; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CSPI04G06510 (gene) of Cucumber (PI 183967) v1 genome

Gene IDCSPI04G06510
OrganismCucumis sativus L. var. sativus cv. PI 183967 (Cucumber (PI 183967) v1)
DescriptionF-box domain-containing protein
Genome locationChr4:4515692..4519937
RNA-Seq ExpressionCSPI04G06510
SyntenyCSPI04G06510
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK16544.1 uncharacterized protein E5676_scaffold21G003600 [Cucumis melo var. makuwa]9.2e-7092.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUY4 Uncharacterized protein9.9e-78100Show/hide
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A0A1S3BSL8 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X22.4e-7192.99Show/hide
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A0A1S3BSP7 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X18.2e-7292.45Show/hide
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A0A5D3D003 Uncharacterized protein4.5e-7092.31Show/hide
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A0A6J1FN06 uncharacterized protein LOC1114472961.1e-5779.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G42070.1 unknown protein1.5e-3050.31Show/hide
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        M  S+ S+  P    F + SH+SR     P+ SS  S F  + SS      ++     SSSP  +      D +D +F GC+ACGKEE E GCNG+GR+Q
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        GGIATVPGFGWWPIKAYRPCP FV +GGRY+R GQSMDEV  G G + +S SV   DS  + T
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAACTTCTCTTCTCTCAGTTCCTGCCCCATTCTTCCACTCCTCCCATCGTTCCCGATTCACCACTTCATTCCCATTTTCATCATCTAGACCCAGCCCCTTCCTCTC
TTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCATCTTCGGTTGTTGATGAAGAACTCAATTCTTCTTCCCCAGATCAACTCTCTCTTCAATCTGAATCTGACCCAGATGATTCTTCCT
TCAGAGGATGTAAGGCTTGTGGAAAGGAAGAAATTGAGAGGGGATGCAATGGTGAGGGAAGGATGCAAGGTGGAATTGCAACAGTCCCTGGTTTTGGTTGGTGGCCTATA
AAGGCATACAGGCCTTGTCCTGGATTTGTAGCATCAGGTGGCAGATACAAGCGGCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTACATCTGGAGGAGGGAGGACCGATGCCTCTGC
TAGTGTTGGTAGAAAGGACTCGTCGAGGAAATGGACCTATGCAGAGAACTAA
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AACAGTTGTTTACGGTTTCGTTTCTGCCACAGCTTCTCTCTCAAAGACAACCAATTAGAAAATCAGAAATTTGAAGTTTTGTAAACAAAAATCACAAATTCTTTGAGCCG
CTCATTAGGCCGGAATCAAATATCTTGTTGCTCTGTGTGCCGCTCCTCTTCCACTGTCCACCACGCACCCACAAAATGGGAACTTCTCTTCTCTCAGTTCCTGCCCCATT
CTTCCACTCCTCCCATCGTTCCCGATTCACCACTTCATTCCCATTTTCATCATCTAGACCCAGCCCCTTCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCATCTTCGGTTG
TTGATGAAGAACTCAATTCTTCTTCCCCAGATCAACTCTCTCTTCAATCTGAATCTGACCCAGATGATTCTTCCTTCAGAGGATGTAAGGCTTGTGGAAAGGAAGAAATT
GAGAGGGGATGCAATGGTGAGGGAAGGATGCAAGGTGGAATTGCAACAGTCCCTGGTTTTGGTTGGTGGCCTATAAAGGCATACAGGCCTTGTCCTGGATTTGTAGCATC
AGGTGGCAGATACAAGCGGCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTACATCTGGAGGAGGGAGGACCGATGCCTCTGCTAGTGTTGGTAGAAAGGACTCGTCGAGGAAATGGA
CCTATGCAGAGAACTAATTTGGAGCAATGGTGTGCAGTCCTTTAGAATTGAAGAGATTGACAGGATTTATGCCTTTCTTGTTGGTCTTAAGTTTGATGTAGTTCGCAGGC
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TTAGCTGCTTTTAGTGCGAGGTCCTCTACTAGTGGCAGTGACAAGAACAATGGAAATTCAATTTCTATCTTTTAGCAATGCAAGAAACAATAGCCTACCCAGGTGCAATG
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ATCCACACATGGAAACCAAACCAATCTCAGTCCCACTACTCTAGGCACCATTGTCCAATCAGAACTTGAGCTCGAAGAGGATGATTGAGACTGCCGAGCATAGTAGGGGA
CTCTACCTTCTTGATGATGGCGCCTCTTCTAGTAGCACTTCTAGGACTAGTCTTTTGTCTTCCTATTTTACTACTTTTGAACAAGATTGTATGTTATGGCATTTTCATTT
AGGCCACCCTAATTTTCAATATATGAAACATTTATTTTCTCATCTTTTCTTTAAACTTGATGTGTCTACCTTATCTTGTGATGTATGTATTCGGACTAAACAACGTTGGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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