; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G00690 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G00690
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationChr4:354774..355215
RNA-Seq ExpressionCSPI04G00690
SyntenyCSPI04G00690
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-5190.16Show/hide
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KGN52797.1 hypothetical protein Csa_014956 [Cucumis sativus]4.2e-59100Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]1.4e-4986.99Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]5.2e-4986.18Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-4885.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein2.0e-59100Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 337.0e-5290.16Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 16.6e-5086.99Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 12.5e-4986.18Show/hide
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B9T0V9 RALFL33, putative9.2e-2858.93Show/hide
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        SI +FT    +SS   S      + D  LNW+   +RC G ++++CM   EF+MDSEINRRILAT++YISY +L+ N IPCS+RG+SYYNCQPGAEANPY
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 338.3e-2653.66Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor6.6e-2350Show/hide
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        P  L + +   AFF+S +++           + +W+    +   C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 238.6e-2349.6Show/hide
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        IF I   ++  + S+ V++ S++ + ++   E  C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR N IPCSRRG+
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        SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 221.8e-2064Show/hide
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        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 17.1e-2572Show/hide
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        CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 15.0e-2672Show/hide
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        CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ I RCRS
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AT2G33775.1 ralf-like 191.6e-1644.68Show/hide
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        L +  ++   +  W  T++  +G+        +++ MDSE NRR LA   SYISY +LR NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 221.3e-2164Show/hide
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        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 236.1e-2449.6Show/hide
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        IF I   ++  + S+ V++ S++ + ++   E  C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR N IPCSRRG+
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        SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 335.9e-2753.66Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAGCTCCTCTTCTCCACCTGCCTTATCTATTCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCGTCGTCGTCCTCCTCCTTAGTAGTCACGACCATGAGCAGCGATCG
GAGTCTCAATTGGCTCTCGACGGAAGCACGATGCCATGGACGTTCAATAAGCGAATGCATGATGCACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAG
CCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCAAACAACATTCCATGCTCTCGAAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCATAT
CAGCGGGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATCTCTTTCCCTTGGTAGACGTAGAATTCACTAAAGTAATAAGAAAGAAGTGAAGGCAAACCATGGGCAGCTCCTCTTCTCCACCTGCCTTATCTATTCTCATTTTCAC
CATAGCCTTCTTCGTCTCGTCGTCGTCCTCCTCCTTAGTAGTCACGACCATGAGCAGCGATCGGAGTCTCAATTGGCTCTCGACGGAAGCACGATGCCATGGACGTTCAA
TAAGCGAATGCATGATGCACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCAAACAACATT
CCATGCTCTCGAAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCATATCAGCGGGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAAGAAAAACT
CT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSSSPPALSILIFTIAFFVSSSSSSLVVTTMSSDRSLNWLSTEARCHGRSISECMMHIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLRANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPY
QRGCTAITRCRS