; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G03530 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G03530
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr4:2163728..2169871
RNA-Seq ExpressionCSPI04G03530
SyntenyCSPI04G03530
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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Query:  DVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLEDTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
         VAR+KGMGKKNNLLGLLDSPVL DTMAL D+SSE+SKNGVW GERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
Subjt:  DVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLEDTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC

Query:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
        R SGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLI INGEDGPNF+AGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
Subjt:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL

Query:  LKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLTLGLKKVLKVEQRESLMNMFIGICGKDSHSTAAEALGL
        LKICHIIQIFPPE+SSPEMEMLTLGLKK LKVEQRESLMNMFIG+CGKDSHSTAAEALGL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G43235.1 unknown protein1.0e-8243.96Show/hide
Query:  FSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSS----SDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFLSSGLDAFDDLRTLI
        FS+P  R         +PR R  RK++ +    T  +    S+SS     D +L   +++ +++  A+  F           + FL S  DAF DL+TLI
Subjt:  FSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSS----SDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFLSSGLDAFDDLRTLI

Query:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKVLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSDVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLE
        + DD NR + VSC++ST++FVG +V+L FV  F ++VLV + S L   F S     V+RRDRSLGG+EVVV     D  R+     K+ +         +
Subjt:  AFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKVLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSDVARNKGMGKKNNLLGLLDSPVLE

Query:  DTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASV
             N     +    +     LPKWWP ++  ++    ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+QLR +CRISGV+V+F  +N  DSFYR S+
Subjt:  DTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASV

Query:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT
        DFVLN  SR P     + I  ED   FIAGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS+FLQAWAL +Q +HSE+ AEL KIC I +IFPP + S EMEM+ 
Subjt:  DFVLNIYSRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLT

Query:  LGLKKVLKVEQRESLMNMFIGI-CGKDSHSTAAEALGLV
         GL+K++K+E+R+SL+  F+G+ C +DS  +AAEALGLV
Subjt:  LGLKKVLKVEQRESLMNMFIGI-CGKDSHSTAAEALGLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACACCACAGCAACCACACTCTGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCACTTCCCGTCGCCATAACCTCCATTTCAACCGCCGCTTCTCCTCGCCGGACTCCCGACCACT
CTTCACCCCTGTCTCCTGCTTCAAACCACGTCGTCGTACTCGCCGGAAAAACAGCCTCACCAAACTCCGCACCACCACCCACCATCCCTTCGACTCCTCATCCTCTTCCT
CTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCTCCCACCTTCGCCAGTTTCTG
TCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAAAATCGAACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGCCA
ATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGGTTTTAGTTGGGATTGTATCTCGTTTGGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTAATGAGAA
GGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGATGTAGCGCGAAATAAAGGTATGGGGAAGAAGAATAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGT
CCCGTGTTAGAGGACACAATGGCTCTGAATGATGTTTCAAGTGAAATTTCGAAGAACGGGGTTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCCCG
ACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGACGATATTG
TTCAATTGCGTGAAATATGCAGGATATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTAT
AGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTTTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTATTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTCCGTGCTGCCAG
GATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCAGAGTTGTTGAAGATCT
GTCACATTATACAGATATTCCCTCCTGAGAAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAAGTCTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAAT
ATGTTTATTGGTATTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGTGCTTCCTACAAATATGGGGAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATAACAAAATTGTATTAAGCTTCCAATAACAAAACCCTAACCAATCGGAGCTCGGGCCTTAGTGAGCAATAGTCGGCAGACTGAAAGTGAGCTCCGGCGACGGCGGA
AGAAGAGGCGCCAAATCGGAGCGCAGAATTTTACCTAACGTCAAAGCTTTATTGTATTGTATATATCATCATTCCACCATTTTAGGTGTGGAAAAACGGAGCTTCCAATT
CTTTTGCTCTACATGGGCTAATGGACACCACAGCAACCACACTCTGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCACTTCCCGTCGCCATAACCTCCATTTCAACCGCCGCTTCTCC
TCGCCGGACTCCCGACCACTCTTCACCCCTGTCTCCTGCTTCAAACCACGTCGTCGTACTCGCCGGAAAAACAGCCTCACCAAACTCCGCACCACCACCCACCATCCCTT
CGACTCCTCATCCTCTTCCTCTGATTCGAACCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCT
CCCACCTTCGCCAGTTTCTGTCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAAAATCGAACGCTGACCGTCTCTTGTCGTCGTTCC
ACTGTGGAATTCGTTGGCCAATTGGTGCTGTTGAGCTTTGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGGTTTTAGTTGGGATTGTATCTCGTTTGGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTA
TACGGCCCCTGTAATGAGAAGGGACCGGAGCCTTGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGATGTAGCGCGAAATAAAGGTATGGGGAAGAAGAATAATC
TTTTAGGGTTATTGGACAGTCCCGTGTTAGAGGACACAATGGCTCTGAATGATGTTTCAAGTGAAATTTCGAAGAACGGGGTTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGG
TGGCCTCCGGCAGTTCCCCGACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGA
TTTCATGGAGGACGATATTGTTCAATTGCGTGAAATATGCAGGATATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTTTATCGAGCATCTGTGG
ACTTTGTTTTAAATATCTATAGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTTTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTATTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATT
GAGAATGTCCGTGCTGCCAGGATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAA
TGCAGAGTTGTTGAAGATCTGTCACATTATACAGATATTCCCTCCTGAGAAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAAGTCTTGAAGGTAGAAC
AGAGAGAATCATTAATGAATATGTTTATTGGTATTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGTGCTTCCTACAAATATGGGGAATTGATAT
CATCAAAGCTTCGGTCCTGAAGATGTCCATATGCTTTTTAAGTAGGCTTCTAACTCCTGAAATTTTCTTCTAAGAGCCCAATCTTATAAATCTTAACTTTGTATAAAGTA
TTGTGATCAAGTTTAGCGTTAATTCATTGATTGGCTCATTCATCCGATTATTAATTAATGTGTAATTTGATTCTTTGAATAAAAGAATTATGAAATTAGATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDTTATTLCLFLPYPFTSRRHNLHFNRRFSSPDSRPLFTPVSCFKPRRRTRRKNSLTKLRTTTHHPFDSSSSSSDSNLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFL
SSGLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVKVLVGIVSRLGNKFSSGYTAPVMRRDRSLGGREVVVGTRRSDVARNKGMGKKNNLLGLLDS
PVLEDTMALNDVSSEISKNGVWGGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIY
SRTPIYPHLIFINGEDGPNFIAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELLKICHIIQIFPPEKSSPEMEMLTLGLKKVLKVEQRESLMN
MFIGICGKDSHSTAAEALGLVLPTNMGN