| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KGN53521.2 hypothetical protein Csa_014615 [Cucumis sativus] | 1.5e-167 | 99.67 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Query: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASF+DVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Subjt: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Query: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Subjt: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Query: THIIVD
THIIVD
Subjt: THIIVD
|
|
| XP_008451834.1 PREDICTED: DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X2 [Cucumis melo] | 1.4e-149 | 91.56 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
M KKKQKKG QKPK K NV GSAITQ LQRFCLT+DEVFTFEADLSKRERA VH+VCRKMGM SKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMET+KFSEKTKTVLD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
Query: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
DLFSMYPPDDGELGKETVGNH+ KADK RR+KDDIFWRPS TKEEL KK+GSYT+K+VANMKKIS ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLI GETGCGK
Subjt: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
Query: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKS KNV S
Subjt: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
Query: DLTHIIVD
DLTHIIVD
Subjt: DLTHIIVD
|
|
| XP_008451837.1 PREDICTED: DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X5 [Cucumis melo] | 1.4e-149 | 91.56 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
M KKKQKKG QKPK K NV GSAITQ LQRFCLT+DEVFTFEADLSKRERA VH+VCRKMGM SKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMET+KFSEKTKTVLD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
Query: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
DLFSMYPPDDGELGKETVGNH+ KADK RR+KDDIFWRPS TKEEL KK+GSYT+K+VANMKKIS ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLI GETGCGK
Subjt: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
Query: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKS KNV S
Subjt: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
Query: DLTHIIVD
DLTHIIVD
Subjt: DLTHIIVD
|
|
| XP_031740756.1 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.5e-167 | 99.67 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Query: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASF+DVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Subjt: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Query: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Subjt: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Query: THIIVD
THIIVD
Subjt: THIIVD
|
|
| XP_031740757.1 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.5e-167 | 99.67 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Query: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASF+DVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Subjt: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Query: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Subjt: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Query: THIIVD
THIIVD
Subjt: THIIVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L085 Uncharacterized protein | 7.3e-168 | 99.67 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Query: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASF+DVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Subjt: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTT
Query: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Subjt: QVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDL
Query: THIIVD
THIIVD
Subjt: THIIVD
|
|
| A0A1S3BRU6 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X2 | 6.9e-150 | 91.56 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
M KKKQKKG QKPK K NV GSAITQ LQRFCLT+DEVFTFEADLSKRERA VH+VCRKMGM SKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMET+KFSEKTKTVLD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
Query: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
DLFSMYPPDDGELGKETVGNH+ KADK RR+KDDIFWRPS TKEEL KK+GSYT+K+VANMKKIS ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLI GETGCGK
Subjt: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
Query: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKS KNV S
Subjt: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
Query: DLTHIIVD
DLTHIIVD
Subjt: DLTHIIVD
|
|
| A0A1S3BT79 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X5 | 6.9e-150 | 91.56 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
M KKKQKKG QKPK K NV GSAITQ LQRFCLT+DEVFTFEADLSKRERA VH+VCRKMGM SKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMET+KFSEKTKTVLD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
Query: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
DLFSMYPPDDGELGKETVGNH+ KADK RR+KDDIFWRPS TKEEL KK+GSYT+K+VANMKKIS ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLI GETGCGK
Subjt: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
Query: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKS KNV S
Subjt: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
Query: DLTHIIVD
DLTHIIVD
Subjt: DLTHIIVD
|
|
