; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G05110 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G05110
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein ATHB-40
Genome locationChr4:3442607..3444683
RNA-Seq ExpressionCSPI04G05110
SyntenyCSPI04G05110
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.3e-8278.73Show/hide
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XP_038877287.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Benincasa hispida]1.8e-9286.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWL3 Homeobox domain-containing protein5.2e-11499.54Show/hide
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-406.4e-10494.06Show/hide
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A0A6J1C5L6 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like7.3e-7676.65Show/hide
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A0A6J1FTB2 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like7.6e-8177.83Show/hide
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A0A6J1J034 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.3e-8077.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YN17 Homeobox-leucine zipper protein HOX141.2e-2746.33Show/hide
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-402.1e-4353.55Show/hide
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        I   EW + Y+
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Q7XI85 Homeobox-leucine zipper protein HOX141.1e-2845.08Show/hide
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        +PR RR++ RG+      GG         KKR+L+  QV +LE +F  E KLE+ RK  LASELGLDP+QVAVWFQNRRAR K+K LEEE+S LK  H++
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         ++ KC LE E+L+LKE+L+  E+E  R+R               MG GG G   + SPS S S       QP S G    L ++D+  Y+PE
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-531.1e-3348.22Show/hide
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-214.8e-4054.84Show/hide
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        DPRQVAVWFQNRRARWKNK++E+EY+ LK  +E+ VVEKCRL++E++ LKEQL E E+E +  R+ +  +G LS+S  S S+++EA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18550.1 homeobox protein 213.4e-4154.84Show/hide
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AT2G22430.1 homeobox protein 63.1e-1844.12Show/hide
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        KKR+L+  QV+ LE NF  E+KLE ERK +LA ELGL PRQVAVWFQNRRARWK K+LE++Y  LK  ++S+    +  R + E L     L E+ K K 
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        ++  G GG+     ++ + +   +    E+ +SL E
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AT3G01470.1 homeobox 11.1e-1840.27Show/hide
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        KKR+LT  QV LLE +F +E+KLE ERK +LA +LGL PRQVAVWFQNRRARWK K+LE +Y  LK         ++S+V++  +L +E+  L E+L   
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         + K+       G  P  +      ++  A+  E  +S G +     +D
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AT4G36740.1 homeobox protein 401.5e-4453.55Show/hide
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        ISQLY  +Y Q+    V  GE K P+RRRKK +GS   A  G    +KRKLT  QV +LE +FG EHKLESERKDRLA+ELGLDPRQVAVWFQNRRARWK
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Query:  NKKLEEEYSNLKKLHESVVVEKCRLETELLKLKEQLLEVEKEKERVRMGEGGDGPLSSSSPSPSMSMEAMDME--QPISLGEISPLYEEDVFYYMPENYC
        NK+LEEEY+ LK  H++VVV+KCRLE+E+++LKEQL + E+E +  R+ E  +G  S+S  S S+S+EA +        +G+    Y+  +FY +PEN  
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        I   EW + Y+
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AT5G66700.1 homeobox 538.1e-3548.22Show/hide
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