; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G01510 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G01510
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionDCC family protein At1g52590, chloroplastic
Genome locationChr4:836758..838668
RNA-Seq ExpressionCSPI04G01510
SyntenyCSPI04G01510
Gene Ontology termsGO:0015035 - protein disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007263 - DCC1-like thiol-disulfide oxidoreductase family


Homology Show/hide homology
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KAA0044436.1 DCC family protein [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-8993.09Show/hide
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XP_022153577.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Momordica charantia]6.1e-7883.89Show/hide
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XP_038900615.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Benincasa hispida]1.8e-8292Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVF0 Uncharacterized protein4.8e-97100Show/hide
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A0A1S3BZD9 DCC family protein At1g52590, chloroplastic2.5e-9397.3Show/hide
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A0A5A7TQQ0 DCC family protein3.7e-8993.09Show/hide
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A0A5D3E0H0 DCC family protein2.5e-9397.3Show/hide
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A0A6J1DJB0 DCC family protein At1g52590, chloroplastic3.0e-7883.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P40761 Uncharacterized protein YuxK5.1e-1942.24Show/hide
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Q9SSR1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic1.3e-5971.81Show/hide
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        +++++   TI+ +++DWV+ TS+FFE+D RPIMLFDGVCNLCNGGV+FVR +DRNR IR EALQS+AGKKLL RSGRAPDDISSVVLVE DRSYIKSEAV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24095.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC1.9e-1638.14Show/hide
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        YD +A NRY  FG++E C
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AT1G52590.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC9.4e-6171.81Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCCGCCTCTTTATCTCCGACAATCAAGGACGAAACGATAGATTGGGTCGAAGCAACTTCCAACTTCTTCGAGAAAGATACGAGACCGATTATGCTATTTGACGGTGTTT
GCAATTTGTGCAATGGAGGTGTGAGATTTGTTCGAGCTAATGATAGAAACAGAAGAATACGATTGGAGGCTCTCCAAAGTGACGCTGGCAAGAAGCTGTTAAGAAGGTCA
GGGAGAGCACCGGATGATATTTCAAGTGTTGTACTTGTTGAGAAGGACAGATCTTATATCAAATCTGAAGCTGTTCTAAGAATAATGGAATATTTGGAGTTACCCTTTCC
TCAGCTTGCACTTTTTCTCCAGTTTGTGCCTCTGTTTGTTCGAAATATTGTCTATGACAATATTGCAGATAATCGATATACATTATTTGGACGCTCGGAGTCATGTGAAA
TATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAATCACGATAATACCCTCCAAAGATTTTCCTTCAAATTGGTGGAGGAGAAGCCACCATGCAACTGCCACTGCCACCGTCTCCAATGGCGCTTCCACTTTCCGGGAG
ATTTCCGGCTCCTTTTCTTCCGCCGTCTATGAGGAAAGCTGGACTACTGCATCCAATTGCTTCCGCCTCTTTATCTCCGACAATCAAGGACGAAACGATAGATTGGGTCG
AAGCAACTTCCAACTTCTTCGAGAAAGATACGAGACCGATTATGCTATTTGACGGTGTTTGCAATTTGTGCAATGGAGGTGTGAGATTTGTTCGAGCTAATGATAGAAAC
AGAAGAATACGATTGGAGGCTCTCCAAAGTGACGCTGGCAAGAAGCTGTTAAGAAGGTCAGGGAGAGCACCGGATGATATTTCAAGTGTTGTACTTGTTGAGAAGGACAG
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TAAGGATTCTCGATGTTTGCTTAGTCAGTTCCTTCATTGACCCAACATTTATATAACATATCGTTTCAGCGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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