLKNKICSWLLALAMCVAVVTLGNGYFSGVAMV
NYSGKNDSLSAFNSLYFLAISCLGLVRVTGVWHILSFKLWIVKTLFSTFISKLKFYCSKRTTP