| A0A1S3BTJ2 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X1 | 6.9e-150 | 91.56 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
M KKKQKKG QKPK K NV GSAITQ LQRFCLT+DEVFTFEADLSKRERA VH+VCRKMGM SKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMET+KFSEKTKTVLD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNV-GSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLD
Query: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
DLFSMYPPDDGELGKETVGNH+ KADK RR+KDDIFWRPS TKEEL KK+GSYT+K+VANMKKIS ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLI GETGCGK
Subjt: DLFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGK
Query: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKS KNV S
Subjt: TTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVS
Query: DLTHIIVD
DLTHIIVD
Subjt: DLTHIIVD
|
|
| A0A6J1INX6 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 isoform X1 | 3.5e-138 | 84.14 | Show/hide |
Query: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
M KKKQKKG QKPK K ++ S I QAL+RFCL++DEVFTFEADLSKRERALVHE CRKMG+TSKS G GDQRRVS+YKSK Q +T+KFSEKTK+VLDD
Subjt: MTKKKQKKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKSKLQMETVKFSEKTKTVLDD
Query: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCG
LFS YPPDDGELGKET+G KKA K RRKDDIFWRPSM KEE+ KKV SYT +K++ANMKKIS +RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCG
Subjt: LFSMYPPDDGELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKIS-ERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCG
Query: KTTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVV
KTTQVPQFLLDYMWGKGE CKI+CTQPRRISA SVSERISYERGENVGSD+GYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTM+AS KSRKNVV
Subjt: KTTQVPQFLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVV
Query: SDLTHIIVD
SDLTHIIVD
Subjt: SDLTHIIVD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B2RR83 3'-5' RNA helicase YTHDC2 | 1.4e-35 | 33.11 | Show/hide |
Query: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
+++ V A+ AL+RF F + L+ ERA +H + + +G+ SKS G G R ++V K + M T + TK + L +P
Subjt: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
Query: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE----RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
V N + P+ + ++F E++K G + V + SE R LP+ Q+ I ++ ++VVLI GETG GKTTQ+PQ
Subjt: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE----RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
Query: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
FLLD + G C+I CTQPRR++A++V+ER++ ER E +G IGY+IRLES+ + + CTNG+LLR L+ + + +S +TH+I
Subjt: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
Query: VD
VD
Subjt: VD
|
|
| F4IDQ6 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH2 | 1.3e-65 | 43.73 | Show/hide |
Query: KKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK--------------------------
KK +L G+ T+ L+ F + ++ + FE L+ ER ++H++CR MG+ SKS+G G++RR+S++K
Subjt: KKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK--------------------------
Query: ----SKLQMET--------------------VKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDGE-----LGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGS
SK + ET V F + K VL DLF+ YPP DG+ LG T GN + KDD F +P MTK ++ V S
Subjt: ----SKLQMET--------------------VKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDGE-----LGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGS
Query: YT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLLDYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSD
+ LK + ++I E RSKLPIASF+D I S VES+QVVLI+GETGCGKTTQVPQ+LLD+MW K E CKI+CTQPRRISA+SVS+RIS+ERGE +G
Subjt: YT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLLDYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSD
Query: IGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
+GYK+RL+S+GGR SS+V CTNGILLRVLI +G+ + V D+THIIVD
Subjt: IGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| F4INY4 DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH6 | 8.3e-76 | 52 | Show/hide |
Query: TQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKS---------------KLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
T+ ++ F + +EV+TFE +LS ER ++H++CRKMG+ SKSSG G+QRR+S++KS K +++ V F +L +LF+ YPP DG
Subjt: TQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKS---------------KLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
Query: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL
+ + + K + KDD F +P ++ EE+ +KV S + LK +K+I++ RSKLPI SF+D ITS VES+QV+LISGETGCGKTTQVPQ+LL
Subjt: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL
Query: DYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
D+MW K ETCKIVCTQPRRISA+SVSERIS ERGE++G +IGYK+RL+SKGGRHSS+V CTNGILLRVL+ +G + VSD+THIIVD
Subjt: DYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| Q5R746 3'-5' RNA helicase YTHDC2 | 1.9e-35 | 32.78 | Show/hide |
Query: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
+++ V A+ AL+RF F + L+ ERA +H + + +G+ SKS G G R ++V K + M T + TK + L +P
Subjt: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
