; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G03890 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G03890
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr4:2434912..2435790
RNA-Seq ExpressionCSPI04G03890
SyntenyCSPI04G03890
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044640.1 hypothetical protein E6C27_scaffold46G003950 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-2781.4Show/hide
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KGN53137.1 hypothetical protein Csa_015300 [Cucumis sativus]8.3e-3897.65Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXJ2 Uncharacterized protein4.0e-3897.65Show/hide
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A0A5D3D0C9 Uncharacterized protein4.9e-2881.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCAATTATTTGGAAACTCTTCTTGATCATCACACTCATCTTAGCTTCAAATTATGTTCATGCAAGGAGATCTCCTTCCTTCTATATTCATCGTATGGAGAATGC
TGAGCTAAATGTTGACACAATTGCTCAACCACCTAATACTCAAAATGATGAAGATGGTATGAAGAACAATACAGAAACAAACAATACAACTACTGCTGCTCCACCACCAG
CCAAAAATGAAGATGGTGTGTGGGATGGGAACTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GATCATCACACTCATCTTAGCTTCAAATTATGTTCATGCAAGGAGATCTCCTTCCTTCTATATTCATCGTATGGAGAATGCTGAGCTAAATGTTGACACAATTGCTCAAC
CACCTAATACTCAAAATGATGAAGATGGTATGAAGAACAATACAGAAACAAACAATACAACTACTGCTGCTCCACCACCAGCCAAAAATGAAGATGGTGTGTGGGATGGG
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GAAAGGAAAAAAAAAACTTAAGGATATGGAGTATTTGCTTCATATATGGTAAAAAGCATTATCTACAAATGATCACTAGTTTGCCGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASIIWKLFLIITLILASNYVHARRSPSFYIHRMENAELNVDTIAQPPNTQNDEDGMKNNTETNNTTTAAPPPAKNEDGVWDGNF