Query: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIF------WRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
V N + P+ + ++F S T L + +K + S R LP+ Q+ I ++ ++VVLI GETG GKTTQ+PQ
Subjt: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIF------WRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
Query: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
FLLD + G C+I CTQPRR++A++V+ER++ ER E +G IGY+IRLES+ + + CTNG+LLR L+ + + +S +TH+I
Subjt: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
Query: VD
VD
Subjt: VD
|
|
| Q9H6S0 3'-5' RNA helicase YTHDC2 | 1.9e-35 | 32.78 | Show/hide |
Query: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
+++ V A+ AL+RF F + L+ ERA +H + + +G+ SKS G G R ++V K + M T + TK + L +P
Subjt: KLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK-----SKLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
Query: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIF------WRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
V N + P+ + ++F S T L + +K + S R LP+ Q+ I ++ ++VVLI GETG GKTTQ+PQ
Subjt: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIF------WRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQ
Query: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
FLLD + G C+I CTQPRR++A++V+ER++ ER E +G IGY+IRLES+ + + CTNG+LLR L+ + + +S +TH+I
Subjt: FLLDYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHII
Query: VD
VD
Subjt: VD
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06670.1 nuclear DEIH-boxhelicase | 9.4e-67 | 43.73 | Show/hide |
Query: KKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK--------------------------
KK +L G+ T+ L+ F + ++ + FE L+ ER ++H++CR MG+ SKS+G G++RR+S++K
Subjt: KKGVQKPKCKLNSNVGSAITQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYK--------------------------
Query: ----SKLQMET--------------------VKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDGE-----LGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGS
SK + ET V F + K VL DLF+ YPP DG+ LG T GN + KDD F +P MTK ++ V S
Subjt: ----SKLQMET--------------------VKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDGE-----LGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGS
Query: YT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLLDYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSD
+ LK + ++I E RSKLPIASF+D I S VES+QVVLI+GETGCGKTTQVPQ+LLD+MW K E CKI+CTQPRRISA+SVS+RIS+ERGE +G
Subjt: YT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLLDYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSD
Query: IGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
+GYK+RL+S+GGR SS+V CTNGILLRVLI +G+ + V D+THIIVD
Subjt: IGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| AT1G48650.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 1.1e-30 | 45.27 | Show/hide |
Query: KKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKG
K + R LP +D + + ++QVV++SGETGCGKTTQ+PQ++L + +G TC I+CTQPRRISA+SVSER++ ERGE +G +GYK+RLE
Subjt: KKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKG
Query: GRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
GR + ++ CT G+LLR L+ + +S K V TH++VD
Subjt: GRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| AT1G48650.2 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 1.1e-30 | 45.27 | Show/hide |
Query: KKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKG
K + R LP +D + + ++QVV++SGETGCGKTTQ+PQ++L + +G TC I+CTQPRRISA+SVSER++ ERGE +G +GYK+RLE
Subjt: KKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKG
Query: GRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
GR + ++ CT G+LLR L+ + +S K V TH++VD
Subjt: GRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| AT2G01130.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein | 1.6e-29 | 39.43 | Show/hide |
Query: IFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVS
I W+ S+ + + Y +V + + R+ LP + + + + +QV++ISGETGCGKTTQ+PQF+L + +G I+CTQPRRISA+S
Subjt: IFWRPSMTKEELTKKVGSYTLKNVANMKKISERSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL--DYMWGKGETCKIVCTQPRRISAVS
Query: VSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
VSER++YERGE +G +GYK+RLE GR + ++ CT GILLR L+ + + +TH+IVD
Subjt: VSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
| AT2G30800.1 helicase in vascular tissue and tapetum | 5.9e-77 | 52 | Show/hide |
Query: TQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKS---------------KLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
T+ ++ F + +EV+TFE +LS ER ++H++CRKMG+ SKSSG G+QRR+S++KS K +++ V F +L +LF+ YPP DG
Subjt: TQALQRFCLTHDEVFTFEADLSKRERALVHEVCRKMGMTSKSSGHGDQRRVSVYKS---------------KLQMETVKFSEKTKTVLDDLFSMYPPDDG
Query: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL
+ + + K + KDD F +P ++ EE+ +KV S + LK +K+I++ RSKLPI SF+D ITS VES+QV+LISGETGCGKTTQVPQ+LL
Subjt: ELGKETVGNHHKKADKPRRRKDDIFWRPSMTKEELTKKVGSYT--LKNVANMKKISE-RSKLPIASFQDVITSTVESHQVVLISGETGCGKTTQVPQFLL
Query: DYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
D+MW K ETCKIVCTQPRRISA+SVSERIS ERGE++G +IGYK+RL+SKGGRHSS+V CTNGILLRVL+ +G + VSD+THIIVD
Subjt: DYMW-GKGETCKIVCTQPRRISAVSVSERISYERGENVGSDIGYKIRLESKGGRHSSIVLCTNGILLRVLISEGLGKLTMEASRKSRKNVVSDLTHIIVD
|
|
